第一話逆転の標的・前編进入游戏后发生剧情：在这和平的一天，亚洲的小国——西凤民国的总统来到了日本的ひょうたん湖，在对帮助西凤民国解决犯罪组织的检察官们进行感谢后，总统正想发布对犯罪分子们的宣言，但是很可惜，他的话还没说完，枪声就响了起来……在这本应很和平的一天，总统被枪击，伤势不明，人们呼唤御剑怜侍！只有他，才能解决这次的案件！之后自动得到资料：◆证物资料追加：【新聞記事】◆人物资料追加：【糸鋸圭介】、【王帝君】◆逻辑情报追加：【大統領への発砲】之后进入自动活动的部分。
－调查－◆与演讲台右上角的黑衣人说话└◆逻辑情报追加：【演説中の警備】－逻辑－（将游戏中有关联性的情报进行整合、得到新情报的系统，按L键进入）◆将情报【大統領への発砲】和【演説中の警備】进行整合（X键），得到新情报【大統領暗殺事件】之后正式的调查开始啦~！···············搜查开始···············－调查－◆调查演讲台右方船头处的红色物体（实际上是个破掉的气球）├◆调查水中的大将军像（大将军又出现了……），得到情报【割れたバルーン】，得到证物【トノサマンバルーン】└◆调查西凤民国国旗，然后点击国旗上的洞，得到情报【弾痕のある国旗】这时，御剑提醒说先整理一下情报比较好。
好吧~进入“逻辑”模式吧！－逻辑－◆将情报【割れたバルーン】和【弾痕のある国旗】进行整合，御剑意识到，打出的子弹数是这个案子的一个关键···············搜查终了···············搜查结束之后，一直在观众席中吵吵嚷嚷的那个小姑娘又开始冲着御剑大叫，御剑终于决定要听取一下她关于子弹数目的证词。
但是当御剑向她提问时，她竟然拒绝提供情报！说什么情报就是生命，你不给我情报我就不给你情报什么的（有没有觉得这台词很耳熟？）……之后，进入棋盘模式，用这个模式从死不开口的对方那里套的情报吧！－逻辑象棋（ロジックチェス）－（这是这款游戏的新系统了，用来套问对方证词的一个系统，主要注意下屏下方的时间槽）◆选择【あなたの素性は…？】↓◆选择【まだ様子を見る】↓◆选择【記事を書く仕事なのか？】↓◆选择【現場を目撃した？】↓◆选择【まだ様子を見る】↓◆选择【銃声を聞いたのだな？】↓◆选择【取材内容とは？】↓◆选择【記事を書くための資料があるはずだ！】↓◆选择【まだ様子を見る】↓◆选择【録音したテープを聞かせるのだ！】－逻辑象棋成功－◆追加人物情报【速水ミキコ】，得到证物【速水の録音テープ】通过听录音，我们终于知道，犯人一共发射了两发子弹。
那么犯人到底在哪里发射的子弹呢？◆点击左侧的观众席，得到证物【弾丸の軌跡】···············搜查开始···············－调查－◆调查垃圾箱，发现了一个包包，然后进入物品调查的模式├◆调查包包的搭扣，可以打开包包。
得到证物【警備プランの資料】，得到情报【6連発の拳銃】├◆调查枪的瞄准镜，得到情报【レーザーポンタ】└◆调查弹膛，得到证物【拳銃】◆与下方那个摄影师对话，但不知为什么他很混乱没法好好谈话，等会再来找他吧◆与速水对话，问完所有条目◆再次与摄影师对话，然后发生剧情，我们的小美女一条美云来啦~！没想到美云竟然拍下了总统被枪击的瞬间的照片！而且御剑在这张照片中发现了矛盾。
◆点击总统的额头的红点└◆点击证物【新聞記事】，得到情报【赤いホクロ】，得到证物【美雲の写真】－逻辑－◆将情报【レーザーポンタ】和【赤いホクロ】进行整合后，证物【拳銃】更新为【凶器の拳銃】◆然后会发生一点剧情，美云又拿出了几张照片，证物【美雲の写真】被更新↓◆选择【事件の直前】↓◆然后我们可以看到一个穿着红色连帽装的人，他前面的人背上有红色射线，点击那个射线↓◆选择【事件の直後】↓◆在混杂的人群中，有唯一一个穿着红色衣服的人，点击他－继续调查－◆调查右方的小摊├◆调查地上的红点，得到情报【赤いボタン】├◆调查摊子下面的红色物体，得到证物【赤いレンコート】└◆调查那只反着的袖子，得到情报【レンコートのソデ】－逻辑－◆将情报【赤いボタン】和【レンコートのソデ】进行整合然后会进入对雨衣的调查画面。
◆点击雨衣的拉链部分，会把雨衣盖着的那一面翻开└◆点击红色的地方，证物【赤いレンコート】被更新···············搜查终了···············通过调查，御剑判断，暗杀者肯定是一个左手腕受伤的人，并且现在就混在人群里，于是他派糸锯警官对现场的人进行调查。
