邻近效应
邻近效应（Proximity effect）
酶与底物形成中间复合物后使底物之间、酶的催化基 团与底物之间相互靠近，提高了反应基团的有效浓度， 使反应速率大大增加。
邻近效应
咪唑催化对硝基苯酯的水解，分子内反应比分子间反应快 24倍。说明咪唑基与酯基的相对位置对反应速率影响很大
定向效应
定向效应（Orientation effect）
酶与底物分子的相互作用
4.4.3
E+S
k1 k2
E - S P+E
k3
酶+底物
*
酶-底物复合物
产物+酶
E+S
k1 k2
E - S P+E
k3
在反应中，E与S通过某种方式结合形成ES时，使底物分 子内某些化学键呈不稳定状态，从而降低了活化能。ES复 合物还可转变为酶与产物的复合物 EP，继而EP分解出P和 E。ES复合物的形成是决定反应速率的关键步骤。 许多实验事实证明了ES复合物的存在，如：已获得ES结 晶、X线衍射法描出ES图象、同位素标记底物实验、光谱 分析分析

底物与活性中心的结合不仅使底物与酶催化基团或其它底物接触，
而且强行“冻结”了底物的某些化学键的平动和转动，促使它们
采取正确的方向，有利于键的形成。
与反应过渡态结合作用
按SN2历程进行的反应，反应速度与形成的过渡状
态稳定性密切相关。
在酶催化的反应中，与酶的活性中心形成复合物的
实际上是底物形成的过渡状态 酶与过渡状态的亲和力要大于酶与底物或产物的亲 和力。
酶和底物分子相互作用的形式及意义
（1）邻近效应与定向效应 （2）与过渡态的结合作用
（3）多功能催化作用
（4）酶催化作用学说
①锁钥学说
②诱导契合学说 ③三点结合理论
邻近效应与定向效应
邻近效应与定向效应变分子间反应为分子内反应。 酶把底物分子从溶液中富集出来，使它们固定在活性中心附近， 反应基团相互邻近，同时使反应基团的分子轨道以正确方位相互 交叠，反应易于发生。
酶和底物之间结合的作用力
静电引力—酶分子中带正或负电荷的基团与底 物分子中带相反电荷的基团相互作用
该作用力大小与正负电荷量成正比，与介电常
数成反比，在疏水环境比在亲水环境中更强。
氢键
键能高、有方向性 能诱导底物基团的价 键状态发生变形和极化
酶和底物之间结合的作用力
疏水键
蛋白质分子侧链含大量亲水性和疏水性基团。
与反应过渡态结合作用
张力学说
许多情况下，过渡态的形成与底物分子内的价键张力有关
当 R＝CH3 时，其反应 速度比 R＝H的情况快 315倍。 由于-CH3 体积比较大，与反应基团之间产生一种立体排斥张力，从而使 反应基团之间更容易形成稳定的五元环过渡状态。
与反应过渡态结合作用
根据过渡态的结构设计的过渡态类似物可作为酶的 强抑制剂，抑制效果远高于竞争性抑制剂。 利用过渡态类似物作为抗原或半抗原，去免疫动物， 由此产生的抗体可能有类似酶的催化作用。 酶与过渡态的结合主要有两种方式:非共价结合方式 和共价结合方式，后者被称为共价催化。
由于酶的构象作用，当底物和酶的反应中心结合后， 在酶的反应中心活性基团的作用和诱导下，使底物的 反应基团按照最佳方式定向和定位，大大增加反应速 率。
反应基团定向和定向程度越高，反应速率越大。反之，反 应基团定位程度低，则反应速率减小。
邻近定向效应小结
邻近定向效应是指两种或两种以上的底物（特别是双底物）同时 结合在酶活性中心上，相互靠近（邻近） ，并采取正确的空间取 向（定向） ，这样大大提高了底物的有效浓度，使分子间反应近 似分子内反应从而加快了反应速度，可使双分子反应速率提高 104～108倍。
列；
4、在酶反应过程中活性中心的这种构象的变化是可逆的，当
它与底物结合时被诱导生成一种新的构象，而当反应结束并
且产物从酶分子表面脱落下来时，又恢复了原来的构象。
三点结合理论
手性催化作用机制——三点结合理论
酶分子活性中心部位，一般都含有多个具有催化
活性的手性中心，能够识别底物分子中等价的前
手性原子或基团。这些手性中心对底物分子构型
脯氨酸消旋酶的过渡态及其过渡态类似物抑制剂
多功能催化作用
酶的活性中心部位，一般含有多个起催化作用的基 团，这些基团在空间有特殊的排列和取向，可以对
底物价键的形变和极化及调整底物基团的位置等起
到协同作用，从而使底物达到最佳反应状态。
多功能催化作用
多官能团相互作用可使反应速率提高
在α—吡啶酮存在下，O-四甲基-D葡萄糖的变旋速率可以 提高7000倍。而相同浓度的酸和吡啶则对反应影响很小
酶分子的活性中心处于一定程度的疏水环境。
活性中心的疏水键与底物分子的疏水部分结合，并且
能够维持活性中心空间结构稳定性。
酶和底物之间结合的作用力
此外，微环境也会影响酶和底物的结合 酶活性中心处于一个非极性环境中，从而有利于同底 物的结合。 （水的极性和形成氢键的能力都较强，能够减弱极性 基团间的相互作用）
取向起着诱导和定向的作用，使反应可以按单一 方向进行，不对称催化作用可以实现。 认为酶与底物的结合处至少有三点，且只有一种 情况是完全结合的形式。因此称为三点结合理论
三点结合理论
认为立体异构的一对底物，虽然基团相同，但空间排列不同。
因而与酶活性中心基团不能同时互补，只有三点都匹配互补，
才能结合而发生作用。用它来解释甘油激酶的作用。
三点结合理论
除底物的结构和酶活性中心三维空间结构互补外，在酶和 底物的性质方面也有要求。如果底物带电荷，酶的活性中心 必带相反电荷，同时底物和活性中心的极性也必然相同。
酶的催化作用机制
酶催化作用的三个学说
锁钥学说
1980年E.Fisher曾用“模板”或称“锁与钥匙”学说 （lock and
key theory)来解释酶作用的专一性
认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的，酶表面具有特定的
形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对一把锁一样
锁钥模型较好地解释了立体异构专一性。但不能解释可逆反应。
诱导契合学说
1964年Koshland提出了诱导契合学说（induced-fit hypothesis): 该学说认为酶表面并没有一种与底物互补的固定 形状，而只是由于底物的诱导才形成了互补形状。
诱导契合学说的中心思想归纳起来有以下几点
1、酶有其原来的形状，它一定一开始就是底物的模板。 2、底物能诱导酶的形状发生一定的变化 3、当酶形状发生变化以后，就能使其中的基团形成正确的排