2、DNA链的问题
①正链=编码链=有意链=非模板链
负链=非编码链=反义链=模板链
②与转录模板互补的那条DNA链称为非模板链,有意链,编码链(遗传信息存在这条链上)
③mRNA的转录并不总是以一条DNA链为模板的,某些基因以DNA双链中的一条为模板链,而另一些基因则以双链中的另一条为模板,也就是说,没有绝对的模板链,DNA双链都可以作为模板链。
3、上下游引物问题
①一般给你碱基序列的那条模板,假设为A链,它的互补链是B链。
第一次延伸:上游引物是识别B链往下延伸的,它延伸出来的碱基序列跟A链一样。
下游引物是识别A链往下延伸,它延伸出来的序列跟B链一样。
5'----------------3’A
3------5 上游引物
下游引物5------3
3'----------------5'
第二次延伸:新合成的链同原始的模板一样也可作为模板扩增。
②DNA复制总是从5’端到3’端,因为DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。
所以谁先复制谁就是上游,往后的就是下游,上游下游是个相对概念,是某一个序列/碱基相对于另一个序列/碱基而言。
DNA是双链,两个链是反向平行的,DNA聚合酶顺着其中一个链走,这个链就是负链,另一个链是反着一段一段复制的,这个是正链。