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文档之家› 第4章 化学软件ChemOffice
第4章 化学软件ChemOffice
•文件命令对话框
图4-4 文件命令的对话框
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(2)
主 工 具 图 标 板
图 4-5主工具图标板
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4.3分子模型及仿真软件Chem3D
4.3.1 主界面
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4.1概述
ChemOffice软件是由剑桥化学软件公司开发的集成化 学软件桌面系统,集成了Chem3D、ChemDraw、 ChemFinder和ChemInfo,以及Chem TableEditor等软件, 具有强大的高端开发功能。 ChemDraw Ultra 8.0 化学结构绘图 Chem3D Ultra 8.0 分子模型及仿真 ChemFinder Pro8.0 化学信息搜寻整合系统 E2Notebook Ultra8.0 BioAssay Pro8.0 量化软件MOPAC、Gaussian 和GAMESS 的界面 ChemSAR Server Exce ClogP,CombiChemPExcel
双击需要改变元素符号的原子,弹出输入框,输入元素符号,按回车 键完成原子序号的更改。若原子的三维结构中显示孤对电子,执行关闭 “Tools”菜单中的“Show H’s ans Lp’s”命令,可不显示氢原子和孤对电子。
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4.3.2 3D模型绘制与编辑
(1)利用键工具建立模型 (2)利用文本工具建立模型
图 4-26胡萝卜素立体分子模型
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(3)利用子结构建立3D模型
子结构模型库
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•结构的复制及旋转
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• 两个结构的连接
连接前的胡萝卜素结构
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辑、翻转、旋转、缩放、存储、复制、粘贴等多种操作。 用它绘制的图形 可以直接复制粘贴到Word 软件中使用。 最新版本的软件还可以生成分子模型、建立和管理化学信 息库、增加了光谱化学工具等功能。
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OH
OOCCH3
(CH3CO)2 70° C80° 15min水浴 C
COOH COOH
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图4-18复制修改得到的乙酰水杨酸结构式
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主 工 具 图 表 板
图 4-6主工具图表板的子图标板
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4.2.2模板
图4-7 模板工具图标板示例
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点位位于一键的起点(显示小蓝块),沿键拖动会产生重键。
点位为于键中间,单击同样可以产生重键(三键点击后变单键)。
②元素符号的输入:
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图4-9官能团或元素符号的输入
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③ 键及元素文本属性的设置:
图4-2 ChemDraw的菜单栏
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“File”菜单命令
图4-3 文件命令的下拉菜单
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(4) 使用模板建立3D模型
利用模板建立富勒烯 3D模型
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(5)改变元素序号与替换元素 改变元素序号:
首先选中模型。执行“Edit”菜单中的“Select All”命令或ctrl + A快捷键;
然后整理结构,执行“Tools”菜单中的“Clean Up Structure”菜单命令。 使用垂直工具栏中 的工具,双击需要改变序号的原子,弹出输入框,
输入原子序号,按回车键完成原子序号的更改。
改变元素:
图4-13 连接点及单键的产生
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图4-14 长链的生成
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4.3.3ChemDraw结构式与3D模型的转换
(1)ChemDraw结构式转换为3D模型
(2)直接打开ChemDraw文件
(3)3D模型转换为平面结构式
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图4-10 目标设置窗口
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(2)环工具:主工具面板中提供了10种
环工具命令,其中在模板命令中还有芳香 化合物模板和双环模板可以绘制环状化合 物。
•环的绘制 •环的连接
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(2)方程式的建立
•箭头的选择 •利用绘图工具选择合适的阴影框罩住方程式
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(3)化学反应方程式绘制举例
乙酰水杨酸又称为阿司匹林,为常用的退热镇痛药物。制备乙酰水杨酸 最常用的方法是将水杨酸与乙酐作用,生成乙酰水杨酸。
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面板中选取相应的环命令后,直接在绘制区点击可产 生相应的环。点住鼠标左键不放,拖动鼠标可以对环的 大小,放置的角度进行自由改变。 环己烷的椅式构型直接点击为水平放置,按Shift键点 击可由水平变为垂直。 在面板中任选一环命令,按Ctrl键点击,可以在环中 产生不定域共轭圈。
4.2.4化合物结构与命名
4-17命名示例图示表
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4.2.5绘制化学反应方程式
(1)反应物结构式的绘制 • 普通分子结构的绘制
• 离子结构的绘制 • 中间体结构的绘制 • 立体结构的绘制
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4-19 乙酰水杨酸合成反应方程式
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图4-20符号窗口
图4-21 字体选项
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(3)链工具
① 链的绘制
选取长链工具,在需要进行的连接原子或环上点击或拖动可产生链; 同时弹出链长对话框,可以选择增长链的长度。
图4-11链长对话框
② 链属性的设置
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4.2 化学结构绘图软件ChemDraw
ChemDraw 软件功能十分强大,可以编辑、绘制与化学 有关的一切图形,如建立和编辑各类分子式、方程式、结
构式、立体图形、对称图形、轨道等,并能对图形进行编
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第4章 化学软件ChemOffiDRAW
4.3分子模型及仿真软件CHEM3D
4.4化学信息搜索引擎CHEMFINDER
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选择键命令或环命令,直接在环的任何一个节点处点击 或拖动可以实现键的连接或环与环的点连接。
选择环的一个节点,按住鼠标左键,从一个节点拖至另 一个节点,可以实现环与环的双点连接。 元素符号的输入与目标参数的设置与键操作类似,同样 在“Structure”菜单中可以对选择的键的属性进行设定。
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