白血病
感染性疾病
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环境性疾病
易受环境因素影响
序言：所有表型（疾病）都是遗传和环境共同作用的结果 3
单基因 遗传病
复杂疾 病
遗传模式清晰； 外显率高
遗传模式不清晰； 外显率低
基因检测：预测遗传因素对个人健康的影响
• 指导生活方式（运动、饮食等） • 规避诱发疾病的风险因素 • 指导用药（剂量、替换） • 进一步诊断、治疗、预防4/8/2020
一、基因检测报告的内容：1.商业化检测案例
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（1）23andMe在2013年初提供 的基因检测服务项目
• Carrier Status：48项遗传变异位点检测 • Drug Response：20项药物反应检测 • Disease Risk：119项疾病患病风险检测 • Traits：57项遗传特征检测
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二、基因检测报告的形成：1. 支撑报告的基础研究 14
检测报告中的注意 事项及免责声明
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二、基因检测报告的形成：1. 支撑报告的基础研究 15
（1）HGP（Human Genome Project，人类基因组计划） （2）International HapMap Project（国际人类基因组单体型图计划） （3）GWAS（Genome Wide Association Study，全基因组关联分析） （4）GRS （Genetic risk score，遗传风险评分）
复杂性状GWAS分析方法的原理是，借助于SNP分子遗传标记，进行总体 关联分析，在全基因组范围内选择遗传变异进行基因分型，比较异常和 对照组之间每个遗传变异及其频率的差异，统计分析每个变异与目标性 状之间的关联性大小，选出最相关的遗传变异进行验证，并根据验证结 果最终确认其与目标性状之间的相关性。
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一、基因检测报告的内容：2.检测结果示例
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（1）一脉基因的检测报告样例
说明： •参考碱基和基因型为正链； •SNPedia结论：红色、绿色、蓝色、灰色分别表示有害、 正常、有益突变和样品未覆盖； •SIFT：基于同源蛋白氨基酸保守性的预测； •Polyphen2：基于同源蛋白的三维结构预测； •MutationTaster预测：基于进化保守性、剪切位点改变 和mRNA水平的变化引起的蛋白质特征丢失等信息预测； •-(空数据值)：表示突变位点不在基因编码区。
Panel
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一、基因检测报告的内容：1.商业化检测案例
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（3）Pathway Genomics
目前提供的基因检测项 目
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一、基因检测报告的内容：2.检测结果示例
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（1）一脉基因的检测报告样例
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一、基因检测报告的内容：2.检测结果示例
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（1）一脉基因的检测报告样例
临床中：
• 外显率100%意味着所有携带某种遗传变 异的人最终都会罹患相应的疾病，常为 单基因遗传病，如Huntington病
• BRCA1基因变异的女性有85%将会最终发 展为乳腺癌，外显率为85%；男性外显率 则不到1%
孟德尔遗传病
易受遗传因素影响
Huntington病
Crohn病
复杂疾病
糖尿病
基因检测结果风险评估和 生物信息学 1
郑征 M. D. 青岛大学 生物化学与分子生物教研室
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序言：所有表型（疾病）都是遗传和环境共同作用的结果 2
外显率（ Penetrance）是指一定环境条
件下，群体中某一基因型（通常在杂合子状态下） 个体表现出相应表型的百分率。外显率为100% 时称完全外显（complete penetrance），低于 100%时则为不完全外显（incomplete penetrance）或外显不全。
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二、基因检测报告的形成：1. 支撑报告的基础研究 16
（1）Human Genome Project（人类基因组计划）
测定组成人类染色体（指单倍体）中所包含的30亿个 碱基对组成的核苷酸序列，绘制人类基因组图谱，辨 识其载有的基因及其序列，破译人类遗传信息。
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二、基因检测报告的形成：1. 支撑报告的基础研究 17
（2）International HapMap Project（国际人类基因组单体型图 计划）
HapMap是人类基因组中常见遗传多态位点的目录，它描述了这些 变异的形式、在DNA上存在的位置、在不同人群间的分布状况。不 同个体的碱基的差别是目前最常见的遗传多态现象，这些遗传上 的差别称为单核苷酸多态性或SNPs（发音为“snips”）。HapMap 通过识别在人类基因组中常见的大约一千万个SNPs的大多数，来 确定人类的大部分遗传多样性的分子基础。
SNPs也是进行基因定位的分子标记。比如说基因的改变会增加罹 患高血压的风险，研究者可以比较高血压患者和正常人的SNPs。 如果某一个SNP在高血压患者中很常见，就可以把这个SNP作为标 记来定位和识别与这一疾病相关的基因。
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二、基因检测报告的形成：1. 支撑报告的基础研究 18
（3）GWAS（Genome Wide Association Study，全基 因组关联分析）是指在全基因组层面上，开展多中心、 大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究，是通过对大 规模的群体DNA样本进行全基因组高密度遗传标记（如 SNP或CNV等）分型，从而寻找与复杂疾病相关的遗传因 素的研究方法，全面揭示疾病发生、发展与治疗相关的遗 传基因。
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一、基因检测报告的内容：1.商业化检测案例
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（2）华大医学目前提 供的基因检测项目
（卫计委评估公布的 第一批高通量测序技 术临床应用试点单位 之一）
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一、基因检测报告的内容：1.商业化检测案例

（2）华大医学目前提供 的单基因基因检测项目： 各种套组——Gene Test
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一、基因检测报告的内容：2.检测结果示例
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（2） Pathway Genomics的 检测报告样例
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一、基因检测报告的内容：2.检测结果示例
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（2） Pathway Genomics的检测报告样例
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一、基因检测报告的内容：2.检测结果示例
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（2） Pathway Genomics的 检测报告样例