福建医科大学博士研究生学位论文
遗传性痉挛性截瘫患者致病基因突变特征
及其与临床表型的关系
摘要
目的筛查并分析1996年至2008年我院神经内科所收集的来自全国的24例遗传
性痉挛性截瘫(HSP)家系的先证者和32例散发性HSP患者spastin、
atlastin、NIPAI和REEPl基因的突变,了解中国人这四个基因的突变特点
和基因型一表型关系,为该病的基因诊断奠定基础。进一步对以上患者行MJD
基因的筛查研究,明确是否存在M3D的痉挛性截瘫亚型。
方法联合应用变性高效液相色谱分析(DHPLC)和DNA序列分析方法对以上HSP
患者的gDNA进行spastJn、atlastin和NIPAI基因的突变筛查,并对24例HSP家系的先证者进一步直接测序行以上3个基因的DNA序列分析:另
外直接应用测序方法筛查以上全部患者的REEPI基因突变。采用PCR扩增
后产物分别进行2%琼脂糖凝胶电泳和变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳的
方法检测上述患者的MJD基因,条带异常的行测序证实。
结果在1个AD—HSP家系中发现1个位于spastin基因上的1616+19—t杂合突
变,是一个新型突变;未发现atlastin基因突变;在1个AD—HSP家系中
发现1个位于NIPAI基因上的C.316G>A杂合突变,是一个已知突变;未发
现SPG31基因突变。此外,我们还发现8种spastin基因多态、10种atlastin
基因多态、1种NIPAI基因多态,还有5种REEPI基因多态。另外我们发现
4个家系存在MJD基因变异,大片段CAG重复数分别为80/28、86/28、83/33
和76/29。
结论(i)首次在国内外报道spastin基因上的1616+19—t杂合突变。
(2)提示atlastin基因型在中国人中可能少见,其突变频率可能存在一定
的种族差异。(3)报道NIPAI基因上的已知杂合突变c.316G>A,提示为一突变热点;
NIPAI基因型在中国人中可能少见,其突变频率与国外报道的基本一致。
(4)首次在国内开展REEPI基因突变分析,提示REEPI基因型在中国人中
可能少见,其突变频率可能存在一定的种族差异。福建医科大学博士研究生学位论文
(5)发现了以上4个基因的大量多态,丰富了其多态库;但突变在本组HSP
患者中较少见,需要继续筛查HSP的其他基因。
(6)4例临床诊断HSP的患者通过基因诊断可以确诊为MJD,证实了HSP和
SCAs临床表现的复杂性和基因诊断的意义。
(7)DHPLC结合DNA序列分析是一种有效、经济的筛查突变的方法。
关键词:遗传性痉挛性截瘫,spastin基因,atlastin基因,NIPAl基因,REEPl
基因,交性高效液相色谱分析,DNA序列分析,突变,多态,脊髓小脑
性共济失调,MJD病,ATXN3基因;CAG重复福建医科大学博士研究生学位论文
CharacteristicsofMutationofDisease-causingGenesinChinese
PatientsDiagnosedasHereditarySpasticParaplegiaandits
RelationtoClinicalPhenotype
Abstract
objectives
TodeteCtthemutationsofspastin,atlastin,NIPAlandREEPlGeneinChinese
patientswithhereditaryspasticparaplegia(HSP)andestablishthebaseofthegene
diagnosisofliSP.ToscreentheMJDgenechangesforthepatientsaboveandascertain
thespasticparaplegiasubtypeofMJD.MethodsMutationanalysisofspastin,atlastinandNIPA1gene,carriedoutbypolymerasechainreactionandDHPLCcombinedwithsequencingin56unrelatedHSPindividuals
consistingoftheindexesfrom24HSPfamiliesand32sporadiccases.Thenspastin,atlastinandNIPAlgenesofthese24indexes,whileREEP1geneofall56individuals
wffrescreenedbypolymerasechainreactioncombined、析tlldirectsequencing.MJDgeneofindividualsaboveweresegregatedbymeansofAgroseGelElectrophoresisaswellasPolyaerylamideGelElectrophoresisafterpolymerasechainreactionproceeded,
andthenChangesofthemdetectedwereconfirmedbysequencing.ResultsOnenovelmutationofthespastingeneWasidentified(1616+1g>0inoneautosomaldominantfamily;nodiseasecausingmutationoftheatlastingeneWas
detectedinallcases;AreportedmutationoftheNIPAlgene(c.316G>A)Wasidentified
inanautosomaldominantfamily;nomutationWasidentifiedinREEP1geneofallcases.8polymorphismsinthespastingene,10polymorphismsintheat]astingene,1
polymorphismintheNIPA1geneand5polymorphismsintheREEP1genewereidentified.
