一、半索动物的进化地位
半索动物（又称隐索动物）是一个种类很少的小门，分为二个纲：肠鳃纲（如柱头虫）和羽鳃纲（如头盘虫和杆壁虫）。
由于它们的胚胎发育与棘皮动物相似，但又有鳃裂及中空的神经，类似于脊索动物。
所以，认为与棘皮动物和脊索动物有一定的亲缘关系。
二、主要结构特征
1、体型
•典型的种类如柱头虫，身体蠕虫状，多穴居在泥沙中，
•分布在浅海和潮间带，体长2~250 cm；
•身体可分为吻、领、躯干3部分；
•吻和领都有发达的肌内，吻能缩入领内，依赖于吻部和领部的伸缩、柱头虫能在泥沙中掘穴和运动身体。
•躯干部细长，前部两侧向外延伸形成翼状板，内有生殖腺，称为生殖翼。
肛门在躯干部未端。
•动物学上，将凡是分类地位很近的动物，由于分别适应各种生活环境，经长期演变终于在形态结构上造成明显差异的现象，称为适应辐射。
•半索动物门羽鳃纲的动物（如杆壁虫），由于营海底固着的群体生活，形态结构上发生很大的变化，该纲动物体形小，有腕和触手，吻部退化，外形上像苔鲜虫。
二、体壁
•体壁层由上皮层和肌肉层构成。
上皮层由表皮细胞、腺细胞和神经细胞等组成，吻部的上皮着生纤毛，为纤毛上皮。
•上皮下为肌肉层，包括环肌层和纵肌层；领部肌肉层更发达，分别由领圈外肌，领圈内肌和领部纵肌组成，躯干部为纵肌层。
三、体腔
•体腔包括一个吻体腔、成对的领体腔和成对的躯干体腔，体腔之间有隔膜隔开。
四、鳃裂
•柱头虫躯干部前端，背中线两侧各有一行成对（7－700）外鳃裂，其内部为鳃囊或咽囊，鳃囊中有若干对“U”
形的内鳃裂。
内鳃裂与外鳃裂一一相对应。
五、中空的领神经索
•半索动物的神经系统原始而又特殊：身体头部表皮细胞的基部的一层神经纤维网，或称表皮神经丛，分别在背中线和腹中线处加厚形成背、腹神经索，两神经索在躯干的前端相连成一神经环，背中神经索在领内形成领索，可能为动物的神经中枢。
五、中空的领神经索
•特别的是：领索是中空的，而且位于体腔内，这种中空的神经索类似于高等动物的神经管。
领索再往后，又成为背、腹神经索，穿行于表皮之下。
•口腔背面向前伸出一条短盲管至吻部的基部，盲管的腹侧有胶质的吻骨，但并不很坚硬，称为“口索”，由于口索很短小，所以，将具有这一结构的动物称为半索动物。
一、取食和消化
•柱头虫依靠吻体腔和领腔的充水和排水，可使吻部和领部发生伸缩，用来掘沙。
•柱头虫的口位于吻的基部腹面，领的最前缘，在虫体向前掘进时，水和富含有机质的泥沙会被摄入口和咽中，然后进入细长的肠管内，食物消化、吸收的过程，同蚯蚓大致相同，不能消化的泥沙或残渣，经身体末端的肛门排出体外。
•羽鳃纲的动物行悬浮取食，通过腕将粘附在触手上的悬浮物送入口中进行消化。
二、呼吸系统
•柱头虫的内鳃裂上有丰实的血管，由于纤毛的作用或虫体前进时，水会从口进入咽，然后经过内鳃裂到鳃囊，最后经外鳃裂流出体外，在这一过程中，水经过内鳃裂时，与内鳃裂上的血管进行气体交换。
三、循环系统
•柱头虫循环系统的构造同蚯蚓类似，主要有背血管和腹血管组成。
柱头虫的血管实际上是血窦，所以属于开管式循环系统。
四、排泄系统
•柱头虫口索前端，有一血管球，是柱头虫的排泄器管。
五、生殖与发育
•半索动物为雌雄异体，生殖腺为若干小形囊状物排列在躯干部背面两侧，各有小孔开口于体外，生殖细胞成熟后，即由小孔排到水中进行体外受精。
•受精卵经过辐射卵裂，内陷法形成原肠胚，再经肠腔法形成中胚层和体腔，体腔也分为前、中、后三分体腔，形成的柱头虫幼虫也与海参的短腕幼虫十分相似。
游泳数日或数周后沉入海底变态为成虫，有的种类以长有纤毛的原肠胚形式自由生活，然后直接发育成成体，发育过程类似于棘皮动物。
一、半索动物的起源
•半索动物的起源问题，从许多方面的资料看出，它与棘皮动物有很多相似的特点，主要体现在：
1、都是后口动物；
2、胚胎发育和幼虫阶段极其相似；
3、生化方面的证据：脊索动物肌肉中的
磷肌酸为含有肌酸的化合物，非脊索动物为含精氨酸的化合物，而棘皮和半索动物中，两者都有。
因此，有人设想，半索动物与棘皮动物是由自由生活的共同祖先演化而来的。
二、半索动物在动物界的地位
•半索动物在动物界究竟处在什么地位？这个问题直到现在还有争论。
•有人认为，半索动物应该列入动物界最高等的一个门，脊索动物门里面去；
•有人认为，半索动物有许多特征与脊索动物差距很大，不应该列入脊索动物门中去。
㊣折衷的说法：半索动物为非脊索动物动物中的一个门，它们是介于非脊索动物和脊索动物之间的一种过渡类型。
♀半索动物为脊索动物
1. 半索动物的口索相当于脊索动物的脊索；
2. 半索动物的背神经索的前端是中空的，而且位于体腔内，相当于脊索动物的背神经管；
3. 半索动物具有咽鳃裂。
♂半索动物非脊索动物
2. 半索动物具有一系列非脊索动物的特征，如腹神经索、开管式循环系统、肛门位于身体的末端等。