文摘索引型数据库检索与利用
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Summary(简要格式) Abstract(文摘格式) MEDLINE
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检索策略的存储和调用
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3.双引号:“ ”,表示对引号中的短语进行检索。 4.检索字段标识符:[tag],tag为字段名称。 [ti],[au],[ta],[so],[la],[pt]。
常用字段组成
标识符 字段名称
TI
Title
AU Author
AD Affiliation
AB Abstract
DP Publication Date
PubMed检索机制
1.自动截词转换匹配功能(Automatic Term Mapping) 对于输入的检索词,PubMed先按一定的词表顺序进行对照 匹 配 和 转 换 , 再 进 行 检 索 。 词 表 匹 配 转 换 顺 序 是 : MeSH 表 (MeSH table) 、 期 刊 刊 名 表 (Journal table) 、 作 者 索 引 (Author Index)、调查者表(Investigator table) 、所有字段(All Fields)。 如果在以上5个表中都找不到相匹配的词,PubMed将把短语分 开,以单词为单位,分别重复以上的过程,检索时各个词之间 是AND逻辑关系。 2.短语检索(Phrase Searching) 也可称为强迫词组检索,即,如果要将短语作为一个词组 进行检索,可用双引号“ ”将其引起来。如:“drug therapy” 作为词组进行检索的词,系统不进行自动转换匹配,也不进行 MeSH词的扩检。
PubMed检索方法
1.基本检索:在基本检索界面下完 成的检索方法
2.高级检索:高级检索界面下进行 的检索方法
3.MeSH Database检索:主题词检索
基本检索
基本检索
1.关键词、词(词组)或短语: 2.作者:Smith JS 或 Smith[au] 3.期刊刊名:GENE THERAPY[TA],JAMA[TA] 4.截词:CHEMO* 5.复杂表达式:CANCER AND THERAPY 6.#1 AND #2
自由词:关键词、文本词、款目词。表示的字面。
MeSH的特性
动态性 唯一性
MeSH Database检索步骤
1.输入查找的主题词 2.找到所需主题词,直接点击词的链接 3.选择与主题词对应的副主题词表(检索范围,参考
树状结构表) 4.添加到检索框中 5.在PubMed中检索
检索步骤
限定检索
Article types(文献类型) Text availability(文本利用,文摘和全文) Publication dates(出版日期) Species(研究对象) Languages(语种) Sex(性别) Subjects(主题范畴) Journal categories(期刊类型) Ages(年龄组) Search fields(特定字段)
举例:儿童哮喘的药物治疗方面文献
高级检索 1.确定检索词:child asthma drug therapy 2.选择检索字段 3.输入检索词
Journals Databases
主题、刊名全称或缩写、ISSN
单篇文献匹配器
临床咨询
特殊专题咨询
检索结果
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规范化的词或词组。 ➢ 主题词如何形成? ➢ 哪些词可以作为主题词? ➢ 副主题词又有什么作用?它和主题词是什么关系? ➢ 主题词和自由词的区别?
主题词与自由词区别
主题词:又称叙词,在标引和检索中用以表达文献主 题的规范化的词或词组。 主题词表示的是概念,概念由语词表达的,并不是所 有的词语都是主题词。
PubMed检索运算符
1.逻辑运算符: 逻辑与:AND,逻辑或:OR,逻辑非:NOT。当一个检索表 达式中同时含有三个运算符时,运算顺序从左至右,括号可 以改变运算顺序。
2.截词符:*,一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词 符,chem*表示用词根进行检索。
Heart attack* 会关闭自动转换匹配检索词,myocardial infarction, myocardial stunning, shock等词会匹配不到
限定检索
限定检索
点击取消
PubMed几种检索方法的选择
基本检索 高级检索 MeSH Database检索
举例:儿童哮喘的药物治疗方面文献
基本检索 1.检索表达式: children asthma drug therapy 2.直接输入检索框中,进行检索
检索过程(Search details)
修改为:“liver neoplasms”[MeSH Terms] AND "genetic therapy"[MeSH Terms]
修改后的检索结果
高级检索
高级检索
MeSH Database检索
输入查找的主题词
主题词注释
树状结构表
款目词
MeSH主题词
➢什么是MeSH ? 又称叙词,在标引和检索中用以表达文献主题的
ห้องสมุดไป่ตู้
其它功能
全文链接 相关文献链接 相关数据库的链接 RSS阅读器的使用
全文链接
全文链接
检索练习
1.利巴韦林(ribavirin)治疗SARS方面文献 2. 肝硬化(liver cirrhosis)引起肝癌的临床试验研究
3.检索微量元素缺乏与皮肤病关系的英文综述文献
PubMed检索小结
肝癌的基因治疗 Liver cancer gene therapy
Search Details检索过程
Search details检索过程
("liver neoplasms"[MeSH Terms] OR ("liver"[All Fields] AND "neoplasms"[All Fields]) OR "liver neoplasms"[All Fields] OR ("liver"[All Fields] AND "cancer"[All Fields]) OR "liver cancer"[All Fields]) AND ("genetic therapy"[MeSH Terms] OR ("genetic"[All Fields] AND "therapy"[All Fields]) OR "genetic therapy"[All Fields] OR ("gene"[All Fields] AND "therapy"[All Fields]) OR "gene therapy"[All Fields])
检索体系完备等特点,部分文献还可在网上直接 免费获得全文。 5. 学科范围:生物医学、生命科学、行为科学、生 物工程、化学等学科。 6.与Medline光盘数据库的区别:检索机制、检索界 面、检索方法以及收录文献数量不同。
PubMed数据来源
1.MEDLINE:包括OLDMEDLINE 2.In Process Citations:每天收录,尚未经规 范处理的数据。 3.Publisher-Supplied Citations:由出版商提供 的电子文献,每条记录标有[PubMed-as supplied by Publisher]。
1.任何一项研究主题都有多个检索途径,要比较多个 检索途径的结果,那个更适合该项研究主题
2.Search Details描述检索过程 3.*关闭自动转换匹配功能 4.限定检索条件要及时关闭,否则会影响后续的检索
结果
谢谢!
("child"[MeSH Terms] OR "child"[All Fields] OR "children"[All Fields]) AND ("asthma"[MeSH Terms] OR "asthma"[All Fields]) AND ("drug therapy"[Subheading] OR ("drug"[All Fields] AND "therapy"[All Fields]) OR "drug therapy"[All Fields] OR "drug therapy"[MeSH Terms] OR ("drug"[All Fields] AND "therapy"[All Fields])) 修改检索式:
EDAT Entrez Date
SO Source
TA Journal Title Abbreviation
MH MeSH Terms
PT
Publication Type
检索界面
➢ 基本检索 ➢ 高级检索 ➢ MeSH Database检索 ➢ 限定检索 ➢ 期刊查询(Journals Databases ) ➢ 引文匹配器(Citation Matcher) ➢ 临床查询(Clinical Queries)
PubMed检索与利用
李春英 北京大学医学图书馆
2017年10月
主要内容
1. 数据库概况 2. 数据库检索机制 3. 数据库的组成结构 4. 检索界面 5. 检索方法与技巧
PubMed概况
1.创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国生物 技术信息中心(NCBI)