Conclusions
(1)Themutationofspastingene,1616+lgq,havenotbeenreportedpreviouslyinthe
world.
3福建医科大学博士研究生学位论文
(2)ThemutationofatlastingeneinChineseHSPpatientsmayberare.Thelowermutationratemaybecorrelatedwithracialdiferentation.
(3)Weidentifiede.316G>A,amutationofNIPA1geneinallautosomaldominantHSP
family,whichisahotspot.(4)TheREEP1genewerefirstscreenedinChinesepatients,mutationsofwhichmayberare.
(5)Wealsofoundalotofpolymorphismsinthefourgenes.PolymorphismsarecolnliloninHSPpatients,butmutationsagelessinthefourgenes.WeshoulddetectothergenesofliSP.(6)WefoundchangesoftheMIDgeneoccurein4previouslydiagnosedHSPfamilies,suggestingtheimportanceofgenescreening.
(7)DHPLCtogether谢mDNAsequencingisaIlefficientandeconomicalmethodfor
screeningmutations.
Keywords:hereditaryspasticparaplegia;spastingene;atlastingene;NIPAlgene;REEPlgene;denaturinghigh-performanceliquidchromatography;DNA
sequencing;mutation;polymorphism;spinocerebellarataxia;Machado-Joseph
disease;ATXN3gene;CAGrepeats
4英文缩略词表
HSP/SPGHereditaryspasticparaplegia遗传性痉挛性截瘫
ADAutosomaldominant常染色体显性遗传
ARAutosomalrecessive常染色体隐性遗传
XRX-linkedrecessive性连锁隐性遗传
L1CAMCelladhesionmoleculeL1细胞粘附分子Ll
PLPIProteolipidprotein1蛋白脂蛋白1
NIPAlNonimprintedinPrader-Willi/Angelmansyndrome1普莱德一威利综
合征/安琪儿综合征非印迹蛋白1
KIF5Akinesinfamilymember5A驱动蛋白家族成员5A
HSP60/HSPDIHeatShock60kDaProtein1热休克60kDa蛋白1
BSCL2Berardinelli—Seipcongenitallipodystrophy2先天性脂肪代谢障碍2
REEPIreceptorexpression—enhancingprotein1受体表达增强蛋白一1
ZFYVE27zincfinger,FYVEdomaincontaining27锌指,含FYVE域27
PERpolymerasechainreaction聚合酶链反应
DHPLCdenaturinghigh-performanceliquidchromatography变性高效液相
色谱分析
SSCPSinglestrandconformationpolymorphism单链构象多态性
ASOallele—specific01igonucleotide等基因特异的寡核苷酸探针
AAAAnATPasewithvariouscellularactivities与多种细胞活性相关的ATP
酶
GBP3Guanylatebindingprotein一3鸟苷酸连接蛋白3
gDNAGenomeDNA基因组DNA
CTComputedtomography电子计算机断层扫描
MRIMagneticresonanceimage磁共振成像
NIIsneuronalintranuclearinclusions核内包涵体
SNPsinglenucleotidepolymorphism单核苷酸多态性
SCAsspinoeerebellar
ataxia脊髓小脑性共济失调