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pubmed检索教程


(2)医学主题词表(MeSH)
用规范词查找“肝肿瘤”的文献
文章A
著者用词: Liver cancer
规范主题词 MeSH: Liver neoplasms
文章B
著者用词: Liver tumor
规范主题词 MeSH: Liver neoplasms
词表中:liver cancer See liver neoplasms
进入 MeSH
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MeSH 注释界面
MeSH详细注释界面
MeSH词检索
例1:检索2009-2013年关于舌根癌治疗的文献。
课题分析:
舌根癌的不同表达形式(OR):
tongue base cancer、 cancer/carcinoma/tumor of tongue base、 cancer of the base of tongue…
Terms] OR ("liver"[All Fields] AND "neoplasms"[All
Fields]) OR "liver neoplasms"[All Fields] OR
("liver"[All Fll Fields]) OR
"liver cancer"[All Fields]
美国医学文献数据库
2013.4
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一、数据库概况
(一)编制单位:美国国立医学图书馆(NLM)
(二)收录学科内容:
主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文 献。
包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺 学、基础研究;临床、护理、公共卫生、卫生政策 发展或相关教育活动的内容。
Search History(检索历史): 检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。 可组配检索式,如:#1 OR #2,#1 AND child 点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。
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六、PubMed其他资源
1. Mesh Database(规范化医学主题词表)
1966 to prensent 的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和 摘要,每条记录标有: [PubMed-indexed for MEDLINE]
OldMEDLINE
1949-1965年间的MEDLINE数据,无MeSH字段和摘要,每 条记录标有: [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]
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PubMed数据库

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一、 PubMed简介
开发机构:
NCBI(美国国立生物技术信息中心)

任务:
利用计算机信息处理技术,建立分子生物学、生物化 学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关 先进方法的研究。
输入刊名检索发表在该刊上 的文献(限定出处字段SO)
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PubMed记录字段说明
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文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论 定稿版 校样版 输入日期 输入完成日2期019/9/14 电子出版日期
Ages
年龄限定
Search fields
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字段限定
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五、PubMed 高级检索
一个网页中集多种功能于一体
其他检索资源 基本检索
检索式编制
检索词索引
检索历史
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五、PubMed 高级检索
Search Builder(检索式编制): 检索框中只能输入检索词,不能输入检索式。 多个字段检索要分多次输入。
获 取 Swiss-port,PIR,PRF,PDB 等 蛋 白 质 序 列 , 从核酸序列翻译到蛋白质的序列;
获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据 及 大 分 子 模 式 ( MMDB ) 等 其 他 生 物 信 息 数 据库检索。
PubMed等文献数据。
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20 复旦大学图书馆文献检索教研室
电子出版日期 文献出版日期 数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称 文献相关注释 基金编号 基因符号 期编号 资助调研者 资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号
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期刊全称
促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。
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促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
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NCBI网站
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NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据
获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列;
[PubMed-as supplied by publisher],分为两类:
MEDLINE 收录,逐步转为In Process, Indexed状态。
Not MEDLINE:PubMed 收录,MEDLINE不收录,一
直标注[PubMed-as supplied by publisher]或[PubMed]
文献类型限定
Text availability 全文、免费全文、摘要限定
Publication dates 出版日期限定
Species
研究对象人/动物限定
Languages
语种限定
Sex
性别限定
Subjects
各主题领域限定
Journal categories 各种专题子数据库限定
治疗的不同表达形式(OR) :
therapy/treat/treatment, surgery, radiotherapy…
两个概念之间:舌根癌 AND 治疗 36 复旦大学图书馆文献检索教研室
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输入检索词, 查找规范词
未匹配到规范词
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(二) PubMed的特点
广域网免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取) 提供检索词智能转换匹配 界面简洁,操作简便(须IE7.0以上版本)
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(三) PubMed收录数据
MEDLINE Indexed
思考题:中国学者的名字该如何转换呢? 如: 闻玉梅 卢正宏
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三、PubMed 基本检索规则
刊名检索:全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如:Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
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三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入布尔逻辑运算式:(运算符须大写)如: asthma AND (therapy OR treatment)
字段限定符:[ ],空格按词组匹配
试比较:
stroke AND thrombolysis[ti]
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三、PubMed 基本检索规则
截词检索:treat* 可检出:treat, treated, treatment...
强迫短语检索:“ ”,不进行自动转换匹配和扩 展检索 如:“acute low back pain” “ang 1”(血管紧张素1缩写)检出1085篇 比较:ang 1 检出9956篇,误检多,其中有:
stroke thrombolysis[ti]
stroke[ti] AND thrombolysis[ti]
stroke[ti] thrombolysis[ti]
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三、PubMed 基本检索规则
著者检索:姓全称在前,名首字母在后,[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物
和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面
的研究内容。
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一、数据库概况
(三)文献来源:
70多个国家和地区;近5000种生物医学期刊
美国卫生研究院文献选择技术评估委员会 Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选
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二、PubMed的检索功能
高级检索 检索指南
基本检索输入框
检索工具: 特定文献检索
临床查询 专题查询
个人空间
其他资源: 规范词数据库
期刊数据库 临床试验等
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三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入一个或多个检索词(系统默认空格 为AND检索) 如:stroke thrombolysis(中风与溶栓)
作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式(纸张或电子) 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
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