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细胞生物学第9章 核糖体-3版

第九章 核糖体(ribosome)
核糖体的概述 核糖体的类型与结构 多聚核糖体与蛋白质的合成
第一节 核糖体的概述
1.概念
核糖核蛋白体,简称核糖体(ribosome) 核糖体是一种颗粒状的结构,没有
被膜包被,主要成分是蛋白质和RNA, 其唯一的功能是按照mRNA的指令由氨基 酸高效且精确地合成多肽链。是合成蛋 白质的细胞器
rRNA :18SrRNA 40S
S蛋白:33种
二、核糖体的结构
结构与功能的分析方法 蛋白质合成过程中很多重要步
骤与50S核糖体大亚单位相关
结构与功能的分析方法
离子交换树脂可分离纯化各种r蛋白; 纯化的r蛋白与纯化的rRNA进行核糖体的重组装,
显示核糖体中r蛋白与rRNA的结构关系 双向电泳技术可显示出E.coli核糖体在装配各阶段中,
作用机制,从而为揭开核糖体这一具有30多亿年历史的 古老的高度复杂的分子机器的运转奥秘迈出了极重要的 一步。
三、核糖体蛋白质与rRNA的功能
核糖体上与蛋白质合成有关的 结合位点与催化位点
核糖体蛋白质与rRNA的功能分析 (核糖体中肽酰转移酶的活性研究) rRNA的主要功能 r蛋白质的主要功能
1985年,Cech发现RNA具有催化RNA拼接过 程的活性
1992年,又证明RNA具有催化蛋白质合成的 活性
(三)rRNA的主要功能
目前认为,在核糖体中rRNA是起主要作用的结构 成分,其主要功能是:
具有肽酰转移酶的活性; 为tRNA提供结合位点(A位点、P位点和E位点) 在蛋白质合成起始时参与同mRNA选择性地结
蛋白质合成过程中很多重 要步骤与50S核糖体大亚单位相关
涉及的多数因子为G蛋白(具有GTPase活性),核糖体上 与之相关位点称为GTPase相关位点。
最近人们成功地制备L11-rRNA复合物的晶体,获得了 其空间结构高分辨率的三维图象。
这一结果证实了前人用各种实验技术所获得的种种结论 提出直观、可靠且比人们的预料更为精巧复杂和可能的
与rRNA结合的蛋白质的类型 双功能的交联剂和双向电泳分离可用于研究r蛋白在
结构上的相互关系 电镜负染色与免疫标记技术结合,研究r蛋白在核糖
体的亚单位上的定位。 对rRNA,特别是对16S rRNA结构的研究 70S核糖体的小亚单位中rRNA与全部的r蛋白关系
的空间模型
同一生物中不同种类的r蛋白的一级结构 均不相同,在免疫学上几乎没有同源性。
第二节 核糖体的类型与结构
核糖体的基本类型与成分 核糖体的结构 核糖体蛋白质与rRNA的功能
一、核糖体的基本类型与成分
(一)基本类型
按存在的方式分为:
附着核糖体:真核细胞ER、外核膜;原核细胞质膜内侧。 游离核糖体:呈游离状态,分布于细胞质基质中。
按沉降系数分为:
70S的核糖体:原核细胞核糖体、真核细胞线粒体和叶绿体。 80S的核糖体:真核细胞内的线粒体。
多数抗蛋白质合成抑制剂的突变株,并非 由于r蛋白的基因突变而往往是 rRNA基 因突变。
在整个进化过程中rRNA的结构比核糖体 蛋白的结构具有更高的保守性。
证据
Noller证明23SrRNA具有肽酰转移酶的活性
用对肽酰转移酶敏感的抗生素处理或者用核酸酶 处理均可抑制其合成多肽的活性。
但用各种手段去掉或阻断r蛋白质的合成,则肽 酰转移酶的活性不受影响。
不同生物同一种类r蛋白之间具有很高 的同源性, 并在进化上非常保守。
蛋白质结合到rRNA上具有先后层次性。 核糖体的重组装是自我装配过程
16SrRNA的一级结构是非常保守的
16SrRNA的二级结构具有更高的保守性: 臂环结构(stem-loop structure)
rRNA臂环结构的三级结构模型
合以及在肽链的延伸中与mRNA结合; 核糖体大小亚单位的结合、校正阅读(proofreading)、
无意义链或框架漂移的校正、以及抗菌素的作用等 都与rRNA有关。
(四)r蛋白质的主要功能
对rRNA折叠成有功能的三维结构是 十分重要的;
在蛋白质合成中, 某些r蛋白可能对核 糖体的构象起“微调”作用;
在核糖体的结合位点上甚至可能在催 化作用中, 核糖体蛋白与rRNA共同行 使功能。
第三节 聚核糖体与蛋白质的合成
多聚核糖体(polyribosome or polysome) 蛋白质的合成 RNA在生命起源中的地位及其演化过程
一、多聚核糖体
概念
核糖体在细胞内并不是单个独立地执行功能,而是 由多个甚至几十个核糖体串连在一条mRNA分子上 高效地进行肽链的合成,这种具有特殊功能与形态 结构的核糖体与mRNA的聚合体称为多聚核糖体。
(一)与蛋白质合成有关的 结合位点与催化位点
与mRNA的结合位点。 A位点:与新掺入的氨酰-tRNA的结合位点——氨酰基位点。 P位点:与延伸中的肽酰-tRNA的结合位点——肽酰基位点。 E位点:肽酰转移后与即将释放的tRNA的结合位点——E位点
(exit site)。 与肽酰tRNA从A位点转移到P位点有关的转移酶
2.存在部位
真核细胞:大量 细 胞 原核细胞:大量
支 原 体:数以百计
细胞器
线粒体 叶绿体
高度特化的细胞内没有核糖体 例如:哺乳动物成熟的红细胞
3.细胞内的分布
分布在细胞内蛋白质合成旺盛的区域, 其数量与蛋白质合成的程度有关。
例如:指数生长期的细菌中,数以万计 饥饿状态的细胞中,仅有几百个
(二)主要成分
r蛋白质: 约占1/3,分布核糖体表面 rRNA : 约占2/3,位于核糖体内部
主要成分
50S 70S核糖体
30S
23SrRNA rRNA
5SrRNA L蛋白: 31种
rRNA :16SrRNA
S蛋白:21种
80S核糖体
28SrRNA
rRNA 5.8SrRNA
60S
5SrRNA
L蛋白: 49种
(即延伸因子EF-G)的结合位点 肽酰转移酶的催化位点 与蛋白质合成有关的其它起始因子、延伸因子和终止因子的
结合位点
(白质合成的活 性,即不具有肽酰转移酶的活性。
目前认为,在核糖体中rRNA是起 主要作用的结构成分。
核糖体蛋白
很难确定哪一种蛋白具有催化功能,在 E.coli中核糖体蛋白突变甚至缺失对蛋白 质合成并没有表现出“全”或“无”的影 响。
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