基因工程菌的发酵
有的表达系统需要高的比生长速率 有的则需要比较低的比生长速率
有的工程菌的表达效率在比生长速率为零时 (稳定期)最高
13.3 发酵中影响基因表达的因素
13.3 发酵中影响基因表达的因素
13.3 发酵中影响基因表达的因素
温度的影响 – 温度影响质粒的稳定性 – 影响细胞内酶的活性和重组蛋白的合成速度 – 影响重组蛋白的稳定性
ˆ dP o ˆ ˆ ˆ k q m k e P 1 P dt
13.5 基因工程菌发酵动力学模型
dX1 dP X1 dt dt
13.5 基因工程菌发酵动力学模型
13.2 基因工程菌的稳定性
13.2 基因工程菌的稳定性
外源基因表达系统可以分为两种类型
– 质粒-宿主表达系统
外源基因位于工程菌的质粒上
存在质粒的不稳定性
– 整合型表达系统
外源基因位于宿主菌的染色体上
稳定性的问题相对不太严重
13.2 基因工程菌的稳定性
引起质粒-宿主表达系统不稳定性的因素 – 不含质粒的细菌对工程菌的生长优势 – 质粒分配的不稳定性
dX 3 3 X 3 1 X 1 2 X 2 dt
13.5 基因工程菌发酵动力学模型
dS 1 dX1 1 dX 2 1 dX 3 1 dP dt Y1 dt Y2 dt Y3 dt YP dt
ˆ dm o ˆ ˆ ˆ k P G k d m 1 m dt
– 解决代谢副产物抑制的方法 控制快速利用碳源(葡萄糖)的浓度 使用缓慢利用碳源 在线分离抑制物质
13.3 发酵中影响基因表达的因素
13.3 发酵中影响基因表达的因素
13.3 发酵中影响基因表达的因素
基因工程菌的稳定性对发酵的影响
– 发酵液中丢失质粒的工程菌数量多
– 解决这一问题的方法
构建更为稳定的工程菌
使用整合型的表达系统 使用可诱导的表达系统并控制诱导的时机,将 基因工程菌的生长和外源蛋白的表达分开进行 在发酵过程中使用抗生素抑制野生菌的生长
13.4 基因工程菌的高密度发酵
若每个基因工程菌产生重组蛋白的能力相同, 则重组蛋白的生产能力与菌体量成正比
dP qP X dt
质粒在子代微生物中的不均一分配
– 质粒结构的不稳定性
质粒DNA易发生突变,同时也容易受到宿主 菌核酸酶的攻击
13.2 基因工程菌的稳定性
考虑一个质粒-宿主表达系统
aS P (2 k ) P kN
bS N 2 N
1 k F n ( k 1) 1 k 2
– 一般含有抗生素抗性基因 – 有的含有病毒的遗传信息
13.1 基因工程菌的安全性问题
基因工程菌泄露的防护措施 – 物理防护 实验室规模上有P1-P4四个等级 工业规模上则有LS1、LS2两个等级 LS-1的设备标准
– 培养装置密闭 – 排气经过无菌过滤
– 生物防护 EK1-EK3三个等级
2 1
13.2 基因工程菌的稳定性
13.2 基因工程菌的稳定性
13.2 基因工程菌的稳定性
培养条件对工程菌稳定性的影响
– 培养基的影响
复合培养基(完全培养基)对质粒的稳定性有利
基本培养基
– 比生长速率
比生长速率高时有利于质粒稳定
13.2 基因工程菌的稳定性
13.2 基因工程菌的稳定性
培养条件对基因工程菌稳定性的影响
– 温度 高温时质粒的稳定性较差
– pH pH接近于基因工程菌的最适生长pH时质粒的稳 定性较高
– 溶氧 在基因工程菌的发酵过程中保持较高的溶氧有 利于质粒的稳定
