RARβ2, CRBP1, SOCS-1, SOCS-3, ER
Galm, blood Review 2019
DNA的甲基化的检测
1. 甲基化芯片 2. 甲基化特异
性PCR 3. 亚硫酸氢盐
序列分析 4. 限制性酶切
扫描技术
表观遗传学与癌症的进展
正常上皮细胞
发育异常
原位癌
全基因组甲基化水平
癌症
转移癌 CpG岛甲基化水平 组蛋白修饰失平衡
III
II
n=99
n=61
n=179
n=139
10%CR，1%PR，16%CR，
36%HI ，
25%PR，21%
ORR 47%
HI ，ORR 62%
28.5% CR+PR
AZA 5-2-2：44% HI AZA 5-2-5：52% HI AZA 5： 57%HI
骨髓抑制，恶心， 呕吐
骨髓抑制，局部 反应，1-2级胃肠 不适
6/43(14%)
N/A
血清
CDKN2A(INK4A)
14/20(70%) 44/44(100%)
血浆
CDKN2A(INK4A)
21/58(36%) N/A
血清
CDH1、CDKN2A(INK4A) 、GSTP1、 45/54(83%) CDKN2B(INK4B)、DAPK1
30/30(100%)
血浆/血清 CDKN2A(INK4A)、CDKN2B(INK4B) 17/23(74%) 35/35(100%)
检测不同部位中DNA甲基化标志物
疾病 DNA来源
标志
敏感度 特异性
膀胱癌 乳腺癌
尿沉渣
CDH1(E-Cadherin)、DAPK1、 CDKN2A(INK4A) 、RARB(RAR-β)
20/22(91%)
乳腺导管内液 CCND2(CyclinD2)、RARB(RAR-β)、 17/19(89%)
CRp，1例PR， 善，骨髓和外
5例完全骨髓 周血中原始细
缓解
胞短暂下降
恶心，呕吐， 疲劳
恶心，呕吐， 疲劳，腹泻， 肿瘤溶解综合 征
QT延长，恶 心，呕吐，低 血钾
恶心，呕吐， 腹泻，中性粒 细胞减少，盲 肠炎，疲劳
中枢神经系统 毒性，感染， 疲劳，恶心， 呕吐
Kuendgen, Ann Hemaol 2019
标志
敏感度
特异性
膀胱癌
乳腺癌 结肠癌 胃癌 肝癌 肺癌
血浆 检测CDK血N2A浆(AR和F) 血清中DNA甲1基3/15化(87标%) 志N物/A
血清
CDKN2A(INK4A)
12/14(86%) 31/31(100%)
血浆
CDKN2A(INK4A)
5/35(14%)
N/A
血浆
CDKN2A(INK4A)
疗效
CR(19%) CRp(3%)
AML (n=49) MDS (n=4)
CR(22%) CRp(5%) 骨髓缓解(13%)
毒副作用
中枢神经系统 毒性
中枢神经系统 毒性
Maslak Blum
Gore
AZA 75 mg/m2 +PB 200 mg/kg
DAC 20 mg/m2 +VPA 15,20,25 mg/kg
肿瘤中异常的表观遗传学改变
肿瘤类型
结肠癌 乳腺癌 肺癌 神经胶质瘤 白血病 淋巴瘤 膀胱癌 肾癌 前列腺癌 食管癌 胃癌 肝癌
CpG岛高甲基化
+ + + + + + + + + + + +
表观遗传学改变
基因组低甲基化
+
miRNAs高甲基化 组蛋白修饰异常
+
+
+
+Leabharlann ++
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
血清
CDKN2A(INK4A) 、GSTP1 、DAPK1、 11/15(73%) N/A
(NSCLC) MGMT
血浆
CDKN2A(INK4A)
64/73(88%) N/A
前列腺癌 血浆/血清 GSTP1
12/16(75%) 22/22(100%)
Laird, Nature Review Cancer 2019
2.2. 应用筛选出的高甲基化状态的基因如ID4 基因，筛选靶向治疗药物
表观遗传学治疗在肿瘤治疗中应用
Vaissie`re Mutation Research 2019 :659
DNA甲基化在肿瘤治疗中应用
去甲基化药物可以逆转抑癌基因CpG岛甲基化， 恢复抑癌基因的功能。
