机制
DN方A 向
1. 实体肿瘤基因组学研究
一. 研究目的和意义 寻找适用于肿瘤早期诊断、肿瘤分型、病程发展（恶化和转移）和预后的基因组分子标记，筛选药物的
靶标。
二. 研究对象 实体肿瘤的鉴别，按照临床病理分类，例如：肺癌、胃癌、肝癌、结肠癌、乳腺癌、宫颈癌、胰腺癌、
膀胱癌、食道癌、肾癌等。
三. 测序方案
巴细胞白血病，慢性髓细胞白血病，急性淋巴细胞白血病，急性髓细胞白血病（急性粒细胞白血病）。
测序，第三代
测序技术还不
是很成熟，有
的刚刚出现，
Logo
有的则正在研 制
pany
m
o
C
第二代主要的测序平台
公司 Roche/454
平台名称
基因组测 序仪FLX 系统
测序方 法
焦磷酸 测序法
Illumina ABI/Solid
HiSeq200 0,HiSeq2 500/MiSe q
可逆链 终止物 和合成 测序法
Logo pany m o C
测序的发展历程
20世解法、 双脱氧链终止法以及在 它们的基础上发展来的 测序技术统称为第一代 测序。它在分子生物学 研究中发挥过重要的作 用，如人类基因组计划
2005年开始
第二代测序
主要包括罗氏454公 司的454测序技术 、 Illumina公司的Solexa测 序技术和ABI公司的 SOLiD测序技术 。第二 代测序技术最显著的特 征是高通量，一次能对 几十万到几百万条DNA 分子进行序列测序
4.Description of the company's contents
1. 对测序后生成的数 据进行分析
2. 普通的分析：去除 低质量数据，进行 序列组装，评估测 序质量等
3. 高级分析：对基因 进行注释，分析表 达情况、构建互做 网络等样品的制备的构建上机测序数据分析
Logo pany
? 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十 万到几百万条DN分A 子进行序列测定，因此在有些文献中称其 为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时 代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组 进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序 (deepsequencing。)
测序的流程
m
o
C
三、对肿瘤研究的方法
高通量测序在肿瘤 研究的应用
DNA
1. 实体肿瘤基因 组学研究
2. 血液肿瘤基因组 学研究
3. 表观遗传学研究 4. 免疫组学研究
Logo pany m o C
RNA
1. 实体肿瘤转录组 学研究 2. 血液肿瘤转录组 学研究 3.Exosome研究肿 瘤细胞通讯、扩散
正在研发
第三代测序
第三代DNA测序技术 是以单分子测序为特点 ，如生物科学公司的单 分子测序仪，以及正在 研制的太平洋生物科学 公司的单分子实时DNA 测序技术和牛津纳米孔 技术公司的纳米孔单分 子测序技术等
Logo pany m o C
主要的测序平台
目前常说的
高通量测序是
指用第二代测
序技术来进行
Exome capture seq（外显组捕获测序）描绘基因组外显子区域的SNV（单核苷酸变异），Indel（插入
缺失）、CNV（拷贝数变异），分析基因变异和癌症的相关性。
Target capture seq （目标捕获测序）对一些功能富集的基因或研究人员感兴趣的基因组的部分区域进
行捕获，分析基因变异对癌症的影响。例如：癌症相关基因（508个）、免疫（883个）、凋亡（1536个）、
4. 全基因组测序解析基因组拷贝数变异
C
DN方A 向
2. 血液肿瘤基因组学研究
一. 研究目的和意义 寻找适用于白血病早期诊断、疾病分期或分级、预后的分子标记，药物筛选的靶标，指导个体化用药的
分子依据。
二. 研究对象 血液病类型：骨髓增生异常综合症（MD）S ，多发性骨髓瘤，非霍奇金淋巴瘤，霍奇金淋巴瘤，慢性淋
高通量测序技术及其在肿瘤研究中的应用
汇报人：
目录
1
背景介绍
2
测序的流程
3
对肿瘤研究的方法
4
Logo pany m o C
总结
什么是高通量测序?
一、背景介绍
? 高通量测序技术（High-throughput sequencin）g又称“下一 代”测序技术（“Next-generation” sequencing technology），以能一次并行对几十万到几百万条DN分A 子进 行序列测定和一般读长较短等为标志。
细胞周期（1005个）、p53通路（162个）等。
Whole genome se（q 全基因组测序）对基因组上所有的基因进行测序分析，找到大量的SNV、CN、V
Indel 、SV（结构变异）等基因变异信息，更为全面的解析癌症发生发展的分子机制。
Logo pany m o
四. 案例解析 1. 外显组测序鉴定体细胞突变 2. 外显组测序分析拷贝数和基因融合 3. 全基因组重测序展示人类首个癌基因组图谱
仪器昂贵；用于 数据删节和分析 的费用较高
测序运行时间长； 读长短，造成成 本高，数据分析 困难和基因组拼 接困难；仪器昂 贵
二、测序流程
1. 组织样品的培养 或病理样品的收 集
2. 样品总DAN、 RNA的提取
3. 质检（总量、纯 度、完整性、有 没有降解等）
1. DNA序列打断、 RNA序列要反转录 为DNA序列再打断 （超声破碎）200300bp
5500xlSo 连接测 lid系统 序法
检测 方法
光学
大约读 长
230-400
优点
在第二代中 最高读长； 比第一代的 测序通量大
荧光/ 2x150 光学
很高测序通 量
荧光/ 25-35 光学
很高测序通 量；在广为 接受的几种 第二代平台 中，试剂成 本最低
相对局限性
样品制备较难； 难于处理重复和 同种碱基多聚区 域；试剂冲洗带 来错误累积；仪 器昂贵
2. 加接头，电泳选择 片段大小
3. PCR扩增ption of the company's products
2.Description of the company's business
31.cD.o进序在ems行第cpra测i二pnty序i代o'sn，测o设序f t定h仪e程上 technology