紫外-可见分光光度法
及转化等实验中需要一定的浓度和纯度要求,因此要测定DNA的浓度和纯度。
• 组成DNA的碱基均具有一定的吸收紫外线特性,最大吸收值在波长为250~270nm之间,腺嘌呤
的最大紫外线吸收值在260.5nm,胞嘧啶:267nm,鸟嘌呤:276nm,胸腺嘧啶:264.5nm,尿嘧啶: 259nm。这些碱基与戊糖、磷酸形成核苷酸后其最大吸收峰不会改变,但核酸的最大吸收波长是 260nm,吸收低谷在230nm。这个物理特性为测定核酸溶液浓度提供了基础。在波长260nm紫外线 下,10OD值的光密度相当于双链DNA浓度为50μg/ml;单链DNA或RNA为40μg/ml;单链寡聚核 苷酸为20μg/ml。可以此来计算核酸样品的浓度。 分光光度法不但能够确定核酸的浓度,还可以通过测定在260nm和280nm的紫外线吸收值的比值 (A260/A280)估计核酸的纯度。DNA的比值为1.8,RNA的比值为2.0。若DNA比值高于1.8,说 明制剂中RNA尚未除尽。RNA、DNA溶液中含有酚和蛋白质将导致比值降低。270nm存在高吸收 表明有酚的干扰。当然也会出现既含蛋白质又含RNA的DNA溶液比值为1.8的情况,所以有必要 结合凝胶电泳等方法鉴定有无RNA,或用测定蛋白质的方法检测是否存在蛋白质。紫外分光光度 法只用于测定浓度大于0.25μg/ml的核酸溶液。
• Tips:当A260/ A280比值<1.9时,该样品可适当稀释,用饱和的酚、
氯仿、异戊醇抽一次,再用无水乙醇沉淀、抽干。
• 当A260/ A280比值大于2时,则RNA浓度过高,要去RNA
谢谢聆听
Thanks
• c为100ml溶液中所含物质的重量(按干燥品或无水物计算),g; • l(L)为液层厚度,cm。 • 上述公式中吸收系数也可以摩尔吸收系数ε来表示,其物理意义为溶液浓度c为1mol/L和液层厚度
为1cm时的吸光度数值。在最大吸收波长处摩尔吸收系数表示为εmax。
• 物质对光的选择性吸收波长,以及相应的吸收系数是该物质的物理常数。在一定条件下,物质的
分光光度计使用方法
Use method of spectrophotometer
分光光度计使用方法
①选取合适的按键
• • • •
待测定样品为dsDNA(如PCR产物),按下键“7/dsDNA”
待测定样品为ssDNA(如反转录合成的第一链cDNA产物),按下键“8/ssDNA”
待测定样品为RNA,按下键“9/RNA” 待测定样品为Oligo(如PCR引物),按下键“6/Oligo”。
紫外验原理
• 紫外-可见分光光度法是在190~800nm波长范围内测定物质的吸光度,用于
鉴别、杂质检查和定量测定的方法。当光穿过被测物质溶液时,物质对光 的吸收程度随光的波长不同而变化。因此,通过测定物质在不同波长处的 吸光度,并绘制其吸光度与波长的关系图即得被测物质的吸收光谱。从吸 收光谱中,可以确定最大吸收波长λmax和最小吸收波长λmin。物质的吸收 光谱具有与其结构相关的特征性。因此,可以通过特定波长范围内样品的 光谱与对照光谱或对照品光谱的比较,或通过确定最大吸收波长,或通过 测量两个特定波长处的吸收比值而鉴别物质。用于定量时,在最大吸收波 长处测量一定浓度样品溶液的吸光度,并与一定浓度的对照溶液的吸光度 进行比较或采用吸收系数法求算出样品溶液的浓度。
仪器分类
• 依据光谱区,分光光度计可分为:紫外分光
光度计,可见分光光度计(或比色计)、红 外分光光度计。如果吸光质点是原子,其仪 器称为原子吸收分光光度计。
• 仪器组成 • 各种分光光度计的基本组成是:光源系统、
分光系统、吸收系统和检测系统。
• 仪器精度 • 为保证测量的精密度和准确度,所有仪器应
吸收系数是恒定的,且与入射光的强度、吸收池厚度及样品浓度无关。当已知某纯物质在一定条 件下的吸收系数后,可用同样条件将该供试品配成溶液,测定其吸光度,即可由上式计算出供试 品中该物质的含量。在可见光区,除某些物质对光有吸收外,很多物质本身并没有吸收,但可在 一定条件下加入显色试剂或经过处理使其显色后再测定,故又称之为比色分析。
操作步骤
• 吸取5µ L DNA样品或4µ L RNA样品,加水至1ml混匀后,转入分光光度计的石英比
色杯中。如果样品很少,可以用0.5ml的比色杯,上述核酸样品与水的用量缩小一 半。 先用1ml水对分光光度计校正为零点。 在260nm和280nm分别读出光密度,DNA样品的浓度OD260 × 核酸稀释倍数 × 50/1000;RNA样品的浓度OD260 × 核酸稀释倍数 × 40/1000;浓度单位为μg/µ L。 按步骤1的稀释方式,DNA或RNA的浓度(μg/µ L)均为OD260的10倍;如OD260 为0.1,则样品的浓度就为1μg/µL DNA或RNA。这样稀释倍数非常便于计算。 若为DNA样品,OD260/OD280比值大于1.8,说明仍存在RNA,可以考虑用RNA酶 处理样品;小于1.6,说明样品中存在蛋白质或酚,应再用酚/氯仿抽提,用乙醚抽 提后,以乙醇沉淀纯化DNA。RNA样品OD260/OD280比值小于2,也应该考虑再 用酚/氯仿抽提。
按照国家计量检定规程,定期进行校正检定。
分光光度法测定DNA的浓度和纯 度
Determination of DNA concentration and purity by spectrophotometry
分光光度法测定DNA的浓度和纯度
• 在实验过程中,很多时候提取得到的DNA的浓度和纯度都是未知的,在后续的DNA酶切、连接
②将空白对照置入样品孔。
• 注意:空白对照是空白液,并非所有情况都是水。例如,用Tris溶液溶解DNA样
品,则要用Tris液做空白对照。
分光光度计使用方法
• ③按下 “Blank”键。仪器记录空白对照,设置为0.000A。 • ④将样品置入样品孔,按下“Sample”键,仪器显示样品的吸光度
和浓度值,以及其他相关参考比值。
• 单色光辐射穿过被测物质溶液时,在一定的浓度范围内被该物质吸收的量与该物质的浓度和液层
的厚度(光路长度)成正比,其关系可以用朗伯-比尔定律表述如下:
• • • •
A=lg 1/T=Ecl
A为吸光度; T为透光率; E为吸收系数,常用的表示方法 ,其物理意义为当溶液浓度为1%(g/ml),液层厚度为1cm时的吸 光度数值;