・18・ 结核病与胸部肿瘤2012年第1期Tuber&Thor Tumor,Mar 2012,No.1
结核分枝杆菌thyA基因突变与对氨基水杨酸钠耐药 关系的研究
孙勇 洪峰许绍发刘毅任卫聪孙照刚 高铁杰张治国 王廷民李传友
【摘要】 目的了解Mtb临床分离菌株中对氨基水杨酸钠(PAS)的耐药率及PAS耐药性与thyA基因突变的关系。方法从肺结核患 者的痰液或咽拭子标本中分离并鉴定Mtb 96株,采用比例法、PCR的方法检测上述Mtb临床菌株对PAS的耐药性情况及其thyA基因突变情 况。结果分离得到的96株Mtb中,65株为PAS敏感菌株和31株为PAS耐药菌株。以Mtb标准菌株H37Rv为对照,筛选敏感和耐药菌 株中的thyA突变率分别是46.1%(30/65)、71%(22/31),突变多为单个碱基的缺失和插入突变,其中又以第19位密码子缺失C、第168位 密码子缺失C为主,在耐药中所占比率分别是54.8%(17/31)、25.8%(8/31),其在敏感菌株中的比率也分别是35.5%(23/65)、12.3%(8/65)。 结论thyA基因可能是PAS耐药潜在靶点,但本研究未发现其特异性突变位点。 【关键词】分枝杆菌,结核;对氨基水杨酸钠;耐药;胸苷酸合成酶
A Study of Relationship between Mycobacterium tuberculosis thyA Mutation and
Resistantance to Para-aminosalicylic Acid
Sun Yong ,Hong Feng,Xu Shaofa,Liu Yi,Ren Weicong,Sun Zhaogang,Gao Ti ̄ie,Zhang Zhiguo,Wang Sumin, Li Chuanyou I Department of Bacteriology and Immunology,Beijing Tuberculosis and Thoracic Tumour Research Institute, Beijing 101 149,China.
【Abstract】Objective To study the resistance rates of clinical isolated Mycobactezium tuberculosis strains to para-aminosalicylic acid(PAS) and the relationship between PAS resistance with thyA gene mutation.Methods 96 strains isolated and identified in sputum or throat swab specimens from tuberculosis patients were analyzed for PAS resistance situation and thyA gene mutation using proportiona method and PCR method.Results Among 96identified strains ofMycobacteriumtuberculosis,65werePAS sensitive strainsand 31 PAS resistance strains.The stand ̄d strainsH37RvM. tuberculosis was as a control,thyA gene mumfion rates of the sensitive and resistant strains were 46.1%(30/65)and 71%(22/31),mostly with single base deletion and insertion mutations,which mainly presented missing at codon 19 C and deletion at codon 168 C.The percentage of mutation in the drug resistant strains were 54.8%(17/31),25.8%(8/31)and 35.5%(23/65),12.3%(8/65)in the sensitive strains.Conclusion ThyA gene could be a potential target for development of PAS resistance,but a specific mutation site has not been found in this study. 【Key words】Mycobacterium tuberculosis;Para—aminosalicylic acid;Drug resistance;Thymidylate synthase
目前,结核病仍是最常见的传染病之一,全世 界约有2亿人感染结核分枝杆菌,其中仅2010年新 增880万患者,140万人死于结核病 ”。近年来,
由于不合理的用药及新药研发的缓慢导致MDR—TB (至少对INH、RFP耐药的结核病)的患者的增多
及结核病防控的困难。2010年我国的结核患者中有 5.4%为MDR—TB患者 ”。由于结核分枝杆菌对一
线药物的耐药,人们开始更多关注二线抗结核药物,
基金项目:首都医学发展基金(2009—1055) 作者单位:101149北京,首都医科大学附属北京胸科医院细菌免疫学研究室(孙勇、刘毅、任卫聪、李传友),胸外科(许绍发) 100035北京,北京结核病控制研究所(洪峰、王 民); 102200北京,北京市昌平区结核病防治所(高铁杰、张治国) 通讯作者:李传友,Email:lichuanyou6688@hotmail.com;王筵民,E—mail:suminwang085@126.
