工程项目组织结构主要有三种基本形式。首先是直线式项目组织，它保证单头、统一领导，项目经理有指令权，能直接控制资源，信息流通快，决策迅速，但缺点是当项目较多或较大时，资源使用可能不合理，且对项目经理的能力要求高。其次是职能式项目组织，适用于大型项目，子项目不多的情况，能提高项目管理水平和效率，但缺点是容易产生矛盾的指令。最后是矩阵式项目组织，能集中资源为项目服务，保证项目目标，灵活使用资源，但缺点是存在双重领导和信息处理大。每种形式都有其适用的场景和优缺点，需要根据实际情况选择。