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rt-qPCR实验操作课件


• Real-time定量PCR仪是在PCR反应体系中加入荧光 基团,利用荧光信号累积实时监测和连续地分析 整个PCR进程,随着反应时间的进行,监测到的荧 光信号的变化可以绘制成一条曲线,最后通过标 准曲线对未知模板进行定量的分析。
rt-qPCR实验操作
G r e e n
SYBR Green 能结合到双链DNA的小沟部位,只有和 双链DNA结合后才发出荧光,DNA双链分开就不发 出荧光,随PCR循环数的增加,产物量的增多,产生 的荧光信号逐渐增强,实现了荧光信号与产物量的关 联。
•病毒感染的定量监测
rt-qPCR实验操作
基 本 原 理•试管中进行的DNA复制反应,依据
1.DNA半保留复制的机理 2.体外DNA分子于不同温度下可变性和复性的性质 •通过人为控制体外合成系统的温度,使 1.双链DNA变成单链 2.单链DNA与人工合成的引物退火 3.DNA聚合酶使引物沿着单链模板延伸为双链DNA。
5、贴膜,离心,上机,Real Time PCR扩增结束后 输出对照组和待测组的rt-目qPCR的实验基操作 因及内参基因的CT值。
即实验组基因表达相较于对 照组上调或下调的倍数。
rt-qPCR实验操作
荧光定量PCR如何减小误差
1、校准生物学误差:内参(管家基因) 2、降低随机误差
rt-qPCR实验操作
荧光实时定量PCR rt-qPCR
rt-qPCR实验操作
定义 实时荧光定量PCR(rt-qPCR): • 在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信 号的变化对PCR过程进行 实时监控,以此实现对初 始模板的定量分析。
rt-qPCR实验操作
C R 的•mRNA表达的研究 应用••微肿小 瘤残 耐留 药病 基变 因的 表检达测的研究
3、计算样本混合物(每个孔加sybr10ul、 cDNA30ug、水8.4ul-cDNA),前后引物的量(每 个孔加前后引物各0.8ul),多算1到2孔。按比例混 合样本,sybr,水。按比例混合前后引物。
4、按照排板的顺序往板内加样本混合物,每孔18.4 微升,加完后按排板顺序加相应的前后引物混合物, 每孔1.6微升。
rt-qPCR实验操作
• 基本步骤 • 变性:加热使双链DNA变为单链(94℃,30s) • 退火:降温使引物和互补模板在局部形成杂交链
(55℃,30s) • 延伸:耐热DNA聚合酶按5′→3′方向催化以引物
为起始点的延伸反应(70~72℃,30~60s)
rt-qPCR实验操作
意 图
rt-qPCR实验操作
1、校准生物学误差内参(管家基因)
内参基因(Endogenous Control) 用于校准实验过程中样品本身对定量结果的影响
原因:核酸提取时通常以重量,体积或细胞数为单位 取
样,提取过程中存在得率差异和操作误差,造 成
等量样品不一定获得等量提取物 目的:将定量结果校准为以基因组(或单个细胞)为
单位,不同样品之间才具有可比性 校准方法:[目的基因]-[r内t-qPC参R实验]操=作均一化的目的基因表达
•在 相 同 的 条 件 下 , 进 行 复 制 扩 增 , 每 扩 增
rt-qPCR实验操作
logX= n (1+E)+logX0
rt-qPCR实验操作
步 骤
1、把要测的RNA逆转录为cDNA,决定要跑的基因 和使用的内参序列,排好板的顺序。
2、准备好DNA样本,水,sybr,前后引物,融化, 离心。
2、降低随机误差: 重复实验
• 生物学重复:样品三次重复 • 技术重复:每个样品做3-4个复孔
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谢谢!
rt-qPCR实验操作
rt-qPCR实验操作
Байду номын сангаас
• 理论上来说,PCR反应过程中生成的DNA产物是呈 指数方式增加的,即每增加一个循环,PCR产物加 倍。但随着反应循环数的增加,产物积累、原料 消耗,最终PCR反应无法继续维持指数方式的扩增, 而进入线性期和平台期。整个PCR反应过程中,只 有在指数期,PCR产物的量与加入的初始模板量存 在明确的数学关系(PCR产物量=初始模板量×2^N, N=循环数),因此,利用公式,可以由产物的量 精确推算出初始模板量的多少。而在线性期和平 台期,PCR产物量和初始模板量之间不存在准确的 数学关系,由这两个时期的产物量来推算初始模 板量的多少是不准确的rt-qP。CR实验操作
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