评价遗传多样性的统计方法
1 评价动物遗传多样性的意义
目 2 动物遗传多样性的研究方法 录
3 评价动物遗传多样性的统计方法
一、评价动物遗传多样性的意义
1、评价动物遗传多样性的意义
第一、动物的遗传多样性大小是长期进化的产物， 是其生存适应和发展进化的前提。
遗传多样性越高或遗传变异越丰富，动物对环境变化 的适应能力就越强
2、评价动物遗传多样性的必要性
联合国发表的若干动物建少情况
2、评价动物遗传多样性的必要性
动物遗传资源的危机
重要解决手段----开展动物品种 的保存和开发利用
评价遗传多样性
二、动物遗传多样性的研究方法
1、遗传多样性检测方法
本质：揭示遗传物质的变异 方法：从形态学水平、细胞学（染色体）水
pi 2ii ij1 ij2 ijn / 2N
Pi：第i个等位基因的频率；i：纯合复等位基因；j1、j2……jn：与i
共显的第1到第n个等位基因。
1、群体内基因多样性
等位基因频率及其方差估计
Vp=P(1-P)/[2(n-1)] 注：P为基因频率，n为样本规模
2、遗传多样性研究方法
（3）RFLP（扩增片段长度多样性）
• 基于RFLP（限制性酶切片段多样性） 和PCR技 术发展起来的一种用来研究分类的技术.
2、遗传多样性研究方法
• RFLP原理
•
不同物种的DNA序列不同，那么用同种限制性内切酶
酶切会得到不同的片段，这些不同的片段中，有很多长度
也会有不同.通过同样两种限制性内切酶消化后，根据酶 切位点序列设计互补序列并额外添加一段特异性序列，用
例：沈见成等利用30 个微卫星DNA 标记对3 个江苏地方 鸡品种进行遗传多样性分析，结果3 个地方鸡品种的平均 杂合度为0.6507 ， 高于朱庆等利用10 个微卫星标记测得 的四川15 个地方乌骨鸡种的平均杂合度(0.6 140 )和王德 前等利用7 个微卫星标记测得的中国部分地方鸡种的平均 杂合度(0.5 124 ) ，说明了江苏的地方鸡种在总体水平上 的遗传变异程度要高一些，遗传多样性相对更丰富。
（2）差异显示PCR
• 可以用来研究同一个体不同生长时段和不同组织 （或分化结构）或者不同个体之间基因表达差异.
2、遗传多样性研究方法
差异显示PCR原理是 根据中心法则，每一个阅读框要表达必须先转录成
mRNA.那么在不同细胞内只要存在基因差异表达现象，肯 定就会存在不同的mRNA.我们可以提取细胞的mRNA，然 后将其反转录为cDNA，并以此来作为PCR模板,通过PCR就 可以显示并放大出mRNA的差异，从而找到差异表达的基因 .
1、评价遗传多样性的意义
第三、对遗传多样性的认识是动物各分支学科重 要的背景资料。
对遗传多样性的研究无疑有助于人们更清楚地认识动 物多样性的起源和进化，尤其能加深人们对微观进化 的认识，为动物的分类进化研究提供有益的资料，进 而为动物育种和遗传改良奠定基础。
2、评价动物遗传多样性的必要性
世界上动物遗传资源保存存在着两种倾向： ⑴在多数发达国家里，随着畜牧生产体系的 集约化，大量饲养的只是少数经济价值高的 品种和杂交种，品种数目迅速减少；⑵在一 些发展中国家，虽然有较丰富的遗传资源， 但由于保种不当和盲目引进外来品种杂交， 使原有的地方品种数量大大减少，这两种倾 向都导致世界性的动物遗传资源危机。
步进化的，而且不同物种间进化差异很大，它的碱基序列 同源性的程度决定生物之间的亲源关系远近，并可以以此 来作为分类依据划分物种. • ITS序列在核糖体大小亚基的rRNA之间，核糖体大小亚 基的rRNA序列非常保守，便于设计PCR过程所需的两端 特异性引物，进行典型的锚定PCR.
2、遗传多样性研究方法
1、群体内基因多样性
基因频率估计值的精确度
λ 为标准偏差; P 为实际基因频率; P^为P 的估计量;Vp 为基因频率估计误差。 通常可靠性要求按95.45%给定，即λ =2。
1、群体内基因多样性
基因频率估计值的可靠性β (相对偏差叫以0.5 为限)
1、群体内基因多样性
湖羊各座位基因频率值估计及其精确度和可靠性
3、群体间遗传一致性
遗传相似系数和遗传距离的另一种估算方法
1、群体内基因多样性
(1)等位基因频率和基因型频率的计算
基因型频率是指一个群体中某一性状的各种基因型之间的比率。 基因型频率=基因型个体数/测定群体总数 等位基因频率是指一个群体中某一基因对其等位基因的相对比率。它是
决定一个群体遗传组成的基本标志。
平、生理生化水平、逐渐发展到分子水平。 具体方法：传统的形态学、细胞学以及同工
酶和DNA 技术
2、遗传多样性研究方法
（1）PCR特异扩增ITS序列
• 目前鉴定物种和做分子分类研究的最主流的方法.
2、遗传多样性研究方法
• PCR特异扩增ITS序列的原理： • ITS序列是中度重复序列，广泛分布于基因组并且是同
1、群体内基因多样性
(2)群体杂合度（Heterozygosity，He）
一个群体的基因变异，通常可以用多态位点比例和每个位点的 平均杂合度来度量。平均杂合度是衡量群体内遗传变异的有效指标 。平均杂合度越大，群体内遗传变异程度越大。
群体内某一位点的平均杂合度：
h 为各位点的杂合度; H 为各位点的平均杂合度; r 为位点数; Pi 为第K 个位点第I个等位基因的频率。 这公式析，同时 还适用于血液蛋白质和同工酶多态性的研究。
T4连接酶补平，经过两次PCR扩增（预扩增和二次扩增 ），产物用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，银染色后用专门的
分析软件分析，根据条带分布差异的程度来划分物种间的
亲缘关系.
三、评价遗传多样性的统计方法
1、群体内基因多样性
等位基因频率 群体杂合度 多态信息含量 有效等位基因数
2、群体间基因多样性
基因分化系数GST 基因流
遗传变异的大小与其进化速率成正比 对遗传多样性的研究有助于探讨动物物种稀有或濒危
原因及过程
1、评价遗传多样性的意义
第二、遗传多样性是保护动物研究的核心之一
不了解种内遗传变异的大小、时空分布及其与环境条件 的关系，我们就无法采取科学有效的措施来保护人类赖 以生存的动物遗传资源基因，来挽救濒于绝灭的动物， 保护受到威胁的动物。