➢Single-Read Sequencing(SR, 单向测序)指只检测
基因片段一端的序列信息。
互补接头 接头
基因序列
接头
Paired-End Sequencing
➢Paired-End Sequencing
(PE, 双向测序)是指检 测基因片段的两端序列 信息。
Single Read
Paired End
Shenzhen branch:
Thanks ！
➢GA 负 责 对 芯 片
内的基因片段进行 边合成边测序反应 (SBS) ， 收 集 碱 基 信息。
➢Single-Read Sequencing
单向测序
➢Paired-End Sequencing
双向测序
➢Indexed Sequencing
混合样品测序
Single-Read Sequencing
Hiseq 2000
Hiseq 2000
High-seq 2000
Some of our partners on cancer and complex disease studies
Welcome to BGI.
Beijing branch: Hangzhou branch:
New campus in Shenzhen:
高通量测序原理和应用
Illumina/Solexa genome analyzer
3’-
…-5’
5’-
GTATTTTCGGCACAG
A
G
A
C
T C
T TG
Cycle 1:按顺序加入反应试剂 合成第一个碱基 清除未反应的碱基和试剂
激发碱基荧光并收集荧光信号 去除阻断基团和荧光基团
Cycle 2-n:
转录本
Fragment buffer
Superscript III RNase H
N6 primer
mRNA DNA
DNA polymerase I ds cDNA
转录本
RNA-seq在医口中的应用
– 用于癌驱动基因的筛选 – 用于融合基因的筛选 – 用于可变剪接的筛选 – 用于RNA水平的SNP分析 – ……
重复前面的步骤
Base Calling
T G C TAC GAT …
1
2
3
4
5
6
7
8
9
TTTTபைடு நூலகம்TTGT…
The identity of each base of a cluster is read off from sequential images
➢CS 负 责 将 待 测
样品“种植”于检测 芯片(Flow Cell)中 并进行扩增。
Small RNA 测序
Day1 Day2 Day3 Day4
Small RNA 测序
Small RNA在医口中的应用
– 两种差异样本之间的Small RNA比较 – MicroRNA和基因表达差异综合 – 生物标记 – ……
RNA-seq
– 基因表达差异（DGE） – 转录本
DGE
DGE
Indexed Sequencing
➢Indexed Sequencing是指将多种样品混合后进行
测序的技术。
➢这是为了充分利用solexa高通量的特点，有助于
降低成本。
应用
• DNA 水平 – 全基因组测序（de novo和Resequencing） – 目标区域测序 (外显子测序) – 表观（bisulfite、MeDIP、ChIP-seq）
– 单基因病外显子测序 – 复杂疾病外显子测序 – 某种疾病已知的相关基因深度测序以挖掘突变位点等 – ……
表观-Bisulfite
表观-Bisulfite
表观-MeDIP
表观-MeDIP
表观-ChIP-seq
表观-ChIP-seq
表观在医口中的应用
– 组蛋白修饰及转录因子研究 – 全基因上的DNA甲基化图谱 – 高CpG区域的甲基化图谱 – ……
RNA 水平 – 小RNA测序 – RNA-seq（DGE、转录本）
全基因组测序
全基因组测序在医口中的应用
– 单个临床细菌、真菌等微生物的基因组研究 – 多个同属菌株的基因组比较及群体进化 – 宏基因组 – 疾病样本的重测序 – ……
目标区域测序
目标区域测序
目标区域测序
目标区域测序在医口中的应用