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遗传性痉挛性截瘫患者致病基因突变特征和其与临床表型的关系

福建医科大学博士研究生学位论文

遗传性痉挛性截瘫患者致病基因突变特征

及其与临床表型的关系

摘要

目的筛查并分析1996年至2008年我院神经内科所收集的来自全国的24例遗传

性痉挛性截瘫(HSP)家系的先证者和32例散发性HSP患者spastin、

atlastin、NIPAI和REEPl基因的突变,了解中国人这四个基因的突变特点

和基因型一表型关系,为该病的基因诊断奠定基础。进一步对以上患者行MJD

基因的筛查研究,明确是否存在M3D的痉挛性截瘫亚型。

方法联合应用变性高效液相色谱分析(DHPLC)和DNA序列分析方法对以上HSP

患者的gDNA进行spastJn、atlastin和NIPAI基因的突变筛查,并对24例HSP家系的先证者进一步直接测序行以上3个基因的DNA序列分析:另

外直接应用测序方法筛查以上全部患者的REEPI基因突变。采用PCR扩增

后产物分别进行2%琼脂糖凝胶电泳和变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳的

方法检测上述患者的MJD基因,条带异常的行测序证实。

结果在1个AD—HSP家系中发现1个位于spastin基因上的1616+19—t杂合突

变,是一个新型突变;未发现atlastin基因突变;在1个AD—HSP家系中

发现1个位于NIPAI基因上的C.316G>A杂合突变,是一个已知突变;未发

现SPG31基因突变。此外,我们还发现8种spastin基因多态、10种atlastin

基因多态、1种NIPAI基因多态,还有5种REEPI基因多态。另外我们发现

4个家系存在MJD基因变异,大片段CAG重复数分别为80/28、86/28、83/33

和76/29。

结论(i)首次在国内外报道spastin基因上的1616+19—t杂合突变。

(2)提示atlastin基因型在中国人中可能少见,其突变频率可能存在一定

的种族差异。(3)报道NIPAI基因上的已知杂合突变c.316G>A,提示为一突变热点;

NIPAI基因型在中国人中可能少见,其突变频率与国外报道的基本一致。

(4)首次在国内开展REEPI基因突变分析,提示REEPI基因型在中国人中

可能少见,其突变频率可能存在一定的种族差异。福建医科大学博士研究生学位论文

(5)发现了以上4个基因的大量多态,丰富了其多态库;但突变在本组HSP

患者中较少见,需要继续筛查HSP的其他基因。

(6)4例临床诊断HSP的患者通过基因诊断可以确诊为MJD,证实了HSP和

SCAs临床表现的复杂性和基因诊断的意义。

(7)DHPLC结合DNA序列分析是一种有效、经济的筛查突变的方法。

关键词:遗传性痉挛性截瘫,spastin基因,atlastin基因,NIPAl基因,REEPl

基因,交性高效液相色谱分析,DNA序列分析,突变,多态,脊髓小脑

性共济失调,MJD病,ATXN3基因;CAG重复福建医科大学博士研究生学位论文

CharacteristicsofMutationofDisease-causingGenesinChinese

PatientsDiagnosedasHereditarySpasticParaplegiaandits

RelationtoClinicalPhenotype

Abstract

objectives

TodeteCtthemutationsofspastin,atlastin,NIPAlandREEPlGeneinChinese

patientswithhereditaryspasticparaplegia(HSP)andestablishthebaseofthegene

diagnosisofliSP.ToscreentheMJDgenechangesforthepatientsaboveandascertain

thespasticparaplegiasubtypeofMJD.MethodsMutationanalysisofspastin,atlastinandNIPA1gene,carriedoutbypolymerasechainreactionandDHPLCcombinedwithsequencingin56unrelatedHSPindividuals

consistingoftheindexesfrom24HSPfamiliesand32sporadiccases.Thenspastin,atlastinandNIPAlgenesofthese24indexes,whileREEP1geneofall56individuals

