主要培养基:10×YNB(13.4%酵母氮源,含硫酸铵不含氨基酸):溶解13.4gYNB于100mL水中,过滤除菌,加热至YNB完全溶解,存于4℃。
500×B(0.02%生物素):溶解20mg生物素于100mL 水中,过滤除菌,放于4℃。
100×AA(0.5%各种氨基酸):溶解各50mg L-谷氨酸,L-蛋氨酸,L-赖氨酸,L-亮氨酸,L-异亮氨酸于100mL 水中,过滤除菌,存于4℃。
10×D(20%葡萄糖):溶解200g D-葡萄糖于1 000mL水中,高压灭菌15min或过滤除菌,可放1年。
500×生物素(0.02%):溶解20mg生物素于100mL水中,过滤除菌,放于4℃,可放1年。
100×H(0.4%组氨酸):溶解400mg L-组氨酸于100mL水中,低于50 度加热以促溶解,过滤除菌,可放1年。
10×M(5%甲醇):混合5mL甲醇与95mL水,过滤除菌存于4℃,可放2个月。
10×GY(10%甘油):混合100mL甘油与900mL 水,过滤或高压灭菌,室温放置,可存放1年以上。
100×AA(0.5%各种氨基酸):溶解各50mg L-谷氨酸,L-蛋氨酸,L-赖氨酸,L-亮氨酸,L-异亮氨酸于100mL 水中,过滤除菌,存于4℃,可放1年。
1mol/L磷酸钾缓冲液pH6.0:32mL 1mol/L K2HPO4,868mL 1mol/L KH2PO4,调整pH值为6.0±0.1(如果需调pH值,用磷酸或KOH)。
过滤或高压灭菌,室温下可放1年以上。
100mg/mL遗传霉素:用无菌水制备30mL 100mg/mL 遗传霉素贮存液,过滤除菌,存于-20℃。
用来制备含不同终浓度遗传霉素平板:0.25,0.5,0.75,1.0,1.5,1.75,2.0,3.0,4.0。
LB培养基:5%酵母提取物,10%胰蛋白陈,10%NaCI,pH7.0;高压灭菌后4℃保存。
LB平板培养基在LB液体培养基中加入琼脂粉15g,高压灭菌,冷却至45℃左右时倒平皿,4℃保存。
LA平板培养基待LB液体培养基冷却至45℃左右加入Amp (100μg/mL),摇匀后倒平皿,4℃保存。
YPD培养基:1%酵母提取物,2%胰蛋白膝,2%葡萄糖;RDB转化固体培养基:(Regeneration Dextrose Medium+ Histidine)(lmol/L山梨醇,l%葡萄糖,1.34% Yeast Nitrogen Base with Ammonium Sulfate with amino acids(YNB),0.00004%Biotin,0.005%谷氨酸,0.005%甲硫氨酸,0.005%赖氨酸,0.005%亮氨酸,0.005%异亮氨酸,1.5%琼脂;)100mL:超纯水80ml,山梨醇18g(186g/L),琼脂糖2g(20g/L)121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 10ml, 10*D(20%葡萄糖)10ml, 500*B(0.02%生物素)0.2ml 100*AA(含每种氨基酸0.5%)1ml.混匀,倒平板。
YPD-遗传霉素平板:1%酵母浸出物,2%蛋白胨,2%葡萄糖,2%不同量的遗传霉素4.0,250mL (8-10个遗传霉素平板)。
取1g G418溶于1ml 1M的HEPES液或PBS中,加蒸馏水至10ml,过滤消毒,4度保存。
具体方法如下:1g包装的G418瓶子中,加入10ml HEPES溶液,浓度为100 mg/ml完全溶解后,0.22 um过滤,-20度保存。
HEPES缓冲液配方如下:90 ml 水中,0.8 g NaCl, 0.037 g KCl,0.0135 g Na2HPO4.2H2O, 0.1 g 葡萄糖,0.5 g HEPES,溶解,NaOH调PH至7.05,定容至100ml。
0.50mg/ml,0.75mg/ml,1.0mg/ml,2.0mg/ml,4.0mg/ml五个梯度MD:选择培养基:(Minimal Dextrose Medium+ Histidine) (1.34%YNB,0.00004%Biotin,2%葡萄糖,1.5%琼脂;)100mL:向80 mL 超纯水中加入琼脂糖2g(20g/L),121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 10ml, 10*D(20%葡萄糖)10ml, 500*B(0.02%生物素)0.2ml,混匀,倒平板。
MM:选择培养基:(Minimal Methanol+ Histidine )(1.34%YNB,0.00004%Biotin,0.05%甲醇,1.5%琼脂;)100mL:向90 mL 超纯水中加入琼脂糖2g(20g/L),121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 10ml, , 500*B(0.02%生物素)0.2ml,5mL甲醇混匀,倒平板。
BMGY:诱导表达培养基(Buffer Glycerol-complex Medium)(1%酵母提取物,2%蛋白陈,100mmol/L磷酸缓冲液(pH6.0),1.34% YNB,0.00004% Biotin,l%甘油(V/V);)1L:酵母提取物10g/L,蛋白胨20g/L,K2HPO4 3g/L,KH2PO4 11.8G/L,超纯水890Ml,121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 100ml, 500*B(0.02%生物素)1ml,甘油10mL。
