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种的概念
种：最基本的分类单位； 微生物种的定义的不明确性
种的性状（可交配标准、形态学） 分类的大起大落变化 微生物的遗传本质和分子进化 分类人的思想倾向、技术条件，研究条件 的重要性
种的概念 资料仅供参考,不当之处，请联系改正。
Corynebacterium crenatum sp.nov AS 1.542 钝齿棒杆菌的 AS 1.542新种
种的分类地位举例 资料仅供参考,不当之处，请联系改正。
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二、微生物的学名
俗名（Common name，Vernacular name） 结核杆菌：结核分枝杆菌 红色面包霉：粗糙脉胞菌
第四节 微生物分类的鉴定的方法 一、经典分类鉴定方法 二、现代分类鉴定方法
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几个数字
生物种数：150余万种 微生物种数：15万－20万（已记载的）
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微生物分类学 Microbial Taxonomy
生物分类学
一门按生物的亲缘关系把它们分门别类的排成各 种分类单元或分类群的科学。
命名（Nomenclature）：是按照国际命名 法规给予有机体一个科学的名称
鉴定（Identification）：是指确定一个新分 离物是否归属于某个已命名的分类单元正。
第一章 通用分类单元
分类的级别
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一、种以上的系统分类单元
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微生物分类学的新手段
分子生物学 微生物基因组学：以基因组为基础进行分类 新种（Species nova，sp.nov或nov sp.）
指权威性的分类鉴定手册中从未记载过的 一种新分离并鉴定过的微生物
Corynebacterium pekinese sp.nov AS 1.299 北京棒杆菌AS 1.299新种
分类学任务 分类：宏观的战略工作 鉴定：微观的战术行工作 命名：开拓性的创新工作
微生物分类学的发展
经典分类学 微生物系统学（Microbial Systematics）
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微生物分类学 Microbial Taxonomy
分类（Classification）：是指根据相似性或 亲缘关系，将一个有机体放在一个单元中
七级分类单元（Taxon，Taxa，Category） 界（Kingdom） 门（Phylum） 纲（Class） 目（Order） 科（Family） 属（Genus） 种（Species）
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以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是： 真菌门Eumycophyta 子囊菌纲Ascomycetes 内孢霉目Endomycetales 内孢霉科E.domcetaceae 酵母属Saccharomyces 啤酒酵母S．Cerevisiae Hansen
学名（Scientific Name, Scientific nomenclature） 菌种的科学名称，是按照“国际命名法规”进命名 并受国际学术界公认的通用正式名称，由拉丁词或 拉丁化的词组成 林奈的“双名法” Binomial nomenclature 三名法 学名的其他只是一个微生物学工作者必须牢记常 用常见的微生物学名
枯草芽孢杆菌
Bacillus subtilis （Ehrenberg）Cohn 1872 缩写：B.subtilis或Bac.subtilis Bacillus sp.表示尚未定种名的芽孢杆菌（芽孢杆菌 的某一种） Bacillus spp.表示一批尚未定名的芽孢杆菌（若干芽 孢杆菌）
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“三名法”－亚种或变种命名
Trinom inalnom enclature
属名＋种名加词＋（subsp.或var.）+亚种（变种） 加词
实例
1.苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种
Bacillus thuringiensis subsp. Galleria 2.酿酒酵母椭圆变种 Saccharom yces cerevisiae（Var）ellipsoideus 3.卵形脆弱拟杆菌
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内容
第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 二、学名 三、几个概念
第二节 微生物在生物界的地位 一、生物的界级分类学说 二、三域学说及其发展
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内容
第三节 各大类微生物的分类系统纲要 一、Bergey氏原核生物分类系统纲要 二、Ainsworth等人的菌物分类系统纲要
双名法的实例
➢Mycobacterium tuberculosis （Zopf） Lehmannet Newmann 1896
➢Clostridium acetobutylicum McCoy，Fred， peterson et Hastings 1926
➢Bifidobacterium bifidum （Tissier）OrlaJensen 1923
种（Species）
基本分类单位，指一群在形态、生理方面彼此非常 相似或性状差别微小的个体。或是一群表型特征高 度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其它种有着 明显差异的菌株的总称
菌株（Strain）
某条件、地区分离到具体菌株。它是由一独立分离 的单细胞繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代， 典型菌株（TypeStrain），模式株（TypeSpecies） 实例：Bifidoboacterium bifidum ATCC 29521
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双名法Binominal Nomenclature
学名 属名：首字母大写，斜体字 种名加词：小写，斜体字
（首次定名人）：正体字，用括号扩住 现在定名人：正体字 定名年份
实例
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双名法的实例
大肠埃希氏菌
Escherichia coli （Migula）Castellaniet chalmers 1919