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10 转座因子的遗传分析 南开大学遗传学课件
细菌转座子的发现和转座因子被公认
1951年McClintock提出生物基因组中存在转座因子学说,但未被当时持基因在 染色体上具有固定位置的主流观点同行接受 20世纪60年代继P. A. Jacob 和L. Monod之后J. Shapiro ①发现由转导噬菌体λdgal_引起的基因突变可恢复,但不能被核酸置换所回复, 因此不是一般的点突变和缺失造成的 ②运用密度梯度离心比较λdgal_和λdgal+, λdgal_比λdgal+密度大,并将两种 DNA变性和复性处理后进行电镜观察,发现双链分子中出现多余DNA环 由此证明λdgal_突变是因一段称为转座因子的插入序列(insertion sequence) 造成的
ATGGGATCTTT TACCCTAGAAA
IR
AAAGATCCCAT TTTCTAGGGTA
IR
转座子两侧DR形成机制(Tn3)
转座子及其特点
①自主转座 ②除转座相关的基因外还含有抗性及其他基因 ③分子较大,2~25 kb,一般两端有相同的IR
某些Tn的IR便是已知的IS,带有IS的Tn称为复合转 座子(composite transposon),如Tn5、Tn10和 Tn903 不含IS称为简单转座子,如Tn3 有些没有IS的体积庞大转座子称为TnA家族
例如TnA转座子家族,其结构中两端有38 bp的 反向重复序列(IS),中间有三个基因:编码β-内 酰胺酶的氨苄青霉素(ampicillin)抗性基因(ampr)、 转座酶基因(tnpA)和编码一种阻遏蛋白调节基因 (tnpR),tnpR的产物抑制tnpA和其自身基因的 表达
res为内部解离位点(resolvation site)
有转座和复制相关的A、B基因,gin编 码转化酶(invertase),催化IR DNA链 的反向弯曲
❖ 转座因子的发现与分类 ❖ 原核生物中的转座因子 ❖ 真核生物中的转座因子 ❖ 转座作用的分子机制
❖ 转座因子的遗传学效应及应用
真核生物中的转座因子
酵母菌基因组中的转座子 果蝇基因组中的转座子 玉米基因组中的转座子 人类基因组中的转座子
C (color)
决定红色和紫色的 发生
R (red)
红色,以A、C为先 决条件
Pr (purple)
紫色,以A、C、R 为先决条件
I (inhibitor) 抑制C基因的作用
McClintock利用经典遗传学和细胞遗传学方法,跟踪和结
合最新分子遗传学研究理论,将控制玉米糊粉层颜色的5对 基因与所观察的玉米胚乳颜色(紫、白、白底紫斑)表型及 染色体断裂进行综合分析后提出:
发现花斑及不稳定现象
➢1914年 Emerson在 研究玉米果皮色素遗传 过程中,发现一种花斑 果皮的突变类型。
发生多次回复突变,产 生宽窄不同、红白相间 的花斑。花斑的产生在 于基因的不稳定性
➢1938年 Rhoades研究玉米籽
粒糊粉层色素遗传时,发现有色籽粒 纯种自交后代表现出一种意外的孟德 尔修饰分离比(类似显性上位),由 两对不连锁的基因控制,A1/a1控制色 素,Dt/dt控制斑点 有色:斑点:白色=12:3:1
精神与态度
方法与技术、复合转座因子及反转录转 座因子
2.按转座机制分类:直接转座、复制转座和反转录转座 3.按转座功能自主性分类:自主和非自主型转座因子 4.按照分子性质分类:DNA转座和反转录转座子 (以某段DNA序列作为转座成分及以RNA介导转座区分)
A1A1 dtdt
双突变?
A1a1 Dtdt 自交
显性上位
PPrr × ppRR
紫色
红色
PpRr 紫色
9A1-Dt- 3a1a1 Dt- 1a1a1 dtdt 3A1- dt dt
P-R-或P-rr ppR- pprr 12紫色 3红色 1白色
产生斑点的一种可能是在体细胞中产生了回复突变a1→A1, 但大量的斑点需要很高频率的回复突变。Rhoades能在 a1a1Dt_(花斑)特殊无性生殖植物的花中找到相应的花药, 其花粉应携带回复突变产生色素的基因型,而他用这些花粉 与a1a1的植株测交,结果所有的后代完全是有颜色的。表明 在亲本中每个斑点实际上是回复突变的,a1也成为首次发现 的不稳定突变等位基因的例子,但 Rhoades仍未揭示这种不 稳定性的遗传机制
果蝇基因组中的转座子
P因子(P element):全长2907bp,两端有 31bp的反向重复序列,是P因子插入和切除必需的 元件;编码区包括四个外显子和三个内含子,编码 转座酶或转座阻遏蛋白
copia、412、279、Tip、FP等
杂种劣育
1977年M. G. Kidwell等首次证实黑腹果蝇的杂种劣育只出 现在特定的杂交组合中。黑腹果蝇中作为父方造成杂种劣 育的品系称为父方品系(Paternal strains),简称P品系; 与P品系杂交造成杂种劣育的品系称为母方品系 (Maternal strains),简称M品系。深入研究表明P因子 是导致杂种劣育的遗传因子。P因子基因转录物在体细胞 和生殖细胞拼接方式不同,分别产生转座阻遏蛋白和转座 酶。由于雌配子带有细胞质及从体细胞中合成的转座阻遏 蛋白,因此由P因子转座造成的劣育完全受杂交母本蝇是 否带有P基因影响,由无P基因母本蝇和带有P基因的父本 蝇杂交后代表现劣育
机制?
