真菌分类汇总Ainsworth & Alexopoulos 系统真菌界Fungi真菌门Eumycota（1.鞭毛菌亚门Mastigomycotina 2.接合菌亚门Zygomycotina 3.子囊菌亚门Ascomycotina 4.担子菌亚门Basidiomycotina 5.半知菌亚门Deuteromycotina）1. 鞭毛菌亚门Mastigomycotina壶菌纲Chytridiomycetes 游动孢子为单鞭毛，后生尾鞭壶菌目Chytridiales油壶菌科Olpidiaceae 绵壶菌科Achlyogetonaceae 集壶菌科Synchytriaceae 泡壶菌科Phlyctidiaceae 根壶菌科Rhizidiaceae 歧壶菌科Cladochytriaceae 节壶菌科Physodermataceae 壶菌科Chytridiaceae 大壶菌科Megachytriaceae肋壶菌目Harpochytriales肋壶菌科Harpochytriaceae芽枝菌目Blastocladiales雕蚀菌科Coelomomycetaceae 链枝菌科Catenariaceae 芽枝菌科Blastocladiaceae 单毛水霉目Monoblepharidales单毛水霉科Monoblepharidaceae 节水霉科Gonapodyaceae丝壶菌纲Hyphochytridiomycetes 游动孢子为单鞭毛，前生茸鞭丝壶菌目Hyphochytridiales异壶菌科Anisolpidiaceae 根前毛菌科Rhizidiomycetaceae丝壶菌科Hyphochytriaceae原质团菌纲Plasmodiophoromycetes原质团菌目Plasmodiophorales原质团菌科Plasmodiophoraceae卵菌纲Oomycetes 游动孢子为双鞭毛，前茸鞭，后尾鞭链壶菌目Lagenidiales拟油壶菌科Olpidiopsidaceae 链油壶菌科Sirolpidiaceae 链壶菌科Lagenidiaceae 水霉目Saprolegniales硅藻壶菌科Ectrogellaceae 海壶菌科Haliphthoraceae 破囊壶菌科Thraustochytriaceae 水霉科Saprolegniaceae 小细囊霉科Leptolegniellaceae水节霉目Leptomitales水节霉科Leptomitaceae 根壶菌科Rhipidiaceae霜霉目Peronosporales腐霉科Pythiaceae 白锈科Albuginaceae 霜霉科Peronosporaceae2. 接合菌亚门Zygomycotina接合菌纲Zygomycetes毛霉目Mucorales笄霉科Choanephoraceae 小克银汉霉科Cunninghamellaceae 双珠霉科Dimargaritaceae 内囊霉科Endogonaceae 卷头霉科Helicocephalidaceae 梳霉科Kickxellaceae 被孢霉科Mortierellaceae 毛霉科Mucoraceae 水玉霉科Pilobolaceae 头珠霉科Piptocephalidaceae 辐枝霉科Radiomycetaceae 瓶霉科Saksenaeaceae 共头霉科Syncephalastraceae 枝霉科Thamnidiaceae虫霉目Entomophthorales虫霉科Entomophthoraceae捕虫霉目Zoopagales捕虫霉科Zoopagaceae 旋体霉科Cochlonemaceae 毛菌纲Trichomycetes钩孢毛菌目Harpellales钩孢毛菌科Harpellaceae 侧孢毛菌科Genistellaceae 内孢毛菌目Asellariales内孢毛菌科Asellariaceae 外孢毛菌目Ecerinales裂丝毛菌科Palavasciaceae 附丝毛菌科Parataeniellaceae 外孢毛菌科Ecerinaceae 变形毛菌目Amoebidiales变形毛菌科Amoebidiaceae3. 子囊菌亚门Ascomycotina 半子囊菌纲Hemiascomycetes 无子囊果，子囊裸生内孢霉目Endomycetales浆霉科Ascoideaceae 酵母菌科Saccharomycetaceae 内孢霉科Endomycetaceae 蚀精霉科Spermophthoraceae原囊菌目Protomycetales原囊菌科Protomycetaceae 外囊菌目Taphrinales外囊菌科Taphrinaceae 不整子囊菌纲Plectomycetes 子囊果是闭囊壳，子囊无规律地散生在闭囊壳内，子囊孢子成熟后子囊壁消解散囊菌目Eurotiales暗膜菌科Amorphothecaceae 裸囊菌科Gymnoascaceae 红曲科Monascaceae 爪甲团囊菌科Onygenaceae 假散囊菌科Pseudeurotiaceae 嗜热囊菌科Thermoascaceae 发霉科Trichocomaceae 散囊菌科Eurotiaceae 黄丝菌科Cephalothecaceae 核菌纲Pyrenomycetes 子囊生在孔口有的子囊壳内，或有规律地排列在无孔口的闭囊壳基部形成子实层白粉菌目Erysiphales白粉菌科Erysiphaceae 小煤炱目Meliolales小煤炱科Meliolaceae 冠囊菌目Coronophorales冠囊菌科Coronophoraceae 球壳目Sphaeriales长喙壳科Ophiostomataceae 里孢壳科Melanosporaceae 球壳科Sphaeriaceae 肉座菌科Hypocreaceae 疔座菌科Polystigmataceae 棒囊菌科Coryneliaceae 粪壳科Sordariaceae 间座壳科Diaporthaceae 海壳科Halosphaeriaceae 