13.2 基因工程菌的稳定性
13.2 基因工程菌的稳定性
培养条件对工程菌稳定性的影响 – 细胞的固定化
由于外源蛋白的表达对工程菌的生长有抑制 作用,故一般在对数生长后期进行诱导 过量诱导往往对细胞生长和代谢活性以及基 因的表达具有抑制作用 使用热诱导时不能用过高的温度
发酵中影响基因表达的因素
代谢副产物的影响
– 常见的基因工程菌产生的抑制性代谢副产物 大肠杆菌产生乙酸 枯草杆菌产生乙酸和丙酸 酵母产酒精
13 基因工程菌的发酵
基因工程菌的安全性 基因工程菌的稳定性问题 影响基因工程菌发酵的因素 基因工程菌的高密度培养 基因工程菌发酵的动力学模型
13.1 基因工程菌的安全性问题
基因工程菌的安全性受到关注的原因 – 基因工程菌都含有外源DNA片段,其遗传
结构与自然界中的DNA相比有较大的差别
13.4 基因工程菌的高密度发酵
实现基因工程菌高密度发酵的方法 – 流加培养技术
– 先采用合适的流加培养技术将基因工程菌
培养到一定的浓度(如50gDCW/L)
– 然后通过诱导启动重组基因的表达
13.5 基因工程菌发酵动力学模型
建立基因工程菌发酵动力学模型应从基
因工程菌发酵与一般的微生物发酵的差 别着手
影响外源蛋白的表达
– 一般而言营养丰富的复合培养基比合成培养基的
效果好,缓慢利用的碳源比葡萄糖的效果好
– 不同的表达系统对营养物质有不同的要求 – 相同的表达系统在表达不同的外源蛋白时也对培
养基有不同的要求
13.3 发酵中影响基因表达的因素
发酵过程中比生长速率的影响 – 比生长速率的影响尚无定论 – 因不同的表达系统而异
热诱导
13.3 发酵中影响基因表达的因素
外源基因表达的一般过程
– 复制 质粒的稳定性
– 转录 诱导 分解代谢物阻遏 – 翻译 mRNA的半衰期(寿命) 氨基酸是否供给充分 – 表达后的修饰和分泌
13.3 发酵中影响基因表达的因素
培养基对基因工程菌发酵的影响
– 培养基的浓度和配比不但影响菌体的生长,而且
较低 的温度下重组蛋白稳定 诱导温度的确定
– 有些表达系统采用热诱导
13.3 发酵中影响基因表达的因素
溶氧(DO)的影响 – 溶氧对基因工程菌发酵的影响取决于
工程菌的特性
宿主菌为需要菌时一般要有较高的溶氧
宿主菌为厌氧菌时则需要厌氧培养
13.3 发酵中影响基因表达的因素
诱导 – 诱导时机
正常的基因工程菌 质粒结构发生变化的工程菌 野生菌
– 考虑了细胞内mRNA的合成与外源蛋白表达
的关系
13.5 基因工程菌发酵动力学模型
dX1 1 X 1 (1 ) 1 X 1 dt
dX 2 2 X 2 (1 ) 1 X 1 dt
– 质粒的不稳定性
野生菌的生长优势 结构的不稳定性
分配的不稳定性
– 重组蛋白质的表达
– 诱导
13.5 基因工程菌发酵动力学模型
Lee的模型
– 发表在Bioengineering and Biotechnology (生
物工程与技术)上 – 充分考虑了质粒的不稳定性,将培养液中 的微生物分为三种
固定化细胞可以提高质粒的稳定性
– 外源基因的表达
外源基因的表达会引起质粒的不稳定性问题 采用可诱导的表达方式
13.3 发酵中影响基因表达的因素
基因工程菌发酵的特殊性 – 生长速度比野生菌株慢 – 存在稳定性的问题 – 外源基因的表达一般需要诱导
化学诱导
– IPTG(异丙基硫代半乳糖苷),乳糖等