Green diamond nodes represent compounds Pink circle nodes represent target genes
Purple rounded square nodes represent T2D-associated pathways
The node size is proportional to the degree of the Green.
Network pharmacology for FangJiomics approach
Network pharmacology
A new perspective to understand principle of drug combination in Traditional Chinese Medicine ?
miRNA Target Gene
Gene Module Database
Figure1.The framework of the Fangjiomics study of XKA
Table1.The top 10 compounds with the most targets
Figure4A.The top compound-target –pathway networks of XKA in the treatment of T2D.
Different Roles of the Gene Modules & their cooperation effects
• 君 - King • 臣 - Minister • 佐 - Assistant • 使-
AmbassadorFra bibliotekThe information to deliver • Network could be drug target
Green edges link compounds to target genes and blu edges link target genes to T2D-associated pathways
展望
通过生物学网络中节点的连接和关系来分析网络特性，进一步阐明药物作用机制
通过网络药理学的研究来寻找、优化和确认靶点，对新药的发现具有重要的指导 意义
通过网络药理学分析，可以预测和分 析药物副作用产生的可能性和药物作用的 新 靶点
存在的问题
网络药理学的发展毕竟刚刚起步, 方兴未艾, 很多方面, 特别是网络药理学计算所 需要的基础数据, 还有待于系统、全面地积累与整合, 未来发展之路还很漫长
目前用于网络计算的大部分图谱信息来源于不同的实验条件, 在计算两个相似或 相同的疾病时, 具有很低的相关性, 呈现出假阴性
• Network pharmacology belongs to a division of systems biology and provides a synergistic strategies
Gene Module Database
Protein Network
Pathway
Gene Ontology
经评价的小分子化合物及其作用靶点数量均有限
共享的数据库信息均倾向于某些热点研究领域, 因此其信息均存在不同程度的局限 性
Thank you !
(A).The compound-target –pathway networks with compounds identified by LC-MS analysis (NCA)
Figure4B.(B)The top compound-target –pathway network with compounds collected from databases(NCD)