马(Horse)
鸡（Chicken） 人(Humans) 小鼠(Mouse) 鼠（Rat） 狗（Dog） 鹿（Deer）
2n 64
2n 78 2n 46 2n 40 2n 42 2n 78 2n 68
240
1727
200
800
10/20*
191
19/25*
51
936/679*
3800 95
26470 9000 210 230 200 66
家禽个体肉质性能测定
前期研究进展

利用分子标记研究：

地方鸡种遗传变异及遗传
多样性研究

标记与产蛋性能及蛋品质
等相关研究

标记与生长发育及料肉比
等相关研究
研究表明：

各分子标记星座位上各等位基因的基因频率在不 同的群体间有比较明显的差异，出现一些特定的 等位基因。

不同分子标记座位所反映的群体杂合度具有较大 的差异，具有较大选育潜力。
几种重要畜禽种和人类及家鼠基因组有关数据
种 牛(Cattle) 绵羊(Sheep) 山羊(Goat) 猪(Pig) 染色体数 2n 60 2n 54 2n 60 2n 38 连锁图上的遗传 标记总数 2100 1040 337 1800 微卫星标 记数 1500 895 307 1400 物理图上 基因数 608 105 202 400 19 连锁群数 31 27 基因组大小(cM) 2900 3400 2740 2200 覆盖比例 (%) >95 >95 88 >95
现代分子生物技术 在优质肉鸡育种中的应用
朱
（四川农业大学
庆
教授、博导）
常规育种技术
外 观
表 现 型
生长发育 产蛋性能
数量遗传分析
本身成绩
同胞成绩
后裔成绩
纯繁
杂交
新品种选育
分子生物技术
分子标记
基 因 型
基因定位 性状连锁 辅助选择
分子标记辅助育种
分子遗传标记－DNA标记
特 点：• 数量大 • 遗来自稳定，不受环境影响 • 呈等显性或完全显性 标 记：
•标记性状相关分析：
分子标记
（标记基因座分析 ）
基因型
（最小二乘分析）
性状
（方差分析检验）
相关分析
•功能基因定位克隆：
确定基因在染色体上的大致位置 （家系连锁分析资料） 获得目的基因DNA片段 突变检测验证和功能分析 （染色体步移等技术） 绘制染色体图谱
（筛选目的基因）
确定含有候选基因的染色体片段

蛋用性状： 开产日龄、开产蛋重、开产体重、300日龄产 蛋量，月产蛋量、蛋品质性状等
分子标记PCR产物检测（自动序列分析）
建立资源群体
性状组合、配合力测定
常规育种方法 分子生物技术
特色突出、性能优良
形成配套新品系、建立商业育种体系
RFLP, RAPD, VNTR, AFLP, mtDNA 等
标记辅助选择的意义

可直接选择基因型

呈等显性，可将杂合子与纯合子区分

可在两种性别任何年龄的个体检测

早期选择，加快选育进展

可阐明家系内遗传变异

对限性性状和年龄限性性状最为有利
标记辅助育种原理
家禽经济性状－数量性状
分子标记
数量性状基因座
10487 1300
21 21 41
1450 2000
100 100
164
34
家 禽 染 色 体 标 记 图 谱
举例说明
—— 优质鸡肉质性状选育
根据研究报道，从家禽基因组中选取与肉质性状相关的标记
根据标记序列进行引物设计 采集血样进行PCR扩增
利用标记进行性状选择
肉质功能基因QTL定位
对PCR产物进行电泳检测 标记与性状相关分析
（QTL）
基因定位 QTL图谱分析
遗传图谱构建
技术路线：
寻找QTL的染色体片断
标记辅助选择
特定基因的功能位点
标定QTL位置
与性状相关的特定基因
找到与QTL连锁的标记
寻找候选基因
• 微卫星检测：
Southern杂交 利用载体基因阳性克隆作序列分析
选择引物
微卫星DNA探针（CA）n
PAGE检测
PCR扩增

四川不同地方鸡种群有较大遗传差异，表现出不 同的遗传距离。
四川不同鸡种群遗传聚类分析
HF
0.2897 0.2897
BF
0.8700
CK
1.1822 0.7135
LK
SH
0.4462
SC
0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
1.2
图1
不同鸡种群聚类模式图（数字表示相对遗传距离）
与性状相关的分子标记

肉用性状： 体重、日增重、相对－绝对增重、屠宰性能、 料肉比等