BMMY:诱导表达培养基(Buffer Methanol-complex Medium) 除以0.5%甲醇代替甘油,其余成分与BMGY相同。
1L:酵母提取物10g/L,蛋白胨20g/L,K2HPO4 3g/L,KH2PO411.8G/L,超纯水895Ml,121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 100ml,500*B(0.02%生物素)1ml,5mL甲醇。
主要溶液2*SDS样品缓冲液:25mL 4*Tris•HCl,PH6.8(0.lmol/L) 20mL甘油[20%(w/v)]4g SDS[4%(w/v)] 2mL2-巯基乙醇或3.1g DTT1mg溴酚兰[0.001%(w/v)]加蒸馏水至l00mL并混匀,等量分装成lmL于-70℃贮存。
5*SDS电泳缓冲液:15.lgTris碱(0.125mol/L) 72.0g甘氨酸(0.96mol/L) 5.0g SDS[0.5%(w/v)]使用前稀释至1XSDS电泳缓冲液,贮存液不必调教pH值,稀释后溶液pH8.3,使用前于0-4℃保存。
考马斯亮兰染色固定液:50%(v/v)甲醇10%(v/v)乙酸40%重蒸水染色液:50%(v/v)甲醇0.05%(v/v)考马斯亮兰R-25040%重蒸水10%(v/v)乙酸配制时先用甲醇溶解考马斯亮兰,再加入乙酸和水。
溶液可保存6个月,若出现沉淀,滤除即可。
脱色液:7%(v/v)乙酸5%(v/v)甲醇88%重蒸水一、大肠制备感受态细胞需灭菌的设备大离心管:小离心管:50ml大枪头5mlLB培养基:10%甘油1 挑单个大肠接入LB液体培养基,培养过夜37℃摇床,并做抗性对照。
2以1:100比例接菌,进行大摇(2ml接入200ml 培养基中37℃摇床)3OD达到0.5-0.7时,冰上放置20min。
4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余4加入等体积的10%甘油轻轻重悬。
4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余5加入1/2体积的10%甘油轻轻重悬。
4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余6加入1/4体积的10%甘油轻轻重悬。
4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余7加入适量灭菌10%甘油,一般500ml菌液加入2ml甘油,重悬,8分装,每管40ul,先冻与液氮,然后放入-80℃保存二、毕赤酵母GS115电转化感受态的制备1.在含5mLYPD的50mL 离心管中,培养P. pastoris,30℃过夜;2.取0.1-0.5mL过夜培养物,接种含50mL新鲜培养基的摇瓶,过夜生长至OD600=1.3-1.5;3.在4 ℃,1 500 r/min离心5min收集细胞,用5mL预冷的灭菌水悬浮细胞;4.如上离心,用5 mL预冷的灭菌水悬浮细胞;5.如上离心,用2mL预冷的1mol/L山梨醇悬浮细胞;6.如上离心,用1 mL 预冷的1mol/L山梨醇悬浮细胞,至终体积约1.5mL(可冻存80μL等量的电感受态细胞,但转化效率会下降很多)。
三、毕赤酵母电转化1.取80μL上述细胞与5-10μL经S线性化DNA(约5-20ug)混合,转入预冷的0.2cm 电转杯中;2.在冰上放置5min;3.根据所使用装置推荐的S. cerivisiae参数进行电击(1 500V,5ms);4.立即加入1mL 预冷的1mol/L山梨醇至杯中,将内容物转移至灭菌离心管中;5.分成200-600μL等份,涂于RDB平板上,进行His营养缺陷筛选;6.在30℃孵育平板3-5d,至His+克隆产生。
四.G418筛选多拷贝基因1)取出长有克隆的3块板,可考虑先挑10-20个菌落先表达;2)第一块加入2ml 灭菌的ddH2o,用涂布棒打匀,洗后,菌液吸入第二块;3)第二块加入1ml,洗之,吸入第三块;4)菌液吸入EP管,可适量补充ddH2o;5)混匀后取适量稀释约50倍,4ul×50=200ul每块G418板,G418浓度从0.25-4.0mg/ml各一块;6)注意涂布均匀,可适量补充ddH2o,7)300C烘箱培养,2-5day,其余菌液可40C保存注:a)手册推荐方法:第4)步将菌液转入EP管中,振荡5-10秒,用分光光度计测菌体密度,1OD600=5×107 cells/ml, 取一定体积稀释至200ul/每块G418板, 涂布~105 cells;注意agar的存在会干扰分光光度计的读数。
五.表达:1)从G418板挑单克隆入4ml/管MGY接种,300C,250rpm,2天左右至OD=2-6,颜色乳白;2)取1ml菌液于EP管中保种,余3ml菌液离心,1500g,5min,菌体换3ml BMMY,加千分之五甲醇,300ul/管;3)每隔24小时加千分之五甲醇;4)至表达之日起2天后每天取样80ul,留作电泳分析;5)表达4天结束,1500g离心,5min,分别收集上清和沉淀;6)上清用作蛋白分析,跑SDS-PAGE电泳,Western Blotting分析,ELISA分析,样品浓缩,纯化分析等六.质粒提取(碱裂解)(1)溶液I:50 mmol/L葡萄糖,25 mmol/L Tris-HCl(pH8.0),10 mmol/L EDTA (pH8.0), 配制200ml。