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表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的应用培训课件
血清
CDH1、CDKN2A(INK4A) 、GSTP1、 45/54(83%) CDKN2B(INK4B)、DAPK1
30/30(100%)
血浆/血清 CDKN2A(INK4A)、CDKN2B(INK4B) 17/23(74%) 35/35(100%)
发生
抑癌基因 沉默
调控基因表达
原癌基因 活化
DNA甲基化
组蛋白修饰
表观遗传学修饰
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的 应用
8
异常的表观遗传修饰会导致肿 瘤发生
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的
应用
Galm,
blood
Review
29006:20
异常的表观遗传修饰会导致肿瘤 发生
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的
CpG岛高甲基化
+ + + + + + + + + + + +
表观遗传学改变
基因组低甲基化
+ + + + + +
miRNAs高甲基化 组蛋白修饰异常
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+
+ 表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的
应用
GRØNBÆ
K,APMIS
+
201407:115
表观遗传学修饰在肿瘤诊断和治 疗中的应用
DNA 损伤修复
O6MGMT, hMLH1, BRCA1, GSTπ
生长因子
RARβ2, CRBP1, SOCS-1, SOCS-3,
ER
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的 应用
Galm, blood Rev11iew 2005
DNA的甲基化的检测
1. 甲基化芯片
2. 甲基化特异 性PCR
3. 亚硫酸氢盐 序列分析
肿瘤
早期诊断
检测血清或组织液中 CpG岛的超甲基化
例:尿液中GSTP1的 甲基化可用于前列腺 癌的诊断
治疗
通过去甲基化或去乙酰 化转移酶抑制剂,间挨 计划CpG岛超甲基化可作 为化疗、激素治疗和靶 向治疗疗效评价的标准
例:MGMT甲基化变化可 作为神经胶质瘤患者替 莫唑胺治疗效果的评价 标准
预后
CpG岛超甲基化可作 为化疗、激素治疗 和靶向治疗疗效评 价的标准 例:MGMT甲基化变 化可作为神经胶质 瘤患者替莫唑胺治 疗效果的评价标准
表观遗传学修饰在肿瘤诊 疗和治疗中的应用
遗传学在肿瘤诊断和治 疗中的应用
Ph染色体
RT-PCR FISH 伊马替尼
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的 应用
2
表观遗传学
表观遗传学
在不改变基因序列的基础上,通过基因 修饰及蛋白质与蛋白质、DNA和其他分子 的相互作用而影响和调节基因的表达和功 能,这种影响是可遗传的,也是可逆的。
应V用aissie`re Mutation
Research
2008:61059
肿瘤细胞中常见异常甲基化导 致基因沉默
Pathway 细胞周期
Genes Rb, p14, p15, p16, p73
细胞侵润和黏附
E-cadherin, APC, TIMP-3, VHL
凋亡调节
DAP kinase 1, caspase 8, TMS-1
4. 限制性酶切 扫描技术
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的 应用
12
表观遗传学与癌症的进展
正常上皮细胞
发育异常
原位癌
全基因组甲基化水平
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的 应用
癌症 转移癌
CpG岛甲基化水平
13
组蛋白修饰失平衡
肿瘤中异常的表观遗传学改变
肿瘤类型
结肠癌 乳腺癌 肺癌 神经胶质瘤 白血病 淋巴瘤 膀胱癌 肾癌 前列腺癌 食管癌 胃癌 肝癌
GSTP1(>70%)、APC(>70%)、
GSTP1、APC
PTGS2(>70%表)观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的
应用
GRØNBÆ
K,APMIS
201707:115
检测血浆和血清中DNA甲基化标志物
疾病 DNA来源
标志
敏感度
特异性
膀胱癌
乳腺癌 结肠癌 胃癌 肝癌 肺癌
血浆 检测CDK血N2A浆(AR和F) 血清中DNA甲1基3/15化(87标%) 志N物/A
p15INK4B (>50%)
DAPK (>80%) 、 SHP1 (~100%) 、 DBC1 (~ 100%)
SYK、BOB.1/ORF
LHX6(>60%)、RASSF1A(>80%) 、 DAPK(>70%) 、 RARβ(>70%)
APC(>90%)、TIMP3(>50%)
p15INK4B、CDH1 p15INK4B、CDH1、HIC1 LMNA 、 MGMT
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的
应用Esteller, N
EnglJFra bibliotekMed
200185 :358
DNA甲基化与肿瘤诊断及预后
肿瘤类型
AML MDS 非何杰金氏淋巴瘤
何杰金氏淋巴瘤 头颈癌
食管癌 胃癌 大肠癌 肝癌 乳腺癌 非小细胞肺癌 膀胱癌 前列腺癌
诊断标志(诊断率)
预后标志
p15INK4B (>70%)、SOCS1 (>50%)
血清
CDKN2A(INK4A)
12/14(86%) 31/31(100%)
血浆
CDKN2A(INK4A)
5/35(14%)
N/A
血浆
CDKN2A(INK4A)
6/43(14%)
N/A
血清
CDKN2A(INK4A)
14/20(70%) 44/44(100%)
血浆
CDKN2A(INK4A)
21/58(36%) N/A
主要包括:基因组印记、DNA甲基化、组 蛋白修饰和RNA干扰等。
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的 应用
3
DNA甲基化
胞嘧啶
DNA甲基转移酶
5-甲基胞嘧啶
S-腺苷甲硫氨酸 表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的
应用
S-腺苷高半胱氨酸
4
正常人的甲基化状态
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的
应用
GRØNBÆ
RPRM、MGMT、MINT31 APC、TIMP3
CDH1(>50%) SST(>80%) p16INK4A(>50%)、RASSF1A(>80%) CDH1(>70%) 、RASSF1A(>80%) PCDH20 (>50%) RUNX3 (>70%)
CDH1 p16INK4A和p14ARF
CDH1 FHIT、PCDH20、TSLC1/IGSF4 CDH1、 FHIT、TIMP3
K,APMIS
25007:115
组蛋白乙酰化与去乙酰化
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的 应用
Kim,Epigenet6ic 2006:1
异常的表观遗传修饰会导致 肿瘤发生
表观遗传学修饰在肿瘤诊疗和治疗中的
应用Vaissie`re Mutation
Research
7
659
(2008)
异常的表观遗传修饰会导致肿瘤