蛋白质分子量测定:凝胶过滤层析法一、目的:(1)初步掌握利用凝胶层析法测定蛋白质分子量的原理。
(2)学习用标准蛋白质混合液制作Ve,Kav对1gMr的“选择曲线”以及测定未知蛋白质样品分子量的方法。
二、原理:凝胶层析法(即凝胶过滤法,gel filtration)是利用凝胶把分子大小不同的物质分离开的一种方法,又叫做分子筛层析法(molecular sieve chromatography),排阻层析法(exclusion chromatography)。
凝胶本身是一种分子筛,它可以把分子按大小不同进行分离,好象过筛可以把大颗粒与小颗粒分开一样。
但这种“过筛”与普通的过筛不一样。
将凝胶颗粒在适宜溶剂中浸泡,使充分吸液膨胀,然后装入层析柱中,加入欲分离的混合物后,再以同一溶剂洗脱,在洗脱过程中,大分子不能进入凝胶内部而沿凝胶颗粒间的空隙最先流出柱外,而小分子可以进入凝胶内部,流速缓慢,以致最后流出柱外,从而使样品中分子大小不同的物质得到分离。
分离过程中的示意见图17-1。
凝胶是由胶体溶液凝结而成的固体物质,不论是天然凝胶还是人工合成凝胶,它们的内部都具有很微细的多孔网状结构。
凝胶层析法常用的天然凝胶是琼脂糖凝胶(agarose gel,商品名Sepharose),人工合成凝胶是聚丙烯酰胺凝胶(商品名为Bio-gel-P)和葡聚糖(dextran)凝胶,后者的商品名称为Sephadex型的各种交联葡聚糖凝胶,它是个有不同孔隙度的立体网状结构的凝胶,不溶于水,其化学结构式如图17-2所示。
这种聚合物的立体网状结构,其孔隙大小与被分离物质分子的大小有相应的数量级。
在凝胶充分溶胀后,交联度高的,孔隙小,只有相应的小分子可以通过,适于分离小分子物质。
相反,交联度低的孔隙大,适于分离大分子物质。
利用这种性质可分离不同分子量的物质。
为了说明凝胶层析的原理,将凝胶装柱后,柱床体积称为“总体积”,以Vt(total volume)表示。
实际上Vt是由Vo,Vi与Vg三部分组成,即:Vt=Vo+Vi+VgVo称为“孔隙体积”或“外体积”(outer volume)又称“外水体积”,即存在于柱床内凝胶颗粒外面空隙之间的水相体积,相应于一般层析法中柱内流动相的体积;Vi为内体积(inner volume),又称“内水体积”,即凝胶颗粒内部所含水相的体积,相应于一般层析法中的固定相的体积,它可从干凝胶颗粒重量和吸水后的重量求得;Vg为凝胶本身的体积,因此Vt—Vo等于Vi+Vg 。
它们之间的关系可用图17-3表示。
洗脱体积(Ve,elution Volume)与Vo及Vi之间的关系可用下式表示:Ve=Vo+KdVi式中Ve为洗脱体积,自加入样品时算起,到组分最大浓度(峰)出现时所流出的体积;Kd为样品组分在二相间的分配系数,也可以说Kd是分子量不同的溶质在凝胶内部和外部的分配系数。
它只与被分离物质分子的大小和凝胶颗粒孔隙的大小分布有关,而与柱的长短粗细无关,也就是说它对每一物质为常数,与柱的物理条件无关。
Kd可通过实验求得,上式可改写成:上式中Ve为实际测得的洗脱体积;Vo可用不被凝胶滞留的大分子物质的溶液(最好有颜色以便于观察,如血红蛋白,印度黑墨水,分子量约200万的蓝色葡聚糖-2000等)通过实际测量求出;Vi可由g·WR求得(g为干凝胶重,单位为克;WR为凝胶的“吸水量”,以毫升/克表示)。
因此,对一层析柱凝胶床来说,只要通过实验得知某一物质的洗脱体积Ve,就可算出它的Kd值。
以上关系可用图17-4表示。
