间充质干细胞来自于中胚层，具有干细胞的一般特性，如自我更新的能力以及多项分化的潜能，在适宜的条件下，间充质干细胞可以分化为成骨细胞、软骨细胞、心肌细胞、神经细胞、脂肪细胞等的潜能。

同时间充质干细胞能表达各种细胞因子、生长因子受体，并能产生各种细胞因子、生长因子和细胞外基质蛋白（如纤维连接蛋白、波形蛋白、层粘连蛋白）以及免疫抑制分子以及细胞凋亡抗体。

间充质干细胞可以介导损伤修复。

间充质干细胞还具有其他的一些特性，包括促进血管内皮细胞的迁移以及增殖，促进造血，免疫调节性，以及受损组织部位以及肿瘤微环境的趋向性，这一特性也为肿瘤的靶向治疗提供了新的可能。

间充质干细胞与肿瘤的关系较为复杂，既有促进肿瘤生长的作用，同时也有研究表明，间充质干细胞对肿瘤组织具有抑制作用。

间充质干细胞正常情况下，在体内可向多种组织移动，主要移动至骨髓。

当创伤存在时，则被“损伤信号”招募至炎症部位，以促进损伤的修复。

在肿瘤的生长中，同样可以产生各种可溶性细胞因子，促使MSC向肿瘤组织移动。

在恶性肿瘤的生长过程中，不但肿瘤组织周围血管内皮细胞通过出芽的的形式参与肿瘤的血管生成，间充质干细胞还可以通过诱导产生连接蛋白，增加微血管的完整性，来自于骨髓的间充质干细胞也可以形成内皮细胞、平滑肌细胞等参与肿瘤的血管生成。

间充质干细胞还具有“免疫豁免”作用，能够抑制免疫细胞的增值和活化，有利于肿瘤的免疫逃逸和生长。

这些因素都有利于肿瘤组织的生长。

同时间充质干细胞还具有抑瘤作用。

间充质干细胞可以直接抑制肿瘤的生长，并可以诱导肿瘤细胞产生细胞周期负调节蛋白，将肿瘤细胞暂时抑制在G0/G1期，同时可以下调凋亡因子促进肿瘤细胞的凋亡，而且能够通过分泌抑制因子，抑制肿瘤恶性表型，抑制肿瘤的增殖。

间充质干细胞还具有抗原提呈的作用，诱导机体免疫细胞对肿瘤的杀伤。

间充质干细胞还具有恶变的可能性，间充质干细胞具有强大的自我更新能力以及无限增殖潜能，在体外长期培养过程中出现基因的不稳定性，可自发转化为致瘤干细胞，猜想间充质干细胞可能是肿瘤干细胞的来源之一。

间充质干细胞主要参与黑色素细胞瘤黑色素瘤血管的生成。

黑色素瘤细胞B16和骨髓间充质干细胞（BMSCs）相互作用，使BMSCs获得内皮细胞表型（VEGFR-1、VEGFR-2、FactorVIII），同时B16细胞液出现了VEGF-a、VEGFR-1、VEGFR-2、FactorVIII的表达，并且二者可以相互促进加快增殖的速度。

间充质干细胞现主要来源于骨髓、脐血，由于骨髓来源的间充质干细胞采集较为困难，且体外培养的增殖能力，脐血来源的要强于骨髓来源的间充质干细胞。

脐血来源的间充质干细胞在临床肿瘤的治疗中可能会有更广泛的应用。