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基因组学和蛋白质组学对新药研发的影响

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1、对检索课题“磷酸对草莓生长和开花的影响”检索中文信息。

提示:磷酸的化学物质名称是“Phosphonic acid ”普通商业名称是“ethephon”,2、基因组学和蛋白质组学对新药研发的影响3、红霉素衍生物的设计、合成与抗菌活性研究4、HPLC法测定复方谷氨酰胺肠溶胶囊中L-谷氨酰胺的释放度姓名:朱艳红班级: 11生科师范学号: 11223074学科教师:张来军基因组学和蛋白质组学对新药研发的影响琼州学院生物科学与技术学院 11生科师范2班朱艳红 11223074摘要20世纪末伴随着人类基因组计划的实施,相继产生了基因组学和蛋白质组学,基因组学和蛋白质组学的迅速发展,对药学科学产生着深远的影响。

文章在简介蛋白质组学基本概念、核心技术的基础上,综述了基因组学和蛋白质组学对新药研发带来的影响。

关键词:基因组学;蛋白质组学;药物研发The impact of genomics and proteomics on the research anddevelopment of innovative drugabstractWith the implementation of the 20th century,Genomics and proteomics had emerged one after the other. Driven by Soaring development of the omits,pharmaceutical industry presents a new vision,all human life faces a promising future. On the basis of proteomics Introduction to basic concepts, core technology, reviewed the genomics and proteomics research on the impact of new drugs.Keywords:Genomics; proteomics; drug development目录1引言 (4)2基因组学与蛋白质组学基本概念 (4)2.1基因组学 (4)2.2蛋白质组学 (4)2.3蛋白质组学与基因组学的关系 (5)3基因组学、蛋白质组学对新药研发的影响 (5)3.1药物靶标的发现与识别 (5)3.2药物靶标的确认 (6)3.3筛选和优化先导化合物 (6)3.3.1化学基因组学 (6)3.3.2结构基因组学 (6)3.4药物毒性基于作用机制的评估 (7)4优势与存在问题 (7)5展望 (8)参考文献 (8)1引言伴随着人类基因组计划的实施,基因组学和蛋白质组学于20世纪末相继产生。

蛋白质组学是后基因组时代的最重要研究课题,能够深化对生命现象本质的了解。

基因组学、蛋白质组学研究的迅速发展,对人类各方面都产生了深远影响,特别是给药学科学以极大的支持。

国内外各个研究机构和制药公司都认识到基因组学和蛋白质组学对新药研发的重要意义,纷纷斥巨资开展相关研究。

基因组学、蛋白质组学正逐步成为发现新的药物治疗靶标、鉴定先导物、论证药效、研究代谢规律及毒副作用的有效方法。

这些研究方法将极大地提高药物发现和药物研发的速度和效率,降低新药研发的成本。

虽然通过国际交流合作,我国已经建立一流的组学研究平台,但是与国外相比,组学衍生药物的产业化成果并不显著,组学研究在我国仍未完全突破学术壁垒。

如何借鉴国外成功模式,抓住技术更新的关键时期,加快我国组学衍生药物的产业化进程是当今面临的一个重要问题。

2基因组学与蛋白质组学基本概念2.1基因组学基因组(genome)是在1924年提出,用于描述生物全部基因和染色体组成的概念。

基因组学(genomics)在1986年由美国科学家Thomas Roderick提出,是指对所有基因进行基因组作图(包括遗传图谱、物理图谱和转录本图谱)、核苷酸序列分析、基因定位和基因功能分析,并且探索研究特定基因的生物学功能,揭示整套基因及其产物在疾病和健康状态下的作用方式的一门科学[1]。

基因组学含结构基因组学(structural genomics)、和功能基因组学(functionalgenomics)[2]。

前者研究基因的序列、结构和定位,后者研究基因的功能。

人类基因组计划(human genome project,HGP)于1990年10月1日正式实施[10]。

结构基因组学是基因组学最重要的组成部分,结构基因组测序代表基因组学研究的早期阶段,以建立生物体高分辨率遗传、物理和转录图谱为主,被誉为生命科学“阿波罗登月计划”的人类基因组计划(HGP)就属于这一研究范畴[4]。

经过基因作图、核苷酸序列分析来确定基因的组成和基因的定位。

结构基因组学研究技术主要有:用于核酸测序的微量化技术、高通量DNA测序仪法、单核昔酸测序法等[5]。

功能基因组学研究常被称为后基因组学(postgenomics)研究,是当今基因组学最活跃的研究领域功能基因组学是在基因组学前期研究成果,主要是在结构基因组学研究所获得的信息和产物的基础上,全面、系统地分析基因的功能,力图在基因组整体水平上对基因的活动规律(如生物学功能、基因表达和基因突变)进行阐述。

在不同的领域,出现了具有不同研究方向和研究特点的基因组学科,如环境基因组学、药物基因组学和营养基因组学。

功能基因组学的研究技术主要有:基因芯片、全基因组关联分析(GW AS)、基因敲除(Knockdown),差异显示反转录PCR、分子杂交、基因表达序列分析等[5]。

