小规模纳税人增值税申报流程系统登录输入网址：/newtax/后界面进入网上办税厅系统登录界面，如下图：用户输入用户名、密码和验证码后回车或点击登录，系统将根据填写的用户名、密码和验证码验证用户。
若用户是第一次使用本系统，通过验证后系统会自动打开《江苏省国家税务局网上办税厅使用协议》界面，如下图：用户查看后选择“我接受”或“我不接受”选择框，点击“确定”按钮；当选择“我接受”选择框时，系统将导入“企业纳税人基本信息核对表”界面：核对纳税人基本信息并按照要求勾选后，点击“信息一致”或“信息不一致”按钮。
1.当点击“信息一致”按钮后，系统弹出提示窗口如下图：按照提示点击“确定”或“取消”按钮，当用户点击“确定”按钮后，系统导入登录成功首页，如下图所示，当点击“取消”按钮，系统将关闭提示框。
2.当点击“信息不一致”按钮后，系统弹出提示窗口如下图：勾选不一致的项后，点击“信息不一致”按钮，系统弹出提示窗口，如下图：用户点击确认，系统将用户选择的信息不一致信息提交到系统内保存，供税务干部参考并导入登录成功首页。
当用户选择“我不同意”选择框：点击确认按钮后，系统弹出对话框：用户根据提示选择“确定”或“取消”按钮，当选择确定按钮后，系统导进入登录成功界面，但不能进行任何网上申报和申请的涉税事宜。
当用户输入的用户名和密码不符，或验证码不符时，系统将提示用户错误，并导向重新登录界面，如下图：注意：若长时间打开界面，但未登录需要登录时，先点击“看不清楚换一张”重新产生验证码后再填验证码，否则会提示“验证码错误，请重试”。
登陆成功后，可单击各项菜单进入相应模块进行相关操作。
系统退出用户登录后若想退出本系统，在刚登录成功的界面上，点击“安全退出”超链接，或在其他界面时，点击菜单上的“主页”超链接，界面会导入刚登录成功后的界面，用户点击“安全退出”超链接。
点击“安全退出”超链接后，系统出现以下界面：表示用户已退出/注销成功，可重新登录。
输入所属期并申报初始化登录后点击“我要申报”按钮，如下图：进入所属期选择页面，如下图：网上申报左边菜单有五个功能。
“更换所属时期”指在其他功能界面时可直接点击该链接，界面将导向更换所属时期的界面，如图所示；用户在该界面上重新选择所属年月后，点击确认可以重新打开新申报所属期的申报界面。
“网上申报说明”是对网上申报操作过程的简要说明，能指引用户快速、正确的使用本系统。
“常见问题解答”是对在使用过程中经常遇到的问题解答后的记录，便于用户在遇到问题时能快速找到解决方法。
“封面汇总打印”用于打印纳税人纳税申报资料封面。
“退出网上申报”用于用户退出本系统的申报功能，返回到主页上。
填写正确的所属期年份和月份（如果是企业所得税季度申报，按季度在月份栏输入3、6、9、12；企业所得税年度申报，月份输13），按“确定”按钮继续，系统将进入纳税申报功能。
进入纳税申报功能界面时，若本所属时期用户是第一次进入，系统将自动进行本申报期数据的初始化工作。
初始化时系统会根据税务机关对用户应申报报表的鉴定信息来生成应申报报表，初始化完成后，界面会显示该所属期的申报初始化结果。
如下图：注意：在初始化时，如果出现“你的电子申报方式鉴定错误，请联系税务局”或者“你的企业没有做应申报表鉴定，请联系税务局。
”或“你的企业没有做电子申报方式鉴定，请联系税务局”时，用户可以打电话与本单位所属国税机关进行联系。
在初始化的同时，会将用户当月的金税认证数据自动导入到增值税抵扣明细表中。
初始化成功后点击“返回”进入申报报表填写界面。
如下图：申报的主界面将按报表类型进行分类，列出用户所有应申报报表。
列表中标出编号、报表名称、报表类型、所属时期、填报日期和状态信息。
用户通过“操作”列的链接可以对各报表进行各种操作；通过“打印”列的链接可以打印相应报表。
其中状态分为“未填写”、“暂存”、“已填写”、“申报成功”、“申报失败”、“需修改后重新上报”、“申报被作废，需重新申报”和“空申报”8个状态。
“未填写”――报表刚创建时的缺省状态；“暂存”――在用户报表填写完后按“暂存报表”后的状态；“暂存报表”不对表的逻辑关系审核，但是状态为暂存，该状态下的报表不能“向税务机关申报”；“已填写”――表示用户的报表已填写完毕，可以“向税务机关申报”；“申报成功”――表示用户已向税务机关申报成功；“申报失败”――表示用户申报有错，需要重新向税务机关申报；“空申报”――表示用户的本张报表没有数据，将以空白的数据向税务机关申报。
“空申报”操作只能在有明细记录的报表上进行，比如增值税抵扣明细表（012），普通发票销售明细表（013）。
“操作”列中包括“创建”、“修改”和“浏览”。
“创建”――报表还未填写时的缺省操作，表示用户的表是新建的，若创建报表时页面上出现“用户没有此报表必须的相关税种鉴定，请联系相应税务机关”，说明用户没有此种报表的税种鉴定，这时需要用户联系税务机关；“修改”――该表已经创建，并还没申报，可以修改；“浏览”――该报表已经申报，不能修改。
“申报被作废，需重新申报”——表示该报表申报后已作废，本期需要重新申报。
创建或修改普通发票销售明细表点击“普通发票销售明细表（013）”栏的“创建”或者“修改”进入，如下图：①创建空表：如果当月无普通发票数据，则点击页面左面菜单栏中的“本表为空”，然后再点击“返回”即可。
