基因组dna提取教案
8.重复操作步骤7。
9. 12,000 rpm离心2 min,弃废液。将吸附柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
10.将吸附柱CB3转入1.5 ml离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加50-200μl洗脱缓冲液TB,室温放置2-5 min,12,000 rpm离心2 min,将溶液收集到离心管中。为增加基因组DNA的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CB3中,室温放置2 min,12,000 rpm离心2 min
【实验方法】:
1.处理血液材料(已添加抗凝剂的1 ml血液样品):
在样品中加入1-2.5倍体积的细胞裂解液CL,颠倒混匀,10,000 rpm离心1 min,吸去上清,留下细胞核沉淀,向离心收集到的细胞核沉淀中加200μl缓冲液GS,振荡至彻底混匀。加入4μl RNase A(100 mg/ml)溶液,振荡15 sec,室温放置5 min。
【作业要求】:
认真完成实验报告并对结果进行分析讨论。
【时间安排】:
实验内容及结果在学生操作前及操作中的穿插讲解40min
实验操作(学生一人/分组完成)155min
实验基因组DNA提取试剂盒:细胞裂解液CL、缓冲液GS、缓冲液GB、缓冲液GD、漂洗液PW、洗脱缓冲液TB、ProteinaseK、吸附柱CB3、收集管(2 ml)、1.5 ml离心管
【实验内容】:
1采用血液基因组DNA提取试剂盒利用酚抽提法提取人外周血细胞基因组DNA
【实验原理】:
酚抽提法提取DNA
12,000 rpm离心30 sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
6.向吸附柱CB3中加入500μl缓冲液GD(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心30 sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
7.向吸附柱CB3中加入600μl漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心30 sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
3使用缓冲液GD、漂洗液PW前请先检查是否已加入无水乙醇。
4必须将吸附柱中残余的漂洗液去除,漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。
5洗脱缓冲液体积不应少于50μl,体积过小影响回收效率。
6酚的腐蚀性很强,并可引起严重的灼伤,应在化学通风橱中进行操作并且必须穿戴手套、防护镜及防护衣。与酚接触过的皮肤,应使用大量的水清洗,并用肥皂与水洗涤,忌用乙醇。
(1)分离提取DNA首先应分离出白细胞。将分散好的细胞用含EDTA、SDS及无DNA酶的RNA酶的细胞裂解缓冲液进行裂解。EDTA为二价金属离子螯合剂,抑制DNA酶的活性使DNA完整的溶解在溶液中并降低细胞膜稳定性的作用。SDS作为生物阴离子去垢剂,在降解细胞膜、乳化脂质和蛋白质中起重要作用。无DNA酶的RNA酶通过有效水解RNA而避免DNA的消化。(2)随后加入蛋白酶K用于水解蛋白质,消化DNA酶及DNA上的蛋白质。(3)再用Tris酚反复抽提,因为酚作为蛋白质的变性剂,使蛋白质变性溶于有机相,DNA保留在水相。Tris缓冲液能确保抽提后的DNA进入水相,从而避免其滞留于蛋白质层。重复抽提有提高DNA的纯度的作用。一般抽提三次后,便可移出含DNA的水相,用于沉淀处理。(4)沉淀处理常以乙酸铵为沉淀用盐,用无水乙醇沉淀以去除残留的有机溶剂,并用70%的乙醇洗涤去盐,得到较纯净的基因组DNA。
11.DNA浓度及纯度检测琼脂糖凝胶电泳
核酸是两性电解质,其等电点为pH2.0~2.5左右,在常规的高于其等电点pH值的碱性缓冲溶液中带有负电荷,在电场中向正极移动。被分离的核酸分子在电场中的迁移率与凝胶浓度、被分离核酸分子的大小及构型、所加电压的高低、电泳缓冲液的组成及其离子强度等因素的影响。
【实验结果】:
【注意事项】:
1对于高分子量DNA的制备,由于受剪切力的影响很大,每一步的操作都要特别小心、温和,避免激烈的吸取、振荡与混匀。
2加入缓冲液GB时可能会产生白色沉淀,一般37℃放置时会消失,不会影响后续实
验。如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取DNA量少和提取出的DNA不
纯。如果裂解不彻底,需要延长裂解时间或重复裂解。
教具与课件:
板书
课外作业:
1.复习人外周血细胞DNA分离与纯化酚抽提法的原理。
2.完成实验报告并对结果进行分析。
课后回忆(经验教训、效果估计或反应,存在问题……):
系(教研室)主任
年月日
教学内容与组织安排:
人体外周血细胞基因组DNA的分离与纯化
【目的要求】:
1掌握人血白细胞DNA分离与纯化的原理和方法。
2.加入20μl Proteinase K溶液,混匀。
3.加200μl缓冲液GB,充分颠倒混匀,56℃放置10 min,其间颠倒混匀数次,溶液应变清亮(如溶液未彻底变清亮,请延长裂解时间至溶液清亮为止)。
4.加200μl无水乙醇,充分颠倒混匀,此时可能会出现絮状沉淀。
5.将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱CB3放入收集管中),
学院检验学院系(教研室)病原生物与分子生物检验教师姓名刘二强
课程
名称
临床微生物学与检验
专业
层次
临床检验
年级
授课
方式
实验讲授
授课
时间
学时
授课题目:
人体外周血细胞基因组DNA的提取
目的要求:
掌握:人体外周血细胞基因组DNA提取的原理和方法。
重点难点:
重点:试剂盒提取DNA的原理
难点:人外周血基因组DNA酚抽提方法