基层检察院内设多个机构，各负其责。侦查监督科主要刑事立案监督和侦查活动监督。公诉科则负责对公安机关和本院侦查部门移送的案件进行审查，决定是否提起公诉或不起诉，并监督侦查活动和审判活动的合法性。林业检察科和反贪污贿赂局则分别负责办理发生在本辖区内的贪污贿赂等职务犯罪案件的侦查工作。反渎职侵权局则负责处理国家机关人员滥用职权等行为。职务犯罪预防部门则致力于研究、分析职务犯罪预防工作，提出预防对策。控告申诉科负责接待来访群众，处理控告、申诉案件。民事行政检察科则依法对人民法院的民事审判活动和行政诉讼活动进行法律监督，维护司法公正。