②新建发票：如果还有普通发票或无发票视同销售的，则点击页面左面菜单栏中的“新建发票”，这时出现一个发票录入界面，然后把发票内容逐项录入：A、“发票说明”中可点击“小三角”出现下拉菜单后选择相应的类别。
B、“发票字轨号”在录入普通发票销售明细表（编码为013）时，需要录入发票字轨号而不是发票类别，发票字轨号为发票左（右）上角或右上角的12（或10）位数字（若是其他发票或未开票销售以及视同销售，仍然输入9999）。
C、“发票号码”中一定要录入十位数，其构成是发票票面中的年份数的后两位（如“02”、“03”）加上发票号码，如果位数不足十位则中间加“0”凑足（可参考“普通发票领购卡”）。
D、“截止号码”系统自动显示。
E、“开票日期”可点击右面“小三角”后选择，也可直接输入，格式为“xxxx—xx—xx”。
F、“购货方税号”可不录。
G、“购货方单位名称”录入购货方名称。
H、“购进货物名称”中录入所购货物名称。
Ｉ、“销售额”中一定要录入不含税销售额。
Ｊ、“税率”栏中如果系统自动显示的税率与你所适用的税率不符，可修改。
注意如果你开具的普通发票是免税的，则在第一栏“发票说明”中选择“免税销售额（普通发票）”，其它项不变，即“销售额”中也要录入不含税销售额，“税率”栏中是你的适用税率。
K、“税额”栏是系统自动计算的，如果尾差在1—2分之内可修改。
L最后点击“保存发票”，录第二张。
M、如果是作废发票，则“发票说明”中录入“33”，然后录入“发票名称”、“发票号码”及“开票日期”，其它项可不录。
注意：对于防伪税控系统中开具的增值税普通发票，也应该在013报表中录入，但可以通过连号形式录入，若是有分段号码，请分段录入，通过自动生成，此数据会自动进入增值税一般纳税人申报表。
如下图：销项发票全部录入后（即最后一张普通发票录完点击“保存发票”后），或者销项发票导入后，点击页面左面菜单栏中的“返回”，然后再次核对页面表格底部的发票张数、金额、税额及废票张数等，确认无误后，再点击菜单栏中的“返回”，回到申报的主页面。
特别注意：手工录入销项发票必须一张一张录入，如果是四幅（就是一个发票号码有四张发票）的，则把这个号码的四张发票合计录入。
另外，发票起始号码与截止号码之间不能相差超过3万，一旦超过，可以分成多条记录分别录入。
③修改发票：修改已经录入的发票，或者删除已经录入的普通发票。
如果是导入的普通发票，用户不能修改，也不能删除，但如果导入发票的发票说明有误，用户应该在修改列表中修改其发票说明，一般导入后，增值税发票的发票说明是“01应税货物销售(增值税专用发票)”，可以修改成其他的，比如“11应税劳务销售(增值税专用发票)”。
普通发票导入后的发票说明是“02应税货物销售额(普通发票)”，用户也可以修改成其他的，修改后，按确认保存，如果用户数据很多，并且是分面显示的，可以选择“不分页”。
由此可以一次改完，一次保存，也可以在一页上修改后，按确定保存后，按下一页继续修改保存。
若是自动导入的普通发票，则可以对“发票说明”和“税率”两个数据项进行修改。
如下图：界面各部分说明如下：A、录入（导入）的发票明细列表，系统会自动根据发票明细的多少决定是否分页显示（小于系统预设定的某个值（例如50），将不会分页显示），上图为分页显示的状态，显示出来的只是某页的数据；B、通过“7”的查找功能找到的发票信息，并对起始号码进行了加亮显示；C、分页显示时，在各页间浏览的导航按钮；D、显示一共分了几页；E、在各页间跳转的工具，通过下拉框的选择可直接跳转到该页，而不用通过“3”中的导航按钮逐页浏览，同时这里显示出来的页码就是当前页的页码；F、通过下拉框的选择可自行定义每页显示多少条发票明细，或者选择不分页；G、查找功能，通过输入起始发票号码，直接在各页中定位到该发票明细信息，如“2”系统会自动对找到的发票明细信息的起始号码进行加亮显示；可以直接输入发票起始号码的非零部分，系统会自动补零，如下图，可直接输入“267”；注意系统只会找到第一条满足查询条件的发票明细信息，若有两条号码相同，但发票种类不同的发票明细信息，则需要在发票起始号码前加上发票种类，并用半角的“,”分开，如下图，需要输入“2152,0000000267”或“2152,267”以实现精确查找；若找不到满足条件的发票明细信息，系统会自动跳到第一页；H、这里显示的是所有发票明细的统计信息，注意，这不是该页面的小计信息。
普通发票销售明细表（013注：在税务机关代开发票的销售额和预缴税额由系统自动导入，不得修改。
资产负债表点击报表后面操作列中的“创建”进入报表填写界面，如下图正确填写报表资料点击“保存报表”图利润表点击报表后面操作列中的“创建”进入报表填写界面，如下图填写报表资料点击“保存报表”，中途退出点击“暂存报表”，全部操作完毕点击“返回”，如下图对填写的所有报表进行修改和检查向税务机关申报某组报表前的选择框表示用户是否想将该组报表向税务机关申报。
并且该选择框只有在这组报表的每一张报表的状态为“已填写”或“申报失败，需修改后重新上报”或“申报成功，但仍需上报”或“空申报”时才能被选中，如果报表组中有报表状态为“未申报”、“暂存”，“申报成功”将无法选中。
按下“正式提交申报”后，系统将会提示用户检查用户的表的数据是否正确，还有表之间的数据是否正确，以及表与机内的数据是否正确，如下图：如果系统审核不正确，将显示出错信息。