札幌病毒的病原学研究进展Research progress on Sapporo virus pathogen摘要:札幌病毒也被称为札如病毒,是一种正链单股RNA 病毒。
它可被分为七个基因型组,其中GI、GII、GIV、GV型主要感染人。
我国相对于其他已感染国家如日本、泰国等,其札幌病毒阳性率较低。
此外,目前札幌病毒可以通过ELISA,RT-PCR技术检测出来,其中以PCR技术应用较为广泛。
因为对于札幌病毒的致病机理还不了解,现阶段并没有有效地疫苗可供使用,全世界也暂时没有建立札幌病毒的监测与预警系统。
Abstract:Sapporo virus also called sapovirus, is a chain of single strand RNAviruses. it can be divided into seven groups of genotype, and GI,GII,GIV,GV mainly infects people.Our relative to other infected countries such as Japan,Thailand,the positive rate of the lower Sapporo virus.In addition,the current Sapporo virus through ELISA,RT-PCR technology is detected,the application of PCR technology is more widely.There is no effective vaccine is available, because of the pathogenic mechanism for Sapporo virus is not known at the present stage, the whole world has no monitoring and early warning system for the establishment of Sapporo virus.关键词:札幌病毒;RT-PCR;诊断;流行病学;Key Word: Sapporo Viruses;RT-PCR;Diagnosis;Epidemiology札幌病毒(也称札如病毒,Sapporo-like Viruses,SLV)归属于嵌杯病毒科札幌样病毒属,最初于1977年在日本札幌通过电镜进行检测被发现。
与诺沃客病毒类似,均属于人类杯状病毒(Human Caliciviridae,HuCV),是非细菌性急性胃肠炎的主要病原体之一,可感染人和动物引发肠胃炎[1-3]。
1、病原学特征它是一种正链单股RNA 病毒,无囊膜。
典型的病毒粒子直径41nm~46nm, 而且有10 个或以下纤突在病毒的衣壳上[4]。
电镜下可以看见杯状病毒的典型形态。
基于衣壳蛋白的基因序列,将札幌病毒分为7个基因型(GI-GVII),其中,GI、GII、GIV和GV型病毒主要感染人,其余的主要感染动物。
此外也有一些文献上将基因型共分为五类,感染人的基因性大致不变,感染动物的基因型则增多了。
其基因组为7.3-8.3kb,有2-3个开放阅读框(ORFs),一个较长的开放阅读框编码一个58000-62000的结构蛋白(衣壳蛋白)和非结构蛋白(RNA依赖的RNA多聚酶),非结构蛋白与结构蛋白的编码区之间存在融合,结构蛋白的基因序列与非结构蛋白的基因序列相比保守型较差。
至少有56%以上的氨基酸序列不同。
并且其衣壳蛋白被分为三个不同区域:区域Ⅰ高度保守,包括大量氨基酸系列;区域Ⅱ变异性很高,这个区域包含能被单克隆抗体识别的多血清特异决定位点[5-6]。
区域Ⅲ以碳为终点,有保守性但是范围没有区域Ⅰ广,此区域也保留了一些氨基酸残基和抗原决定簇,但是往往也表现出一些可变性。
ORF2编码衣壳蛋白和一种小结构蛋白,ORF3只存在于GI、GIV、GV三种类型中,与衣壳蛋白的5’末端的基因区域冗余,形成一个不同的开放阅读框,编码一个小的碱性蛋白,可能与病毒的有效复制有关[3]。
ORF3的核苷酸与编码衣壳蛋白的核苷酸相重叠。
札幌病毒的基因结构保守区位于 RNA 聚合酶区或聚合酶和衣壳的连接处[7-8]。
2007年,Hansman发现了札幌病毒重组毒株:Mc12,C12,重组病毒株在环境中稳定并能传播,重组位点在ORF1 区的聚合酶和衣壳的连接处[9-10]。
2、流行病学特征札幌病毒在世界范围内均有分布,有地域性,如美国、英国、法国、荷兰、日本、澳大利亚和泰国等,不同地区的札幌病毒基因型不相同,因为病毒呈现出复杂的遗传多样性,但几乎都可检测到重组病毒[11]。
札幌病毒没有明显的季节性,因为札幌病毒感染多发于冬季,但其它季节也有发生。
此外一些猪札幌病毒与人札幌病毒特别相似,使得人们不禁开始担心相同基因型的病毒是否可以在不同物种间感染传播。
2.1 传染源患病的人和动物、隐性感染者及健康携带者。
患者病后3-4d排出病毒,患者的吐泄物污染食物和水源常引起暴发流行。
传染均与被病毒感染的食物或水有关,导致感染所需病毒量极少(<100个病毒颗粒)。
另外,由于无症状的隐性感染可持续排毒超过一周时间,被感染的食物加工者和销售员也可能成为重要的传染源,与家庭外的肠胃炎患者接触,是札幌样病毒性肠胃炎的高危因子。
