文献检索作业以趋磁细菌的磁小体研究为例一、文献检索的意义通过文献检索,可以充分利用已有的文献信息资源,避免重复劳动科学研究具有继承和创造两重性,科学研究的两重性要求科研人员在探索未知或从事研究工作之前,应该尽可能地占有与之相关的资料、情报。
研究人员在开始研究某一课题前,必须利用科学的文献信息检索方法来了解课题的进展情况,在前人的研究基础上进行研究。
科研人员只有通过查找文献信息,这样才能做到心中有数,防止重复研究,将有限的时间和精力用于创造性的研究中。
通过文献检索,可以节省查找文献信息的时间,提高科研效率。
目前文献信息的数量和类型增加十分迅速,科研人员不可能将世界上所有的文献都阅读完。
如果科研人员掌握好科学的文献信息检索方法,就可以缩短查阅文献的时间,获取更多的文献信息,提高科研效率。
通过文献检索,促进专业学习,实现终身学习。
在当代社会,人们为了适应社会发展的需求,需要终生学习,不断更新知识,掌握了科学的文献信息检索方法,在研究实践和生产实践中根据需要查找文献信息,找到一条吸取和利用大量新知识的捷径。
二、关于该课题的总体检索思想课题背景简介:趋磁细菌研究至今已有近30多年的历史人们已开始探索其在各个领域的应用然而直到今天仍未得到大规模的应用这一方面是由于趋磁细菌具有难培养的特性另一方面是因为对趋磁细菌磁小体生物合成的生化和遗传机制了解的不够。
磁小体是趋磁细菌体内合成的独特结构,是生物成矿这一现象的典型代表。
但是磁小体合成的具体机制还远远没有弄清楚。
另外趋磁细菌合成的磁性晶体极其均匀,并且具有生物膜包裹。
其生物膜是酶、药物和其它生物活性分子的理想载体。
同时磁小体还是非常好的磁性材料。
未来磁小体的应用前景将十分广阔。
本课题研究方向即探索趋磁细菌的磁小体形成的基因组学、遗传学和细胞生物学,从而通过基因工程的手段来获得大量的磁小体。
选择数据库类型:虽然趋磁细菌、磁小体的研究已经有30多年的历史,但此课题仍较新颖,因此应侧重外文数据库的查询,兼顾中文数据库,并且初步决定查询近10年的文献中文数据库的检索关键词:趋磁细菌、磁小体、磁矿物的生物矿物化英文数据库的检索关键词:magnetotactic bacteria、magnetosome、magnetite biomineralization,检索的总体思路:当我拿到一个需要检索文献的论文题目时,我会首先想到的是三种文献检索的方法:1)如果我有一篇相关文章,可以从文章的参考文献追溯;2)利用某些每期有专刊的期刊或就某一专题讨论会出版的增刊,其资料较为集中;3)利用现代检索手段索取相关文献,如数据库检索。
文献的检索步骤是:1)分析检索课题,明确检索要求,2)选择检索工具,确定检索方法,3)选择检索途径,确定检索标识4)具体查找文献线索;5)索取原始文献。
三、检索方法一)、利用现有相关文章的参考文献,索取相关文献。
这种方法较简单,只要你找到现有相关文章的出处,你就可以点击超链接获取其他相关文章。
二)、利用某些每期有专刊的期刊或就某一专题讨论会出版的增刊,其资料较为集中。
三)、利用现代检索手段索取相关文献,如数据库检索。
因特网(Internet)的飞速发展,为各行各业获取信息提供了一个崭新的手段,如何在网络中做到快速、准确地查找资料,是现代生物工作者必须掌握的一项基本技能。
通常先寻找国内的有关文献,然后再寻找国外资料,国内资料易懂,查阅速度快,如果能充分利用翻译资料,还可弥补掌握语种不多的缺陷。
国内有些文献本身也引证大量国外资料目录,为进一步寻找国外文献扩大了来源。
我们在文献检索时,通常都是使用关键词进行检索。
这种关键词是未经规范化的自然语言语词,这种关键词由于受限制比较小,所以检索比较灵活,检索范围比较广。
而在数据库中的主题检索所使用的主题词则是规范化了的自然语言语词,在进行文献检索时,检索到的文献往往比较准确,但是检索范围受到限制。
数据库中的主题检索与我们常用的关键词检索在本质的区别在于规范化与不规范化。
但是在一定程度上,未经规范化的自然语言语词可以转化为规范化了的自然语言语词。
1、中文数据库1)、中国知网(CNKI)全文数据库中国知网(CNKI)全文数据库按学科知识分为自然科学与工程技术和人文与社会科学两大专栏,生物学和农学文献可以在自然科学与工程技术专栏的农业科技和医药卫生科技中查找,或通过总库直接查找。
一般采用高级检索或专业检索。
检索时注意几点:一是运算符与其他数据库不同,“*”表示“与”,“+”表示“或”,“-”表示“非”,不能用括号优先运算。
二是关键词不同于CBM中的自由词,CNKI中的关键词由作者提供,用关键词可能降低查全率。
方法一:高级检索步骤:进入海南大学图书馆,进入中国知网全文数据库界面,点击高级检索,在“关键词”中检索,分别输入检索词,如上图所示,若将“磁小体”和“趋磁细菌”分别放入两个检索框用“或者”连接,可以检出100篇文献;若将“磁小体”和“趋磁细菌”分别放入两个检索框用“和”连接,可以检出23篇文章。
摘抄题录如下:趋磁细菌生态学研究进展下载阅磁螺菌下载阅方法二、二次检索二次检索是在原来的基础上,进一步检索所需文献的方法。
如上图所示,需选中“在结果中检索”,然后点击“检索”就可得到所要文献,结果检出0篇文章。
2)维普全文数据库《中文科技期刊数据库》始建于1989年,由科技部西南信息中心(原中国科技情报研究所重庆分所)主办,重庆维普资讯有限公司制作和发行,曾荣获1993年国家科技进步三等奖。
《中文科技期刊数据库》收录社会科学、自然科学、工程技术、农业科学、医药卫生、经济管理、教育科学和图书情报等8大专辑9000余种期刊,基本覆盖了国内出版的具有学术价值的期刊。
《中文科技期刊数据库》包括全文版、文摘版和引文版,题录文摘、全文和引文数据相互对应并可自动链接。
截至2006年8月,该数据库累计收录1989年以来的无重复全文文献1500多万篇,每年新增文献300万篇。
由以上两个图可知,在维普全文数据库中“*”代表“并且”;“+”代表“或者”;“-”代表“不包含”然后点击文献篇名,竟如以下界面:点击“全文下载”可以获得全文。