2.2蛋白质组学蛋白质组(proteome)一词于1994年由Marc Wilkins首次提出。

是指一个细胞、一个器宫或一种组织中表达的全套蛋白质[6],蛋白质组学(ProteomciS)则是在生命体或细胞的整体水平上研究蛋白质的表达和修饰状态,就是以蛋白质组为研究对象,从整体角度分析细胞内动态变化蛋白质的组成、差异表达修饰状态、定性鉴别、定量检测及相互作用,揭示疾病发生机理和蛋白质功能,并对它们与细胞生命活动规律进行研究的一门后基因组学时代的新兴学科[4]。

蛋白质组学核心技术手段有三个,即蛋白质分离技术、蛋白质鉴定技术和利用蛋白质信息学进行蛋白质结构、功能分析及预测[4]。

2.3蛋白质组学与基因组学的关系蛋白质组学的诞生实质上依赖于基因组测序计划的成功,蛋白质是基因转录和翻译的产物,因此从广义上说,蛋白质组学是功能基因组学研究的一个方面。

蛋白质作为生命活动的最终体现者,蛋白质组学的研究具有无可比拟的优势。

实际上,基因组学和蛋白质组学是分子生物学研究的不同层次,两者之间互相补充、互相促进。

显然,基因组学和蛋白质组学相互协调发展将为生物学家提供最好的帮助[1,7]。

3基因组学、蛋白质组学对新药研发的影响人类药物发现经历了从自然界发现药物,随机筛选发现药物,到以机制为基础和以靶结构为基础的新药发现和开发,这是一个从盲目发现药物到理性设计和筛选的过程,也是对发病机制、药物作用机理无知到逐渐认识的过程。

人类基因组计划的完成以及后续功能基因组学、结构基因组学和蛋白质组学研究的开展,深刻地改变了药物研发的策略,形成新药研究的新模式—从基因功能到药物。

这是人类药物发现史上一次突破性的革命,基因组学和蛋白质组学不仅大大增加了药物靶标的潜在数量,而且对制药工业开发创新药物的能力也产生了直接的影响[1,13]。

3.1药物靶标的发现与识别药物研究是一个不断推陈出新的过程,全球每年推出50种新药,每种新药都是针对某一靶点,即对药物起作用的机体微细部分,谓之药物靶标寻找与人类疾病相关的药物靶点是新药研发的第一个环节[8]。

人类基因组计划为揭示人类疾病机理提供了大量的基因信息,如与人类疾病相关的疾病基因及基因编码的相关蛋白信息,这些与疾病密切相关基因和蛋白都可以作为潜在的药物靶点,用于新药开发[3]。

药物靶标的研究可在两个层面进行:基因和蛋白质。

基因组学和蛋白质组学研究的开展,提供了丰富的基因和蛋白质结构、功能信息,如何将这些信息转换为有效的靶标是目前组学研究的主要挑战之一。

基因组决定潜在的基因或蛋白质的表达,但并不能反映细胞、组织或个体间特异性蛋白的表达、表达的丰度、翻译后修饰以及选择性剪切等信息。

这些信息的获得依赖蛋白质组学的研究。

通常采用2-DE分离和纯化不同状态下组织或细胞中的蛋白混合物并鉴定表达或修饰的蛋白质[1]。

然后利用质谱鉴定电泳凝胶中感兴趣的蛋白质斑点。

这种方法与RNA图谱相比,通量较低。

但是它能更为准确的确定潜在的蛋白质靶标或疾病相关的分子。

目前应用于新药靶点发现的技术有基因组学技术、蛋白质组学技术以及生物信息学技术[3]。

基因组学技术包含差异基因表达、表达序列标签等技术[3]3.2药物靶标的确认应用基因组学和蛋白质组学技术获得潜在的药物靶标。

这些靶标是否能够真正成为研发有效药物的工具还有待验证。

实际上,靶标确证,尤其是排除无效靶标是药物发现过程中早期十分关键的步骤。

目前,几乎取得共识的是,作为药物靶标的基因或蛋白质必须在病变细胞或组织中表达,并且在细胞培养体系中,可以通过调节靶标活性改善相关表现,最终这些效应必须在疾病动物模型中再现。

最后,在证明药物在人体内有效之前,并不能真正确证药物靶标的价值。

此外在确认靶标的同时还可实现对药物先导物初期的筛选,这一过程资源密集并且成功率较低。

药物靶标的发现对创新药物的研究具有决定性的意义,目前已有许多新技术新方法可加快这一阶段的研究,如生物信息学、芯片技术、细胞筛选技术、结构基因组学以及蛋白质组学技术等等[8]。

其中细胞筛选技术是人类基因功能研究的枢纽,其他技术获得的药物靶标必须通过细胞筛选技术的鉴定和验证才能用于动物体内实验以及后续开发[1]。

3.3筛选和优化先导化合物在先导物优化中应用创新技术控制进入后续研究阶段候选药物的质量,可以达到缩短整个开发时间的目的。

基因组学和蛋白质组学技术除能够促进药物靶标的发现外,还有助于先导化[1,8,9]。

合物筛选模型的建立。

在基因组学和蛋白质组学发展的这十几年中,药物筛选已经有了很大的发展,主要包含以下几个层次:①计算机虚拟筛选和计算机辅助设计;②利用基因芯片和蛋白质芯片建立分子水平的药物筛选模型;③利用离体培养细胞株、转基因细胞株进行细胞水平上的药物筛选;④转基因和基因敲除动物筛选模型;⑤人体临床筛选。

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