Kd可以有下列几种情况:有颜色以便于观察,如血红蛋白,印度黑墨水,分子量约200万的蓝色葡聚糖-2000等)通过实际测量求出;Vi可由g·WR求得(g为干凝胶重,单位为克;WR为凝胶的“吸水量”,以毫升/克表示)。
因此,对一层析柱凝胶床来说,只要通过实验得知某一物质的洗脱体积Ve,就可算出它的Kd值。
以上关系可用图17-4表示。
Kd可以有下列几种情况:1、当Kd=0时,则Ve=Vo。
即对于根本不能进入凝胶内部的大分子物质(全排阻),洗脱体积等于空隙体积(图中组分Ⅰ)。
2、当Kd=1时,Ve=Vo+Vi。
即小分子可完全渗入凝胶内部时,洗脱体积应为空隙体积与内体积之和(图中组分Ⅲ)。
可以看出,对某一凝胶介质,两种全排出的分子即Kd都等于零,虽然分子大小有差别,但不能有分离效果。
同样两种分子如都能进入内部空隙,即Kd都等于1,它们既使分子大小有不同,也没有分离效果。
因此不同型号的凝胶介质,有它一定的使用范围。
3、当0<Kd<1时,Ve=Vo+KdVi。
表示内体积只有一部分可被组分利用,扩散渗入,Ve即在Vo+Vi之间变化(图中组分Ⅱ)。
4、有时Kd>1,表示凝胶对组分有吸附作用,此时Ve>Vo+Vi。
例如一些芳香族化合物的洗脱体积远超出理论计算的最大值,这些化合物的Kd>1。
如苯丙氨酸,酪氨酸和色氨酸在Sephadex G-25中的Kd值分别为1.2,1.4和2.2。
在实际工作中,对小分子物质也得不到Kd=1的数值,特别是交联度大的凝胶差别更大,如用G-10型得Kd值0.75左右,用G-25型得0.8左右。
这是由于一部分水相与凝胶结合较牢固,成为凝胶本身的一部分,因而不起作用,小分子不能扩散入内所致。
此时Vi即不能以g·WR 计算,为此也常有直接用小分子物质D2O,NaCl等通过凝胶柱而由实验计算出Vi值的。
另一个解决的办法是不使用Vi与Kd,而用Kav(有效分配系数)代替Kd,其定义如下:已知在这里实际上将原来以水作为固定相(Vi)改为水与凝胶颗粒(Vi—Vo)作为固定相,而洗脱剂(Ve—Vo)作为流动相。
Kav与Kd对交联度小的凝胶差别较小,而对交联度大的凝胶差别大。
在一般情况下,凝胶对组分没有吸附作用时,当流动相流过Vt体积后,所有的组分都应该被洗出来,这一点为凝胶层析法的特点,与一般层析方法不同。
Ve与分子量的关系:对同一类型的化合物,洗脱特性与组分的分子量有关,流过凝胶柱时,按分子量大小顺序流出,分子量大的走在前面。
Ve与分子量的关系可用下式表示:V e=K1—K2logMrK1与K2为常数,Mr为分子量,Ve也可用Ve—Vo(分离体积),Ve/Vo(相对保留体积),Ve/Vt(简化的洗脱体积,它受柱的填充情况的影响较小)或Kav代替,与分子量的关系同上式,只是常数不同。
通常多以Kav对分子量的对数作图得一曲线,称为“选择曲线”,如图17-5所示。
曲线的斜率是说明凝胶性质的一个很重要的特征。
在允许的工作范围内,曲线愈陡,则分级愈好,而工作范围愈窄。
凝胶层析主要决定于溶质分子的大小,每一类型的化合物如球蛋白类,右旋糖酐类等都有它自己的特殊的选择曲线,可用以测定未知物的分子量,测定时以使用曲线的直线部分为宜。
用凝胶层析法测定蛋白质的分子量,方法简单,技术易掌握,样品用量少,而且有时不需要纯物质,用一粗制品即可。
例如在一粗酶制剂中,为了测定某一酶组分的分子量,只要测定洗脱液中具有该酶最大活性的部分,然后确定其洗脱体积,即可从标准曲线中查出其分子量。
凝胶层析法测定分子量也有一定的局限性,在pH6—8的范围内,线性关系比较好,但在极端pH时,一般蛋白质有可能因变性而偏离。