wffrescreenedbypolymerasechainreactioncombined、析tlldirectsequencing.MJDgeneofindividualsaboveweresegregatedbymeansofAgroseGelElectrophoresisaswellasPolyaerylamideGelElectrophoresisafterpolymerasechainreactionproceeded,

andthenChangesofthemdetectedwereconfirmedbysequencing.ResultsOnenovelmutationofthespastingeneWasidentified(1616+1g>0inoneautosomaldominantfamily;nodiseasecausingmutationoftheatlastingeneWas

detectedinallcases;AreportedmutationoftheNIPAlgene(c.316G>A)Wasidentified

inanautosomaldominantfamily;nomutationWasidentifiedinREEP1geneofallcases.8polymorphismsinthespastingene,10polymorphismsintheat]astingene,1

polymorphismintheNIPA1geneand5polymorphismsintheREEP1genewereidentified.

Conclusions

(1)Themutationofspastingene,1616+lgq,havenotbeenreportedpreviouslyinthe

world.

3福建医科大学博士研究生学位论文

(2)ThemutationofatlastingeneinChineseHSPpatientsmayberare.Thelowermutationratemaybecorrelatedwithracialdiferentation.

(3)Weidentifiede.316G>A,amutationofNIPA1geneinallautosomaldominantHSP

family,whichisahotspot.(4)TheREEP1genewerefirstscreenedinChinesepatients,mutationsofwhichmayberare.

(5)Wealsofoundalotofpolymorphismsinthefourgenes.PolymorphismsarecolnliloninHSPpatients,butmutationsagelessinthefourgenes.WeshoulddetectothergenesofliSP.(6)WefoundchangesoftheMIDgeneoccurein4previouslydiagnosedHSPfamilies,suggestingtheimportanceofgenescreening.

(7)DHPLCtogether谢mDNAsequencingisaIlefficientandeconomicalmethodfor

screeningmutations.

Keywords:hereditaryspasticparaplegia;spastingene;atlastingene;NIPAlgene;REEPlgene;denaturinghigh-performanceliquidchromatography;DNA

sequencing;mutation;polymorphism;spinocerebellarataxia;Machado-Joseph

disease;ATXN3gene;CAGrepeats

4英文缩略词表

HSP/SPGHereditaryspasticparaplegia遗传性痉挛性截瘫

ADAutosomaldominant常染色体显性遗传

ARAutosomalrecessive常染色体隐性遗传

XRX-linkedrecessive性连锁隐性遗传

L1CAMCelladhesionmoleculeL1细胞粘附分子Ll

PLPIProteolipidprotein1蛋白脂蛋白1

NIPAlNonimprintedinPrader-Willi/Angelmansyndrome1普莱德一威利综

合征/安琪儿综合征非印迹蛋白1

KIF5Akinesinfamilymember5A驱动蛋白家族成员5A

HSP60/HSPDIHeatShock60kDaProtein1热休克60kDa蛋白1

BSCL2Berardinelli—Seipcongenitallipodystrophy2先天性脂肪代谢障碍2

REEPIreceptorexpression—enhancingprotein1受体表达增强蛋白一1

ZFYVE27zincfinger,FYVEdomaincontaining27锌指,含FYVE域27

PERpolymerasechainreaction聚合酶链反应

DHPLCdenaturinghigh-performanceliquidchromatography变性高效液相

色谱分析

SSCPSinglestrandconformationpolymorphism单链构象多态性

ASOallele—specific01igonucleotide等基因特异的寡核苷酸探针

AAAAnATPasewithvariouscellularactivities与多种细胞活性相关的ATP

GBP3Guanylatebindingprotein一3鸟苷酸连接蛋白3

gDNAGenomeDNA基因组DNA

CTComputedtomography电子计算机断层扫描

MRIMagneticresonanceimage磁共振成像

NIIsneuronalintranuclearinclusions核内包涵体

SNPsinglenucleotidepolymorphism单核苷酸多态性

SCAsspinoeerebellar

ataxia脊髓小脑性共济失调

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