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稳定同位素分析软件IsoSource软件的学习


如右图第1个柱子表示鮻的食物来源中 POM的贡献值,在所有可行解的组合 中处于0-2%之间的有11次。
• 查看数据
– View →确定→file → 目 标文件(鮻.out或者鮻.tot) – “.out”文件为原始输出 数据;“.tot”文件为统 计信息摘要 – View只能够现实前200行 的数据,要想看完整的全 部数据需用STATISTICA 或者Excel来打开
是可行的解。 • 在所有可行解中,对每种资源贡献百分比出现的频率进行分析,从而
得出图表
使用方法
• 操作界面及可以输入的部分
Source increment 资源增量参数,食 物网研究中一般输 入1-2(%) 输入标题 帮助里有详细的软件使用方法的介绍
同位素种 类,最多 五种 混合物(消 费者)中实 际测得的同 位素值
基本原理
• 基于稳定同位素的质量守恒
fA、fB表示两种资源A、B的比例(未知量);δA、δB分别表示A、B中同位素的值(已知量); δM表示混合物(消费者)的同位素值(已知量)。两个未知量两个方程,出方程组有唯一解。 对上面的方程组进一步扩展至三种或者更多资源,方程组的解也就不唯一
对于n个同位素种类,>n+1种资源的系统,也可以利用这种质量守恒来求解资源比例 的多种组合的可能解。
• 输入数据
– Mixtures 为实际 测得的消费者同 位素数据 – Sources 为各种 潜在的食物资源 类型 – 右下方空白区域 为实际测定的潜 在食物资源的同 位素值
小数点后最多只能输入6位
注意:如果在资源与混合物之间存在同位素分馏(如trophic fractionation” or “tissue-diet discrimination),同 位素信息必须在输入之前进行相应的调整。如N的分馏值在3.4左右,在输入时应该相应的把数值加3.4
• 后整合方法(以鮻为例)
用来合并具有相似δ13C值初级生产者的相对贡献。对于每一个单 个解,5种食源被合并成3个逻辑组,即C3维管植物(芦苇PA和海 三棱蔗草SM)、C4维管植物(互花米草)和微型藻类(POM和BMI)。 将IsoSource混合模型的输出文件(.out)读入统计软件SAS、
把所得数据拿到作图软件 SigmaPlot上作图
excel打开时数据格式不方便统计, 所以要先在STATISTICA中打开
频率
贡献率(%)
MI=POM+底栖藻类
频率
贡献率(%)
C3=海三棱+芦苇
频率
贡献率(%)
欢迎批评指正 Thanks!
稳定同位素分析软件IsoSource 的使用方法
汇报人:王思凯 导 师:吴纪华 2012.2.27-3.4
软件ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ绍
• 软件名称: IsoSource • 下载地址: /wed/pages/models.htm • 创始人: Donald L. Phillips
• 目的:估算出各类初级生产者对消费者相 对贡献率的可能范围及其平均值
Histogram data 直方图数据
Feasible output 可行解组合的输出数据 相加=1
贡 献 百 分 比
在对应的贡献百分比 上各资源出现的次数
“.tot”文件打开后的界面
“.out”文件打开后的界面
“.tot”文件打开后的界面
N = 观测值总数 平均值
“.out”文件打开后的界面
最小值
最大值
第1百分位
中位数 一共有83个观测值,与”.tot”文件中的N值一致 第99百分位
标准差
• 本幻灯片仅仅就δ 13C做了“一种同位素多种资源”的相关
分析,在实际操作中C、N同位素可以同时使用,只需要 把N数据添加相应的位置即可,但是要注意, δ 15 N要是 经过分馏值修正过的数据(一般对资源加上3.4‰左右) • 为了获取更具有解释性的结果,Phillips(2005)在IsoSource 的输出数据基础上又提出了后整合方法(Posteriori aggregation)
• 保存数据
– File→ – 在filename中输 入需要保存的 文件名→ – Save
• 打开数据
– File → – Data 找到要打 开的数据→ – Open
注意:右边的help,有每一步的相关介绍
• 运算
– Cale →Output → 在filename中输 入需要保存的文 件名 → Save – 现实程序运转 – 计算结束会显示 所花费的时间
• 按照指定的增量范围(increment)叠加运算出资源所有可能的百分比
组合(和为100%) 组合数量
i = increment (%) ;s = number of sources
• 每一个组合的加权平均值与混合物(消费者)实际测定的同位素值进行
比较,那些处于给定的忍受范围(tolerance)内( ± 0.1 ‰)的组合被认为
STATISTICA或者Excel程序中
将5个变量合并3个变量,即C4、MI=BMI+POM; C3=PA+SM。 重新计算这3个逻辑组对游泳动物食源贡献的分布频率。
• 操作步骤
– 打开STATISTICA软件 – 拖动”鮻.tot”至软件 界面中 – 把数据复制到Excel中进 行统计,把5个变量合 并3个变量 – 合并后按照2%的递差增 加对数据进行统计,得 到每种资源类型的贡献 分布频率 – 作图(见下页)
Mass balance tolerance 质量平衡忍受差参数, 一般输入0.01-0.05。 单位与同位素值的单位 一致,δ 单位为‰。 Tolerance越大,可接 受的值就越多
资源 种类 最多 10种
各资源实际测得的相 对应的同位素值
【file/save】保存,【file/open】打开文件,【calc】运行程序,【print】打印,【clear】清除 输入的数据 ,【view】查看运算结果数据,【graph】查看运算后频率分布直方图
• 如果出现右面无解的 情况,就要适当调整 increment或tolerance 的值 • 一般先调整tolerance, 把忍受差增加,得到 解的可能性也就增大
• 结果查看(图表)
– Graph →output → 鮻.tot
• 频率分布图
– Next :下一张 – Previous :上一张 – 直方图表示对应的贡献 百分比出现的频率
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