去甲基化药物高度特异性的作用于甲基化的胞嘧 啶，并不引起正常细胞中基因表达的实质性改变。
例：MGMT甲基化变化可 作为神经胶质瘤患者替 莫唑胺治疗效果的评价 标准
预后
CpG岛超甲基化可作 为化疗、激素治疗 和靶向治疗疗效评 价的标准 例：MGMT甲基化变 化可作为神经胶质 瘤患者替莫唑胺治 疗效果的评价标准
Esteller, N Engl J Med 2019:358
甲基化检测的优点
取材方便：尿沉淀，血浆，痰，血液，等 检测的是DNA，稳定不易降解。 正常组织与肿瘤组织的甲基化有质区别，
而非量的区别，检测具有高度的特异性和 敏感性 抑癌基因的甲基化早于肿瘤的发生，适合 早期诊断。
DNA甲基化与肿瘤诊断及预后
肿瘤类型
AML MDS 非何杰金氏淋巴瘤
何杰金氏淋巴瘤 头颈癌
+
+
+
+
+
+
GRØNBÆ K，APMIS 2019：115
表观遗传学修饰在肿瘤诊断和治 疗中的应用
肿瘤
早期诊断
检测血清或组织液中 CpG岛的超甲基化
例：尿液中GSTP1的 甲基化可用于前列腺 癌的诊断
治疗
通过去甲基化或去乙酰 化转移酶抑制剂，间挨 计划CpG岛超甲基化可作 为化疗、激素治疗和靶 向治疗疗效评价的标准
DNA甲基化
胞嘧啶
DNA甲基转移酶
5-甲基胞嘧啶
S-腺苷甲硫氨酸
S-腺苷高半胱氨酸
正常人的甲基化状态
GRØNBÆ K，APMIS 2019：115
组蛋白乙酰化与去乙酰化
Kim，Epigenetic 2019:1
异常的表观遗传修饰会导致 肿瘤发生
Vaissie`re Mutation Research 659 (2019)
恶心，呕吐，骨 髓抑制，局部反 应，腹泻，疲劳
骨髓抑制
Kuendgen, Ann Hemaol 2019
HDACi治疗MDS及AML的临床试验
作者
Odenike
Byrd
Giles
Garcia
Gojo
抑制剂 临床试验
缩酚酸肽 II
缩酚酸肽 I
LBH589 I
SAHA I
MS-275 I
给药剂量
i.v.,18mg/m2/day i.v., 13 mg/kg/m2 i.v.,4.8-14mg/m2 Oral, 100-300 mg Oral, 4-10mg/m2
治疗范围
MDS，AML，CML AML，CML，MDS
肾细胞癌 结肠癌细胞株 结肠癌细胞株
皮肤T细胞淋巴瘤，多种实体瘤 多种实体瘤
皮肤T细胞淋巴瘤 多种肿瘤细胞株，MDS，AML
MDS 成神经瘤细胞 前列腺癌细胞株，多种实体瘤，淋巴恶性肿瘤
多种实体瘤
5-氮杂胞甙治疗MDS的临床试验
作者
给药剂量 临床试验 病例数 疗效
患者人数及 临床诊断
疗效
毒副作用
AML (n=18)
AML (n=10)
AML (n=13), MDS (n=1)
AML (n=31), MDS (n=3), CML (n=1)
AML (n=38)
2例骨髓原始 细胞清除
骨髓和外周血 中原始细胞短 暂下降
8例外周血中 原始细胞短暂 下降
1例CR，2例 7例血液学改
食管癌 胃癌 大肠癌 肝癌 乳腺癌 非小细胞肺癌 膀胱癌 前列腺癌
诊断标志(诊断率)
预后标志
p15INK4B (>70%)、SOCS1 (>50%)
p15INK4B (>50%)
DAPK (>80%) 、 SHP1 (～100%) 、 DBC1 (～ 100%)
SYK、BOB.1/ORF
LHX6(>60%)、RASSF1A(>80%) 、 DAPK(>70%) 、 RARβ(>70%)
5/16(31%) 21/63(33%)
26/26(100%) 30/31(97%)
Laird, Nature Review Cancer 2019
DNA甲基化与肿瘤诊断及预后
Mund, Epigenetic 2019:1
国内研究进展 解放军总医院于力教授研究团队
1. 应用限制性酶切扫描技术（ RLGS）技术筛 选出白血病细胞中高甲基化状态的基因， 如ID4基因登，用于急性白血病诊断、疗效 观察、预后判断、微小残留病检测等的有 力手段。已开发ZO-1基因启动子区DNA甲 基化检测试剂盒
毒副作用
GALGB 9221
75 mg/m2/day
III