大学生物化学课件 最全的
法二:按R基极性分两类: 极性AA:11种 非极性AA:9种 法三: 1、中性AA(有极性与非极性15种) 2、酸性AA(2种):天冬氨酸、谷氨酸 3、碱性AA(3种):组、赖、精
4.理化性质
(1)、物理性质:无色晶体、有味(甜、鲜、苦) 或无味,不同强度溶于水、稀酸、稀碱,但不溶于 任何有机溶剂,酒精可使AA发生沉淀。 (2)、光学性质:具旋光性,有紫外吸收现象, 波长为280nm,但仅有酪氨酸、色氨酸、苯丙氨酸 有此性质。 除甘氨酸外,氨基酸均含有一个手性-碳原子, 因此都具有旋光性。比旋光度是氨基酸的重要物理 常数之一,是鉴别各种氨基酸的重要依据。
• 肽键的特点是氮原子上的孤对电子与羰基具有
•
明显的共轭作用。 组成肽键的原子处于同一平面。
2.肽链中AA的排列顺序和命名
Ser H H3N
+
O C N H
Val H C CH
O C N H
T yr H C CH2
O C N H
Asp H C CH2
O C N H
Gln H C COO
-
C CH2 OH
(2)DNA的二级结构 概念:DNA的二级结构是指DNA的双螺旋结构。
• DNA双螺旋结构
DNA分子由两条DNA单
链组成。
DNA的双螺旋结构是分
子中两条DNA单链之间基 团相互识别和作用的结 果。
双螺旋结构是DNA二级
结构的最基本形式。
.DNA双螺旋结构的特点
a.DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA 单链)组成。两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成 右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方向相反,即其 中一条链的方向为5′→3′,而另一条链的方向为 3′→5′。
4.蛋白质四级结构
蛋白质的四级结构(Quaternary Structure)是指由多 条各自具有一、二、三级结构的肽链通过非共价键 连接起来的结构形式;各个亚基在这些蛋白质中的 空间排列方式及亚基之间的相互作用关系。 这种蛋白质分子中,最小的单位通常称为亚基或亚 单位Subunit,它一般由一条肽链构成,无生理活 性; 维持亚基之间的化学键主要是疏水力。 由多个亚基聚集而成的蛋白质常常称为寡聚蛋白;
4.蛋白质的变性作用 天然蛋白质因受物理或化学因素的影响,分子构 象发生变化,致使蛋白质的理化性质和生物学功 能随之发生变化,但一级结构未遭破坏,这种现 象称为变性作用。 变性后的蛋白质称为变性蛋白。 导致蛋白质变性的因素:热、紫外光、激烈的搅 拌以及强酸和强碱等。 类型:不可逆变性、可逆变性(可复性)
糖与碱基之间的C-N键,称为C-N糖苷键
NH2 N N HOCH2 H H OH O H H OH 腺嘌呤核苷 N N N H2N N N HOCH2 O H H H OH H OH OH N HO HOCH2 H H OH O H H OH 胞嘧啶核苷 H OH N N HOCH2 H HO O H H OH 尿嘧啶核苷 NH2 N N OH
(3)、两性解离:等电点PI-AA分子所带的 净电荷为零(即分子内正电=负电)时溶液的 PH值。
COOH H3N
+
C H R
-H pK1 ' +H
+
+
COO H3N
+
-
C H R
-H pK2 ' +H
+
+
COO R
-
H2N C H
PH 1 净电荷 +1 正离子
7 0 两性离子 等电点PI
10 -1 负离子
O
鸟嘌呤guanine
O
NH2
NH
NH
N
N H O
N H
O
N H
O
尿嘧啶uracil
胞嘧啶cytosine 胸腺嘧啶thymine
(二) 核酸的分子结构
1.DNA的分子结构
(1)DNA的一级结构
概念:DNA的一级结构是指DNA分子中脱氧核苷酸的排列顺序。 不同的DNA分子(或片段)其一级结构不同,即脱氧核苷酸排 列顺序不同,也就是碱基排列顺序不同。 意义:遗传信息 基本结构单位:脱氧核糖核苷酸 连接键:3’,5’-磷酸二酯键 书写及阅读方向:从5端到3端
b.嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位 于螺旋外侧。碱基环平面与螺旋轴垂直,糖基环平面与碱基 环平面成90°角 C.螺旋横截面的直径约为2 nm,每条链相邻两个碱基平面之 间的距离为3.4 nm,每10个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩 (即螺旋旋转一圈)高度为34 nm。 d.两条DNA链相互结合以及形成双螺旋的力是链间的碱基对所 形成的氢键。碱基的相互结合具有严格的配对规律,即腺嘌 呤(A)与胸腺嘧啶(T)结合,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C) 结合,这种配对关系,称为碱基互补。A和T之间形成两个氢 键,G与C之间形成三个氢键。 在DNA分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。
鸟嘌呤核苷