2、外文数据库1)Wiley InterScience电子期刊全文库John Wiley & Sons Inc.是有200年历史的国际知名专业出版机构,在化学、生命科学、医学以及工程技术等领域学术文献的出版方面颇具权威性,2007年2月与Blackwell出版社合并,两个出版社出版的期刊整合到同一平台上提供服务。
Wiley InterScience是一个综合性的网络出版及服务平台,在该平台上提供全文电子期刊、电子图书和电子参考工具书的服务。
包括化学、物理、工程、农业、兽医学、食品科学、医学、护理、口腔、生命科学、心理、商业、经常、社会科学、艺术、人类学等多个学科人类学等多个学科的1400多种期刊,以及很多其它重要的跨学科领域出版的期刊。
目前,图书馆通过Wiley intersceience平台可访问除医学组以外的所有学科组。
含电子刊900多种我校的Wiley InterScience电子期刊全文库共分为87个期刊,我们一般在Macromolecular Bioscience、Macromolecular Theory and Simulations等查找所需文献。
例如进入Macromolecular Bioscience,可看到,直接输入文献名或点击“Advanced”输入关键词(Keywords)并且限定年限2000-2010,得到以下界面:点击“Search”检索到23篇文献。
摘抄题录如下:Chapter 3. Phylogeny and In Situ Identification of Magnetotactic Bacteria Prof. (em.) Dr. Edmund BäuerleinRudolf I. Amann1, Ramon Rosselló-Mora2, Christine Flies3, Dirk Schüler4 Published Online: 22 JUL 2005 DOI: 10.1002/3527604138.ch3Copyright © 2004 Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KgaAChapter 5. Magnetosomes and their Biomedical ApplicationsVijay K. Varadan Endowed Chair Distinguished Professor Professor faculty Director founder Editor-in-Chief Associate Editor fellow, Linfeng Chen B.Sc., B.Eng., Ph.D. Assistant Lecturer project engineer Member Technical Staff research scientist research faculty senior member, Jining Xie Bachelor of Engineering, Ph.D. fellow Research Assistant Professor memberPublished Online: 20 NOV 2008 DOI: 10.1002/9780470715611.ch5Copyright © 2008 John Wiley & Sons, Ltd2)ProQuest Agriculture Journals(PAJ)农业全文数据库ProQuest 农业全文数据库是由ProQuest公司出版和提供平台服务的农业专题全文数据库产品,收录了大量世界著名出版机构的核心农业生物学连续性出版物。
该数据库以美国国家农业图书馆的Agricola文摘索引为基础,2009年5月,共收录期刊260+种(250+种全文刊),含影响因子的期刊120+种其中49%的期刊被SCI收录,该数据库涵盖了农业、植物科学、林业科学、动物和兽医科学、渔业、昆虫学、农业系统科学、农业经济学等学科领域。
进入界面,点击“Advanced” 进入高级收索,输入关键词(“citation andabstract”)——magnetotactic bacteria:收索到18篇文献。
点击“Full Text-PD F”可得到全文摘抄题录如下:Chemolithoautotrophy in the marine, magnetotactic bacterial strains MV-1 and MV-2 Dennis A Bazylinski, Annette J Dean, Timothy J Williams, Linda Kimble Long, et al. Archives of Microbiology. Berlin: Nov 2004. V ol. 182, Iss. 5; pg. 373Deep-Etching Electron Microscopy of Cells of Magnetospirillum magnetotacticum: Evidence for Filamentous Structures Connecting the Magnetosome Chain to the Cell SurfaceJuliana Lopes Martins, Carolina Neumann Keim, Marcos Farina, Bechara Kachar, Ulysses Lins. Current Microbiology. New York: Jan 2007. V ol. 54, Iss. 1; pg. 13)ProQuest Biology Journals(PBJ)生物科学全文数据库ProQuest 生物全文数据库是由ProQuest公司出版和提供平台服务的农业专题全文数据库产品,收录了大量世界著名出版机构的核心农业生物学连续性出版物,截止2009年5月,共收录期刊360+种(310+种全文刊),含影响因子的期刊220+种,来源于100多出版商,学协会,大学出版社等,涉及生物化学、生物物理、植物学、细胞学和组织学、遗传学、微生物学、动物学等学科。