2.2 传播途径与易感人群以粪-口途径为主,其次是人与人的直接接触传染,或是因前述症状产生的飞沫污染物体表面后间接感染。
呕吐物的气溶胶也是札幌病毒传播的途径。
人札幌病毒能通过包括食物在内的多种途径传播,食用受札幌病毒污染的食物是感染的源头,尤其是生食贝类或食用未经煮熟的贝类会导致札幌病毒感染。
家庭成员或朋友之间的互相传播也很常见。
主要感染婴幼儿喝5岁以下的儿童,也有少数导致成人胃肠炎的爆发的报道。
2.3 所致疾病特征札幌病毒感染引起的婴幼儿腹泻案例中,到医院就诊的病例只占三成,即大多数病例较轻或病程较短无需到医院就诊。
导致婴幼儿的显性感染,主要症状有腹泻、呕吐和发热,但症状较轻。
可见于急性肠胃炎的散发病例,导致的腹泻症状较轻。
3、爆发的现场调查日本大阪2004-2005年17.6%的急性胃肠炎散发和暴发是由SLV所致[12]。
日本、泰国、巴基斯坦等国家儿童腹泻病例中SLV感染率3.2%~10.4%[13]。
方肇寅等1999-2005年在中国部分省区对5岁以下腹泻儿童开展SLV感染状况调查,检测的4426份粪便标本中有5份阳性[14]。
常昭瑞等报道2006年安徽、福建等9省区5岁以下腹泻患儿中的SLV检出率为0.9%[15]。
另外为了了解广州某医院秋冬季儿童腹泻中人类杯状病毒的特点,连续 2 个秋冬季腹泻流行季节收集临床诊断为病毒性腹泻患儿的粪便标本。
扎幌样病毒阳性率为0.31%(2/648),广州地区存在SLVs所致感染, 与我国报告的SLV基因型不同。
了解广州市医院门诊成人病毒性腹泻的感染情况和分子流行病学特征,2011年6月至2012年5月在广州市两家哨点医院收集门诊18 岁以上腹泻患者粪便标本127份。
札幌病毒3份,阳性率均为2.36%[16]。
2000-2012年我国札如病毒感染病例数据分析得出结论,检索了自2000年以来我国札如病毒研究报道的文献,对符合筛选条件的文献中的札如病毒感染病例进行统计,采样时间跨度从1997年到2011年,采样地点覆盖全国17个省市,共获得病例总样本数24211份,检出札如病毒阳性526份,阳性率为2.17%,其中有146份样本进行了基因分型,主要为GI.l、GI.2、GII.1和GIV型。
对札如病毒感染病例的时间分布和空间分布分别作了统计分析,得知2009年为最近的热点流行时间,SLV阳性率为3.33%;而札如病毒感染病例的空间分布上,河北、四川、浙江、广西、青海等位居前列,随后采用多维尺度法对病例的空间分布作了分析,由分析结果推测,沿海省市可能单独作为札如病毒的感染和传播源[17]。
2006年2月至2007年1月安徽省、福建省、海南省、河北省、河南省等9个地区5岁以下腹泻患儿的粪便标本共1 110份,结果表明,札如病毒阳性率为019%。
对检测到的全部10株札如病毒进一步进行系统进化分析,表明这10株札如病毒属于三个基因型:GI/1、GI/3和GII/3[15]。
深圳地区对收集的852份腹泻患者粪便标本进行SLV检测,检出SLV阳性株16例,阳性率为1.88%。
同源性比较发现8例为SLV GI型,7例GIV型,1例GII型[18]。
青岛地区收集青岛市青岛医学院附属医院散发疑似病毒性腹泻粪便标本94 例,札如病毒进行检测。
检测到札如病毒 2 株,对其进一步进行系统进化分析表明这2 株札如病毒属于基因型GIV[19,20]。
4、调查资料分析2011年2月25日18: 00左右深圳市某公司200 名员工聚餐,2 月26日12: 30起部分员工出现腹痛、腹泻、恶心和呕吐症状,至 2 月28日,确诊病例的27例。
患者最短潜伏期为18 h,最长潜伏期为64 h,平均潜伏期为32 h( 中位数) ,聚餐时患者均食用过蚝[21]。
2000年5月,日本北海道一所大学12 人感染札幌病毒;2005年2月1日至22日,日本某幼儿园中23人(6名成人)感染札幌病毒。
2007年5月,我国台湾省台北县发生集体腹泻事件,55人出现恶心、呕吐、腹泻等急性肠胃炎症状,送检的7名患者均检出札幌病毒[9-10]。
5、调查与总结报告札幌病毒在全世界的检测结果存在很大差异,阳性率在0.3%-9.3%之间。
其中,以日本对2岁以下社区儿童进行的前瞻性研究检出率最高(9.3%),荷兰进行的社区前瞻性研究检出率为6.2%,发病年龄集中在5岁以下儿童。
我国周边国家例如日本、泰国、巴基斯坦,Phan等报道日本对2002年7月至2003年6月收集的婴幼儿腹泻患者粪便标本进行札如病毒检测,阳性率为6.17%,泰国对2000年5月至2002年3月收集的急性胃肠炎住院患儿标本进行札如病毒检测,阳性率为3.15%,巴基斯坦急性胃肠炎住院婴幼儿中札如病毒检测率3.12%,马拉维5岁以下急性胃肠炎住院患儿札如病毒检测阳性率为2%(8/398)[15]。
我国近年来札幌病毒感染较少,一项研究对169份腹泻患儿粪便标本进行半截式RT-PCR检测,结果只检测出一份阳性标本。
6、检测技术以前在札幌感染的早期,诊断方法主要靠免疫电镜。
近年来,用重组杆状病毒来表达札幌病毒的衣壳蛋白,此衣壳蛋白可在昆虫细胞内自动组装成病毒样颗粒。
衣壳蛋白具有与病毒相似的抗原性,可以用ELISA方法检测札幌病毒血清抗体。