检测手段
点突变
原位荧光杂交 不可以
第一代测序
可以
片段变异 灵敏度
>1 kb
高
可以
15-20%
优缺点
只能检测已知的融合 基因
灵敏度低，一次检测 一个基因
• 第一代测序检测不到低频突变，假阴性率高 • 一次只能测一个基因 • 所需样本量大，穿刺样本耗尽，患者失去其它基因检测和个体化治疗的
机会
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第二代测序
靶向药 吉非替尼，厄洛替尼，埃克替尼 西妥昔单抗，帕尼单抗，尼妥珠单抗 伊马替尼，舒尼替尼 维罗菲尼，达拉菲尼 克唑替尼，色瑞替尼
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EGFR-TKI药物与EGFR基因敏感性突变
• 埃克替尼的适应症
• 本品单药适用于治疗表皮生长因子受体（EGFR）基因敏感 突变的局部晚期或转移性非小细胞肺癌（NSCLC）患者的 一线治疗
伊马替尼治疗前 伊马替尼治疗1个月
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产品简介
通过第二代测序检测患者肿瘤组织和正常组织的88个基因，找出体细胞突变和
某些多态性位点，结合患者的其他临床信息，借助晶云的药物基因组知识库和大数据 算法，为医生提供最优的用药方案参考。
药物基因 组知识库
基因突变 及多态性
个性化
用药分 析报告
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为什么是88个基因
肝细胞癌
5-15%
2-4
6-9
胆管癌
15-25%
2-4
6-9
Medical College of Wisconsin #099 Chemotherapy: Response and Survival Data,
Author(s): David E Weissman, Charles F von Gunten, April 2009.
• 国内外药物临床试验数据库
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个性化用药分析报告
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临床分析报告中的三大内容
• 推荐合适的靶向药、化疗药 • 提醒靶向药原发性耐药 • 推荐患者参加国内外药物临床试验
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推荐合适的靶向药
靶标 EGFR KRAS, BRAF ,PIK3CA KIT, PDGFRA BRAF ALK, ROS1, MET
• 不推荐本品用于EGFR野生型非小细胞肺癌患者
• 埃克替尼的用药问题
• 10% EGFR基因敏感突变的患者原发性耐药
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靶向药原发性耐药提醒
• EGFR-TKI药物原发性耐药的机制
• EGFR T790M • ALK基因重排 • RAS基因突变 • BRAF基因突变 • PTEN基因突变
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推荐合适的化疗药
• 药物基因组数据库、文献挖掘
• 国内外靶向药伴随诊断的基因 • 化疗药代谢有关基因 • 化疗药有效性的标记基因 • 国内药物临床试验入选标准中提到的基因 • 文献中报道的可能耐药基因
14
自主研发的药物基因组知识库
• 基于PharmGKB、SNPedia数据库，加上文献挖掘， 收录对药物在人体内吸收、代谢、疗效及不良 反应产生影响的基因变异
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ERCC1, CDA多态性与铂类药物使用
CDA 基因
肺癌患者 ERCC1基因
CDA 基因
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推荐患者参加国内外药物临床试验
23Biblioteka 务流程• 肿瘤组织样本 • 第二代测序法 24
感谢
25
26
27
肿瘤组织样本要求
一、石蜡组织标本
①手术样本（大样本）：切片25张以上（防脱玻片），厚度5μm，肿瘤细胞占比≥50%， 坏死组织区域＜10%；
5
药物不良反应—严重
• 占据全球主要死亡原因第4-6位 • 我国因药物不良反应住院人数250万/年 • 因药物不良反应死亡人数约20万/年
6
循证医学模式下的抗肿瘤用药
➢ 以群体医疗数据 为依据，其实存 在个体差异；
➢ 治疗方案的选择 依据的是肿瘤的 解剖学部位，应 着重考虑同一肿 瘤的基因差异；
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临床中使用的个体差异检测手段
检测技术
药物
荧光原位杂交
伊马替尼
第一代测序
西妥昔单抗，帕尼单抗
IHC3+或IHC2+/FISH+ 第一代测序
曲妥珠单抗
吉非替尼，厄洛替尼， 埃克替尼
检测基因/蛋白 BCR-ABL基因融合 KRAS基因突变 HER2过表达 EGFR 基因敏感突变
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传统基因检测方法的临床局限性
穿刺样本（小样本）：切片35张以上（防脱玻片），厚度5μm，肿瘤细胞占比≥50%， 坏死组织区域＜10%。
②切片时注意对切片机及台面进行消毒处理，不同样本更换新刀片，防止交叉污染。 ③切片时摊片即可，无需烤片处理，切片编号规范清晰。 ④为保证石蜡标本DNA提取的成功率，请尽可能送检1年以内的蜡块或6个周以内的石 蜡切片。 ⑤标本存放于塑料玻片盒中，4-8℃保存、运输。
第一代测序
第二代测序
灵敏度低，15-20% 一次测序检测一个基因
灵敏度高，0.5% 一次测序检测多个基因，
美国第二代测序临床应用--举例
临床病历资料 女性， 58岁，病理诊断为转 移性胸腺癌； 胸腔和肝内病灶增大迅速
基因检测结果 KIT基因突变（在此种肿瘤非 常罕见）
临床治疗 KIT蛋白激酶抑制剂伊马替 尼，一天一次，连续1月 RECIST标准疗效评价，SD （疾病稳定）
检测靶标 ERCC1,BRCA1,XRCC1,ERCC2,GSTP1 TYMS,DPYD,MTHFR RRM1,CDA MTHFR,DHFR TYMS UGT1A1 TOP2A,CYP3A4 CYP2C9,CYP2C19 NQO1 TOP2A,GSTP1
药物 顺铂，卡铂，奥沙利铂 氟尿嘧啶，卡培他滨 吉西他滨 甲氨蝶呤 培美曲塞 伊立替康，托泊替康 依托泊苷，替尼泊苷 环磷酰胺，异环磷酰胺 丝裂霉素 多柔比星，表柔比星
肿瘤基因检测与个体化用药
精准医学研究所 洛阳中科信息产业研究院
肿瘤防治形势-----严峻
我国每年新发肿瘤病例约为：
2012中国肿瘤登记2 年报
肿瘤三大治疗手段
约90%肿瘤患者在治疗过程中会用到抗肿瘤药物
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抗肿瘤药物使用原则
有效（**肿瘤治疗指南，推荐治疗方案） 低毒（病人身体情况） 经济
卫计委《抗肿瘤药物临床应用指导原则》
不同肿瘤药物疗效比较
肿瘤类型
反应率 反应持续时间（月） 生存期（月）
乳腺癌
25-55%
6-12
结肠癌
25-35%
6-8
食管癌
30-50%
4-6
24-36 12-18
6-9
非小细胞肺癌 20-30%
4-6
6-9
胃癌
20-50%
4-6
6-12
黑色素瘤
15-25%
4-6
6-9
胰腺癌
10-25%
3-5
6-9