Rhoades Genetics 1938 23 377
玉米As-Ds转座系统的提出
➢1940~1950年 McClintock研究玉米花斑糊粉层和和植株 色素产生的遗传基础时,也发现了玉米籽粒上色素斑点的变 化。当时已知至少有5对控制玉米糊粉层颜色的基因:
A (anthocyan) 花色素,如突变则 不会产生色素
这就是著名的As-Ds转座系统
④Ds导致所存在的9号染色体发生断裂,产生无端粒的染
色体断裂融合桥(breakage-fusion-bridge)
⑤ 1951年McClintock提出转座(Transposition)和跳 跃基因(jumping gene)的新概念
转座模型
Ds可导致染色体断裂
花斑表型的形成
不同Tn家族转座子结构比较
转座噬菌体
1963年Taylor发现Mu噬菌体 (Mutator phage),为温和噬菌体, 基因组为38 kb线状DNA,可随 机整合到大肠杆菌基因组中,其 线性DNA末端带有宿主DNA一 小段序列,转座频率高于一般转 座子
Mu DNA右侧的3 kb序列(G区)两 端有34 bp反向重复序列(IR),两 端IR之间是两套反向编码基因, 通过DNA反向弯曲(倒转),一条 单链反向利用另一条单链的启动 子转录,同时抑制了互补链基因 的转录
至此,转座因子的概念才被遗传学界所公认!!
以后在细菌和其他生物中相继发现不同的转座因子
转座子存在的直接证据
λdgal+
λdgal—
分子杂交
转座因子:是基因组内一段相对独立的可移 动序列,它们不必借用噬菌体或质粒的形式 就可以从基因组的一个部位直接转移到另一 个部位,这个过程称为转座(transposition)。
P转座引起的果蝇劣育和突变
形成杂种劣育
不形成杂种劣育
玉米基因组中的转座子
Ac-Ds系统:
Ac因子(Activator)即激活因子,一种结构和功能都比较完 整的转座子,能自主转座 Ds因子(Dissociator)即解离因子,一种结构和功能都不完整的 转座子,不能自主转座。能在Ac因子的作用下在玉米基因组 内移动,它的存在会使染色体上该位置发生断裂的机会增加, 并由此改变邻近基因的表达 Ac存在,能解除Ds对色素基因C的抑制作用,使C基因表达, 颗粒出现色素斑点 Ac丢失,插入C基因的Ds趋于稳定,抑制了C基因的表达,玉 米颗粒呈无色
Ac和Ds 的结构
玉米Ac-Ds系统的作用模式
Ds
(a) Ac激活因子的位置不稳定,在无Ds转位因子时,C基因不受抑制,颗 粒呈深色
转座酶(transposase) 和解离酶(resolvase) 即拆分酶。
(2)非复制型转座
转座子序列通过 供体DNA与受 体DNA连接, 或直接被切割而 转移到受体 DNA上,直接 转移的方式只需 要转座酶
(3)保守型转座
转座元件从供体位点上切除并通过一 系列过程插入到靶位点,其所有碱基 均被保留。一般此类转座序列比较大, 并能将供体DNA一同转移,也称为附 加体(episome) 。多为复合转座因子, 除转座功能外还携带抗药性(或其它) 标记(marker) 两臂既可以相同方向,也可(大多数是) 相反方向排列。 保守型转座多属于非复制转座,有些 可兼备非复制或复制两种方式转座
①不稳定的“花斑”表型不是一般的基因突变造成的,而是 由于控制因子的存在所致
②决定红、紫色的C基因突变阻断花色素的合成,胚乳呈白 色;C基因突变回复致花斑产生
③ C基因的无色突变是由“可移动的遗传因子”即I抑制基 因(解离因子dissociator,Ds)插入造成的。另一个可移动 因子As(激活因子,activator)激活Ds进出C基因中,
插入序列(insertion sequence, IS) 转座子(transposon, Tn) Mu噬菌体(Mu phage)
插入序列(IS)
自主转座的简单结构,只有转座酶基因和两端反向重复 序列,一般自身没有任何表型,是一类最小的转座因子
末端反向重复序列 (Inverted repeats, IR)
❖ 转座因子的遗传学效应及应用
转座因子的发现与分类
转座因子的发现
转座因子(transposable element)
也称为跳跃基因( jumping gene)或可移动的遗传因 子( mobile genetic element),最早由Barbala McClintock发现。McClintock 是美国著名的遗传学家, 1944 当选美国国家科学院院士,1945成为美国遗传学 会主席。 1948年她首先确认和提出了复合转座子 的概 念,70年代后在大肠杆菌、酵母、果蝇、玉米等原核 和真核生物中不断发现有转位因子。因此, 35年后将 可动基因重大发现归功于她