2.组成核甘的戊糖
组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的糖为β-D2-脱氧核糖;RNA所含的糖则为β-D-核糖。
HOCH2 H H
O H
OH H
HOCH2 H H
O H
OH H
OH
OH
OH
H
D-核糖
D-2-脱氧核糖
3.组成核甘的碱基
NH2 N
O
N
N
NH
N H
N
N H
N
NH2
腺嘌呤Adenine
(二) 氨基酸
• 1.结构通式
COOH
• -氨基酸
不变部分 可变部分
H2N
C R
各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同。20种基本 氨基酸按R的极性可分为非极性氨基酸、极性性氨 基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸
2.氨基酸的性质
(1)、天然蛋白质仅有20种AA、均为- AA (2)、旋光性:+、-(除甘氨酸没有旋光性) (3)、构型:D-、L-(除甘氨酸,天然蛋白 质的AA均为L-AA)。
(六)蛋白质的生物学功能
(1)作为酶,蛋白质具有催化功能。 (2)作为结构成分,它规定和维持细胞的构造。 (3)作为代谢的调节者(激素或阻遏物),它能 协调和指导细胞内的化学过程。 (4)作为运输工具,它能在细胞内或者透过细胞 膜传递小分子或离子。 (5)作为抗体,它起着保护有机体,防御外物入 侵的作用。
(四)蛋白质的分子结构
1.蛋白质一级结构
蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组 成蛋白质的多肽链数目. 多肽链的氨基酸数目、种类和顺序。 以及多肽链内或链间二硫键的数目和位臵。 其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋 白质生物功能的基础。
2.蛋白质二级结构
蛋白质的二级(Secondary)结构是指多肽链的主链 在空间的排列,或规则的几何走向、旋转及折叠。 它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。 主要有-螺旋、-折叠、-转角。
(3)核酸的紫外吸收
在核酸分子中,由于 嘌呤碱和嘧啶碱具有 共轭双键体系,因而 具有独特的紫外线吸 收光谱,一般在 260nm左右有最大吸 收峰,可以作为核酸 及其组份定性和定量 测定的依据
(4)核酸的变性与复性
A. 核酸的变性
核酸的变性是指核酸双螺旋区的多聚核苷酸链间的 氢键断裂,变成单链结构的过程。变性核酸将失去 其部分或全部的生物活性。核酸的变性并不涉及磷 酸二酯键的断裂,所以它的一级结构(碱基顺序)保 持不变。 能够引起核酸变性的因素很多。温度升高、酸碱度 改变、甲醛和尿素等的存在均可引起核酸的变性。 RNA本身只有局部的双螺旋区,所以变性行为所引起 的性质变化没有DNA那样明显。
3.蛋白质三级结构
蛋白质的三级结构(Tertiary Structure)是指在 二级结构基础上,肽链的不同区段的侧链基团 相互作用在空间进一步盘绕、折叠形成的包括 主链和侧链构象在内的特征三维结构。 维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、 离子键和范德华力等。尤其是疏水键,在蛋白 质三级结构中起着重要作用。
(三)肽与肽键
一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基之间 失水形成的酰胺键称为肽键,所形成的化合物 称为肽。 由两个氨基酸组成的肽称为二肽,由多个氨基酸 组成的肽则称为多肽。组成多肽的氨基酸单元称 为氨基酸残基。
1.肽键(peptide bond):
0.127nm 键长=0.132nm 0.148nm
2.这是蛋白质特有的性质-------胶体。
由于蛋白质的分子量很大,它在水中能够形成 胶体溶液。蛋白质溶液具有胶体溶液的典型性 质,如丁达尔现象、布郎运动等。 由于胶体溶液中的蛋白质不能通过半透膜,因 此可以应用透析法将非蛋白的小分子杂质除去 3.蛋白质的沉淀作用 蛋白质胶体溶液的稳定性与它的分子量大小、所 带的电荷和水化作用有关。 改变溶液的条件,将影响蛋白质的溶解性质 在适当的条件下,蛋白质能够从溶液中沉淀出来。 蛋白质的沉淀分为可逆沉淀和不可逆沉淀。
(一) 核甘酸
核苷酸是核苷的磷酸酯。作为DNA或RNA结构单
元的核苷酸分别是5′-磷酸-脱氧核糖核苷和 5′-磷酸-核糖核苷。
O HO P OH OH OH 核糖核苷酸 OH2C O B HO O P OH OH 脱氧核糖核苷酸 OH2C O B
B=腺嘌呤,鸟嘌呤,胞嘧啶,尿嘧啶或胸腺密啶
1.核甘
生物化学
一 蛋白质的结构和生物学功能
(一)蛋白质的概述
蛋白质(protein)是最基本的生命物质之一。 1、元素组成:平均含N量约=16%(特征代表) 2、基本结构单位:氨基酸 3、大小:蛋白质是大分子化合物 4、空间结构:一级结构、二级结构、三级结构、 四级结构…… 5、重要性:数量多、种类多、功能多 6、蛋白质的合成:AA顺序的遗传编码