糸锯警官不负众望，真的找到了这么一个人物，然后将其带到了御剑面前。
之后会跳出听不听对决说明的选项。
这里的对决就是那个质问的系统，玩过逆转的玩家对这个应该都很熟悉了，听不听看各位各自的情况。
然后就会进入田中的证言部分，并自动追加新人物资料【田中太郎】。
～田中の証言～◆对第二句“でも、持ち主が…”出示证物【赤いレンコート】～田中の証言②～◆威慑第三句“ボデゖガードが突然…”，会追加新证言“ステージ左側の方が…”◆对新证言“ステージ左側の方が…”出示证物【警備プランの資料】虽然感觉好像已经从那个叫田中的男人口中问出了什么，但是对于现在的御剑来说，证据还是不够充分，在田中紧密的辩解之下，御剑竟然没了话说。
这之后，田中竟然说，还有一个和他一样穿红雨衣的人存在。
并且田中很清楚的指出，在场的另一名检察官——亚内，在总统演讲时，就在那个暗杀者的正前方！而且田中还说，在美云的照片中，有一个非常明显的矛盾，一个御剑还没有发现的矛盾。
下面，就需要我们利用手中的证物，指出这个矛盾到底是什么。
◆指证证物【速水の録音テープ】◆指证人物【速水ミキコ】（对哎，豆豆也才刚想起来，速水明明说是自己站在亚内的身后的，为什么亚内身后的会是暗杀者呢……）没想到会发展成这个局面，只好开始对速水进行询问了。
～速水の証言～◆对第三句证言“ウチが、そこ離れた時…”出示证物【美雲の写真】↓◆点击总统↓◆选择【田中太郎のもの】没想到，速水竟然在此被逼问的无路可退，却又不肯脱下外套来证明自己的清白。
正在僵持之际，突然出现了一个男人——总统的保镖内藤马乃介。
他给我们带来了一好一坏两条消息，好消息是总统没事，没什么大伤；而坏消息则是，那个“外城涯”为了保护总统而死掉了。
在说完这两条消息之后，他竟然说还有第三条消息，那就是：这次的调查，将由西凤民国的警察进行，而御剑并没有搜查权……因为可能会引起国际问题，御剑一时也无话可说。
但他觉得，如果就这样将搜查权叫出去，将会与真相失之交臂。
而速水也在一旁用颤抖的声音，一直请求他的帮助，试图让他相信自己的清白。
在御剑不知该怎么办才好时，令人震惊的一幕出现了：田中用他没受伤的右手，将刀子抵上了内藤的脖子。
这时，田中的真正身份才大白于大家面前，原来他竟然是个职业杀手！真名是“虎狼死家左左右卫门”（玩过逆转的玩家应该记得虎狼死家这个名字的，在某个事件中被雇佣的杀手，伪装为管家）。
田中说，是他接到了杀死总统的委托，所以才前来刺杀的。
但他却又做出了令人费解的要求，那就是要求将搜查权返还给御剑。
他自己解释说，是想弄清楚老熟人外城真正的死因。
一片混乱中，御剑虽然不明白田中的真正目的到底是什么，但还是同意了搜查权的交接。
只是他偷偷的交代糸锯说，为了不让田中跑掉，一定要好好的将总统专用的飞机包围起来。
◆自动追加人物资料：【内藤馬乃介】、【外城涯】◆人物资料【田中太郎】更新为【虎狼死家左々右エ門】待续第一話逆転の標的・後編之后，御剑他们终于进入了总统专用机。
进去之后，却只看到了外城的尸体，而没有见到总统。
没办法，在糸锯做好警队的准备之前，老老实实的进行调查吧。
···············搜查开始···············－调查－◆调查地上的尸体。
├◆调查尸体身上的弹孔，得到情报【貫通した弾丸】，得到证物【死体の所見メモ】├◆调查尸体身旁的公文包，得到证物【防弾ゕタッシュケース】└◆调查外城手中的枪，得到情报【外城の拳銃】◆调查门旁的监视器└◆调查第二行左边的那个监视器，得到证物【監視カメラのモニター】◆调查房间右方的桌子├◆调查桌上的背心，得到情报【防弾チョッキ】└◆调查桌子上的文件，进入推理├◆点击图上左边的象棋，然后点击推理└◆指证证物【警備プランの資料】。
证物【警備プランの資料】被更新，得到情报【内藤の立ち位置】－逻辑－◆将情报【6連発の拳銃】和【外城の拳銃】进行整合，证物资料【凶器の拳銃】被更新◆将情报【防弾チョッキ】和【貫通した弾丸】进行整合，得到证物【大統領の防弾チョッキ】在进行了调查之后，杀手田中要求总统作为证人出来进行证言。
内藤当然不会同意总统出现在这个抱着刺杀目的的杀手面前，御剑心里也是愈发焦急的等待糸锯警官的到来。
突然间，电灯熄灭了，屋内一片混乱。
在这混乱之中，田中打晕了大家，然后偷走应急小艇逃脱了。
在晕倒的御剑身边，他留下了证明他身份的海螺卡片。