com 结核病与胸部肿瘤2012年第1期Tuber&Thor Tumor,Mar 2012,No.1
并与一线抗结核药联合应用,但随着应用的二线药
物如喹诺酮类药物、卡那霉素、卷曲霉素等二线药
物的耐药出现,人们又开始寻找那些对Mtb有抑制 或杀菌作用而应用不是很广泛的药物,其中对氨基
水杨酸钠para.aminosalicylic acid(PAS)是重要的二
线抗结核病药物之一,但对其作用机制及耐药机制
尚不十分清楚。
PAS对Mtb有抑制作用,一般认为PAS与对氨 基苯甲酸(PABA)近似,通过对叶酸合成的竞争抑
制作用而抑制Mtb的生长繁殖 。Rengarajan等
在卡介苗菌株中利用转座子插入的方法,发现编码
胸苷酸合成酶(thymidylate synthase,thyA)的基因突
变抑制了酶的活性导致细胞内叶酸水平的下降,其
认为thyA基因突变不仅导致PAS耐药而且还是其 他和叶酸代谢相关药物的靶点。Ratledge等口 认为
PAS抑制了Mtb对铁离子的吸收,从而导致Mtb生 长受限及毒力的减弱。由于PAS不是临床首选药,
应用的相对较少,对其耐药的研究更少,目前认为 thyA基因的突变导致了PAS耐药[2】。本文通过全
基因测序测定thyA基因,了解65株PAS敏感菌株 和31株PAS耐药菌株thyA基因突变情况,分析了
PAS耐药与thyA基因突变的关系,探讨PAS耐药
分子机制,为建立快速耐药检测方法及指导临床医 生合理用药提供科学依据。
1材料与方法
1.1 材料
1.1.1临床菌株来源 本实验所用北京地区96株Mtb临床分离株来
源于2008~2010年北京市结核病控制研究所和北
京市昌平区结核病防治所,采集的痰标本按照《结
核病诊断实验室检验规程》进行Mtb的培养、菌种 鉴定,采用比例法测定药物敏感实验H】。标准菌株
H37Rv(ATCC25618)为本室保存。
1.1.2主要仪器设备 Bio—rad S1000基因扩增仪(美国Bio.rad公
司),FoToDYNE凝胶成像系统(美国Image公司),
Nanodrop2000核酸分析仪(美国Thermo公司),
ESCO II生物安全柜(新加坡ESCO公司)。 1.2方法
1.2.1细菌基因组DNA的抽提:采用酚/氯仿抽提
的方法 。
1.2.2 PCR扩增:primier 5.0设计引物上游5’GGTGTCG.
GTGGTrTTCGGCAT3’下游5’TCAGCCCCACCATC. GTCACAC3’扩增全长1060 bp,其中包含thyA基因(792
bp)。采用50u1体系,包括2¥PFU DNA聚合酶(北京 Generay公司)251 ̄1,上下游引物各0.4 ̄mol/l,1u1模板,
双蒸水22t ̄1。反应条件94 ̄C预变性5 min,94 ̄C变性30
S,62℃退火40 S,72℃延伸2_3 min,最后72℃延伸5
min,35个循环。
1.2.3 PCR纯化:PCR产物经1%琼脂糖凝胶中电
泳,用DNA凝胶回收试剂盒(杭州Axygen公司) 回收DNA扩增片断,分别送北京擎科新业和北京 金唯智生物科技公司测序。H37Rv的标准序列来自
结核数据库网站 】。采用DNAMAN Version 5.2.2软 件进行序列比对。
1.3统计分析数据采用SPSS 10.0进行统计分析, 组间比较采用x 检验,P<O.05为差异有统计学意义。
2结果
2.1 Mtb培养、鉴定及药物敏感结果分离得 到96株痰培养阳性菌株并进行鉴定和药物敏感实
验(表1)。全部鉴定为Mtb,耐PAS菌株31株
(32.3%),敏感菌株65株(67.7%),耐药与敏感菌
株的患者男性与女性差异无统计学意义(x =0.381, P>0.05);耐药与敏感菌株患者中初治耐药比例分别
达到了71%、86.2%,但两者差异并没有统计学意
义(x =3.177,P>0.05);同时北京常驻人口与外地
流动人员相比较耐药与敏感菌差异没有统计学意义
(x :0.037,Jp>0.05)。
表1 96株Mtb药物敏感性结果【n(%)】
耐药
敏感
合计 31(32 3、
65(67.7)
96 19(61.3)
44(67.7
62 9(29.O、
9(13.81
l8