基质辅助飞行时间质谱（MALDI-TOF）是一种常见的质谱分析方法。

它基于一种称为基质辅助激光解析电离（Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization）的原理。

基质辅助激光解析电离原理中，样品（通常是大分子化合物，如蛋白质）被与之混合的基质（通常是气相辅助的有机化合物）分子所包围。

这种基质分子具有较低的离化能，能够吸收激光能量而形成激发态。

当激光照射到样品上时，基质分子被激发，产生部分分子的离子化。

这些离子化的基质分子迅速和样品中的分子相互作用，使得样品分子整体也被离子化。

在基质溶液中，样品分子和基质分子离子化后会形成“飞行时间”较长的离子群。

这些离子通过一个加速器，获得一定的动能，并进入一个飞行管道。

在飞行过程中，离子的飞行速度取决于它们的质荷比。

离子速度越快，质荷比越小。

当离子到达检测器时，通过测量它们到达检测器的时间，可以计算出它们的飞行时间。

由于离子群中含有不同质荷比的离子，所以它们到达检测器的时间也不同。

通过对离子群到达时间的分析，可以确定离子的质荷比，进而得到样品中不同分子的质量。

基质辅助飞行时间质谱能够用于分析生物分子（如蛋白质、多肽、核酸等）的分子量、结构和组成。

它在生物医学领域中有着广泛的应用，如蛋白质组学、药物代谢研究等。