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药物靶标发现与筛选详解演示文稿
未转染受体
转染CSF受体
Science. 1998;281(5374):257-259
Granulocytic colony formation in response to SB 247464 in vitro.
一、基因靶标
2、基因芯片技术 (1)普通基因芯片 (2)ChIP-DSL (coupling ChIP with a DNA
selection and ligation strategy ),染色质免 疫沉淀/DNA选择连接技术
基因芯片(Gene Chip)通常指DNA芯片,其基本 原理是将指大量寡核苷酸分子固定于支持物上,然后 与标记的样品进行杂交,通过检测杂交信号的强弱进 而判断样品中靶分子的数量。基因芯片的概念现已泛 化到生物芯片(biochip)、微阵列(Microarray)、 DNA芯片(DNA chip),甚至蛋白芯片。
INH(异烟阱)-induced mRNA expression profiles monitored by microarray hybridization analysis.
用INH处理INH 敏感 的结核菌株(红:INH处 理的;绿:INH未处理的)
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
Luo et al., Stem Cells 2010
Zhang et al., J Neurosci 2010
一、基因靶标
4、检测报告基因
把靶基因表达的调控序列与编码某种酶活性的基因 相连转导入细胞内,通过简单地检测酶活性的变化, 就可以反映化合物对转录因子和基因表达的作用性 质和程度。这种能间接反映基因转录水平的编码某 种酶活性的基因称为报告基因。
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
The ChIP-DSL scheme
PNAS 2007; 104(2): 4852-4857
E2-induced gene expression and the biological relevance of direct ER target genes
用INH处理INH 耐药的结核菌株 用乙硫异烟胺处理INH 耐药的结核菌株
Temporal profile of INH-induced expression of selected genes.
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
Roles of INH-induced genes in the context of a proposed pathway for mycolic acid (结核环脂酸) biosynthesis.
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Immunohistochemical staining for TH and alpha-tubulin in the SN of an MPTP mice model
TH
alpha-tubulin
Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286; doi:10.1093/dnares/dsl016
药物靶标发现与筛选详解演 示文稿
(优选)药物靶标发现与筛 选
EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’端单 一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基 因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp 。EST 来源于一定环境 达水平。
Quantitative real-time RT-PCR of upregulated or downregulated genes randomly selected from the libraries of human normal SN (黑质)and PD's SN
Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286
Phosphorylation of signaling proteins in cells treated with SB 247464 or G-CSF.
Science. 1998; 281(5374):257-259
The murine G-CSF receptor confers responsiveness to SB 247464.
PNAS 2007; 104(2): 4852expression and the biological relevance of direct ER target genes
PNAS 2007; 104(2): 4852-4857
一、基因靶标
3、基因敲除(knock-out) 技术
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Cell death activity of differentially expressed genes in PD Upregulated genes
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Downregulated genes
Structure of SB 247464
Science. 1998;281(5374):257-259
Activity of G-CSF(粒细胞集落刺激因子) and SB 247464 in NFS60 cell luciferase assays
Science. 1998;281(5374):257-259
首先从样品组织中提取mRNA ,在逆转录酶的作用下用 oligo ( dT) 作为引物进行RT -PCR 合成cD片段根据载体多克隆位点设计引物进行 两端一次性自动化测序,这就是EST 序列的产生过程。
Identification of PD-related genes