蕉孢壳科Diatrypaceae 圆孔壳科Amphisphaeriaceae 炭角菌科Xylariaceae 疣衣菌科Verrucariaceae 麦角菌科Clavicipitaceae 疣孢壳科Hypomycetaceae 腔菌纲Loculoascomycetes 子囊果是子囊座，子囊是双层壁的多腔菌目Myriangiales酵孢腔菌科Atichiaceae多腔菌科Myriangiaceae格孢腔菌科Saccardiaceae毛生腔菌科Saccardinulaceae座囊菌目Dothideales毛盾壳科Trichothyriaceae 刺盾炱科Chaetothyriaceae 广口盾壳科Parodiopsidaceae 胶皿炱科Englerulaceae 假球壳科Pseudosphaeriaceae 煤炱科Capnodiaceae 座囊菌科Dothideaceae 小穴壳科Dothioraceae格孢腔菌目Pleosporales二孢炱科Dimeriaceae 黑星菌科Venturiaceae 饰孢腔菌科Mesnieraceae 葡萄座腔科Botryosphaeriaceae 扁孔腔菌科Lophiostomataceae 荚孢腔菌科Sporormiaceae 格孢腔菌科Pleosporaceae 圆孔腔菌科Mycoporaceae缝裂菌目Hysteriales缝裂菌科Hysteriaceae 星裂菌科Arthoniaceae 船裂菌科Opegraphaceae 小歪盘菌科Phyllipsiellaceae 胶皿菌科Patellariaceae 隔孢皿科Lecanactidaceae半球腔菌目Hemisphaeriales小盾壳科Microthyriaceae 拟小盾壳科Trichopellinaceae 隔孢盾壳科Munkiellaceae 星盾炱科Asterinaceae 管腔菌科Aulographaceae 厚圆盾壳科Brefeldiellaceae 多腔盾菌科Parmulariaceae 射盾菌科Stephanothocaceae 裂盾菌科Schizothyriaceae 细盾菌科Leptopeltidaceae 微盾菌科Micropeltidaceae虫囊菌纲Laboulbeniomycetes 子壳果是子囊壳，营养体简单，大多无菌丝体，不产生无性孢子，均为节肢动物的寄生菌虫囊菌目Laboulbeniales角霉科Ceratomycetaceae 虫囊菌科Laboulbeniaceae 多精虫囊菌科Peyritschiellaceae角盘纲Discomycetes 子囊果是子囊盘梭梭盘菌目Medeolariales梭梭盘菌科Medeolariaceae瘿果盘菌目Cyttariales瘿果盘菌科Cyttariaceae块菌目Tuberales大团囊菌科Elaphomycetaceae 地菇科Terfeziaceae 囊被菌科Geneaceae 块菌科Tuberaceae盘菌目Pezizales肉盘菌科Sarcosomataceae 肉杯菌科Sarcoscyphaceae 粪盘菌科Ascobolaceae 盘菌科Pezizaceae羊肚菌科Morchellaceae 马鞍菌科Helvellaceae 火丝菌科Pyronemataceae 星裂盘菌目Phacidiales斑痣盘菌科Rhytismataceae 鲜色盘菌科Cryptomycetaceae 星裂盘菌科Phacidiaceae厚顶盘菌目Ostropales点盘菌科Stictidaceae柔膜菌目Helotiales展盘菌科Ascocorticiaceae 贫盘菌科Hemiphacidiaceae 地舌菌科Geoglossaceae 核盘菌科Sclerotiniaceae 圆盘菌科Orbiliaceae 皮盘菌科Dermateaceae 晶杯菌科Hyaloscyphaceae 锤舌菌科Leotiaceae4.担子菌亚门Basidiomycotina(含冬抱菌纲、层菌纲和腹菌纲3纲) 担子菌中既有严重危害粮食作物和林木的病原菌，如黑菌粉、锈菌、木腐菌等，也有很多是著名食用菌，如蘑菇、口蘑、香菇、侧耳等，还有中国传统的贵重药材，如黑木耳、银耳、茯苓、灵芝等，有些大型菌类还含有抗癌物质冬抱菌纲Teliomycetes锈菌目Uredinales栅锈菌科Melampsoraceae 鞘锈菌科Coleosporaceae 柄锈菌科Pucciniaceae 黑粉菌目Ustilaginales黑粉菌科Ustilaginaceae 菰黑粉菌科Yeniaceae 腥黑粉菌科Tilletiaceae层菌纲Hymenomycetes银耳目Tremellales银耳科Tremellaceae 链担耳科Sirobasidiaceae 明目耳科Hyaloriaceae 木耳目Auriculariales木耳科Auriculariaceae 锤耳科Phleogonaceae隔担子菌目Septobasidiales隔担子菌科Septobasidiaceae外担子菌目Exobasidiales外担子菌科Exobasidiaceae座担子菌目Brachybasidiales座担子菌科Brachybasidiaceae花耳目Dacrymycetales花耳科Dacrymycetaceae胶膜菌目Tulasnellales胶膜菌科Tulasnellaceae 角担菌科Ceratobasidiaceae非褶菌目Aphyllophorales鸡油菌科Cantharellaceae 粉抱革菌科Coniophoraceae 伏革菌科Corticiaceae 钉菇科Gomphaceae 点革菌科Punctulariaceae 韧革菌科Stereaceae 革菌科Thelephoraceae 裂褶菌科Schizophyllaceae (担子果初为杯状后变为盘状，菌盖表生绒毛，与一狭窄的基部相连，子实层体为假菌褶，从基部辐射而出，假菌褶纵裂而向两边反卷。