糖蛋白在含糖量超过5%时,测得分子量比真实的要大,铁蛋白则与此相反,测得的分子量比真实的要小。
有一些酶底物是糖,如淀粉酶,溶菌酶等会与葡聚糖凝胶形成络合物,这种络合物与酶-底物络合物相似,因此在葡聚糖凝胶上层析时表现异常。
用凝胶层析法所测分子量的结果,要和其它方法的测定相对照,由此才可作出较可靠的结论。
凝胶层析技术操作方便,设备简单,周期短,重复性能好,而且条件温和,一般不引起生物活性物质的变化,目前已得到相当广泛的应用,例如可用于脱盐,浓缩高分子物质的溶液,生化物质的分离提纯,去除热源物质以及用于测定高分子物质的分子量。
下面实验是用葡聚糖凝胶层析法测定蛋白质的分子量。
三、试剂及器材:1、试剂:(1)标准蛋白质混合液(各2—3mg·ml-1,用氯化钾-乙酸溶液配制),牛血清清蛋白(Mr67000),鸡卵清蛋白(Mr43000),胰凝乳蛋白酶原A(Mr25000)和结晶牛胰岛素(PH2时为二聚体Mr12000)等均需层析纯。
(2)蓝色葡聚糖-2000(8—10mg·ml-1),N-乙酰酪氨酸乙酯(或硫酸铵或重铬酸钾)(8—10mg·ml-1)。
(3)0.025mo·L-1氯化钾-0.2mol·L-1乙酸溶液,Sephadex G—75(或G—100),5%Ba (Ac)2。
(4)待测蛋白质样品液。
2.器材:层析柱:柱管(直径1.0~1.3cm;管长90~100cm),核酸蛋白检测仪或紫外分光光度计,自动部分收集器,恒压瓶,下口瓶。
四、操作步骤:1、一般操作方法:(1)凝胶的选择和处理凝胶颗粒最好大小比较均匀,这样,流速稳定,结果较好。
如果颗粒大小不匀,用倾泻法倾去不易沉下的较细颗粒。
将称好的干粉倾入过量的洗脱液(一般多用水,盐溶液或缓冲溶液)中,室温下放置,使之充分溶胀。
注意不要过分搅抖,以防颗粒破碎。
溶胀时间因凝胶交联度不同而异为了缩短溶胀时间,可在沸水浴上加热将近100℃,这样可大大缩短溶胀时间至几小时,而且还可以杀死细菌和霉菌,并可排除凝胶内气泡。
种类凝胶溶胀时间请查阅葡聚糖凝胶的技术数据表。
(2)装柱装柱前,必须用真空干燥器抽尽凝胶中空气。
装柱方法与一般柱层析法相似。
层析柱可以自制或外购,目前已有各种规格层析柱商品(图17-6)。
装柱前须将凝胶上面过多的溶液倾出。
关闭层析柱出水口,并向柱管内加入约1/3柱容积的洗脱液,然后在搅拌下,将浓浆状的凝胶连续地倾入柱中,使之自然沉降,待凝胶沉降约2—3cm 后,打开柱的出口,调节合适的流速,使凝胶继续沉集,待沉集的胶面上升到离柱的顶端约5cm 处时停止装柱,关闭出水口。
接着再通过2—3倍柱床容积的洗脱液使柱床稳定,然后在凝胶表面上放一片滤纸或尼龙滤布,以防将来在加样时凝胶被冲起,并始终保持凝胶上端有一段液体。
新装好的柱要检验其均一性,可用带色的高分子物质如蓝色葡聚糖-2000(又称蓝色右旋糖,商品名为Blue dextran-2000)、红色葡聚糖或细胞色素C等配成2mg/ml的溶液过柱,看色带是否均匀下降,或将柱管向光照方向用眼睛观察,看是否均匀,有无“纹路”或气泡。
若层析柱床不均一,必须重新装柱。
(3)加样要照顾到浓度与粘度两个方面。
分析用量:1—2ml/100ml柱床容积(1—2%);制备用量:20—30ml/100ml柱床容积。
加样方法与一般柱层析相同。
夹紧上、下进、出水口夹子,为防止操作压改变,可将塑料管下口抬高至离柱上端约50cm处(Sephadex G-75,选用50cm液柱操作压),打开柱上端的塞子或螺丝帽,吸出层析柱中多余液体直至与胶面相切。