一、稀释引物
1、4℃,15min、13000转离心(先等离心机降温)
2、根据OD值加DD水。
3、静置30min(冰上)
4、准备1.5毫升EP管,并加90ulDD水。
5、向EP管中加10ul引物,震荡离心,-20℃保存。
二、跑MIX检测引物(20ul体系)、
上引物0.8ul
下引物0.8ul
Mix 10ul
DNA(日本晴)1ul
DD水7.4ul
三跑高保真酶(50ul体系)
DNAorCDNA 2ul
上引物2ul
下引物2ul
5*buffer 10ul
dNTPs 5ul
DD水28ul
Pfu(最后加)1ul
四胶回收流程
1、在紫外线下切胶,用牙签装入2ml的EP管中。
2、按量加XP2,放在55℃水浴锅中10min,每2min摇匀1次,涡旋,短离。
3、将液体冷却到室温,转移到平衡住中,离心10000转,1min30s,倒掉滤液。
4、加入xp2 300ul,离心10000r,1min30s,倒掉滤液。
5、加入spw700ul,离心10000r,1min,倒掉滤液(重复一次)
6、空转2min,13000r,之后换1.5mlEP管。
7、套上保鲜膜放入37℃烘箱中,30min。
8、加入DD水10ul,静置2min,离心2min,13000r,重复3次,-20℃保存。
五、胶回收产物检测(10ul)体系
上引物0.4ul
下引物0.4ul
Mix 5ul
回收产物1ul
DD水 3.2ul
六、构建blunt cloning 载体(克隆载体)(4ul 体系)
胶回收产物 3.5ul
Blunt cloning 0.5ul
混匀后,PCR:25℃15min 盖子温度50℃
之后转化
1、提前5min从-70℃冰箱中拿出大肠杆菌感受态,冰上解冻5min。
2、将样品(4ul)加入感受态的大肠杆菌中,冰上30min,大约剩5min左右,打开水浴锅预热到42℃,并拿出SDC 培养基解冻(室温解冻)。
3、水浴锅42℃,60-90s迅速转移到冰浴2min,该过程中不要摇动离心管。
4、加入900ulSOC培养基,混匀。
5、37℃,160r摇床1h,使细菌复苏。
6、取出后离心3000r,2min。
7、吸出上清,留下100-150ul左右冻在LB 100ml+kana或者A 固体培养基上。
8、涂板,37℃过夜培养。
9、挑单菌落(一般不超过7个)加入到10ul的DD水中。
菌液PCR体系(10ul体系)
上游引物0.4ul
下游引物0.4ul
Mix 5ul
菌液1ul
DD水 3.2ul
之后跑电泳,若有目的条带则继续。
七摇菌
菌液+LB液体(加抗生素)-------L管(过夜摇菌)
第二天500ul菌液+500ul甘油混匀保存2管,其中一管送检,另一管-70℃保存。
若检测结果正确
八、提取质粒
1、在1.5ul的EP管中收集菌液,10000转,1min,弃上清,重复一次。
2、加205ul solution I(提前预热),用枪头打匀,室温静置2min。
3、加250ul solution II(提前预热),混匀,室温静置2min。
4、加350ul solutionIII,混匀,室温静置2min(有白色丝状物产生)
5、13000转,10min,取700ul上清液于吸附柱中,10000转,1min。
6、加500ul HBbuffer,12000转,1min,倒掉废液。
7、加700ul DNA wash buffer,13000转,1min,倒掉废液,重复一次。
再空离心2min 13000转。
8、37℃烘箱中干燥5分钟,加50ulDD水溶解,静置2min,离心13000转,2min。
九做酶切(50ul)
DD水19ul
K-B 5ul
质粒20ul
bamI 3ul
HIndIII 3ul
之后37℃烘箱,不超过16h
十、加5ul lodding buffer
若有条带胶回收。
十一胶回收(步骤同四)
十二做连接,连接表达载体
目的基因(胶回收的)4ul
载体(1300)1ul
DD水2ul
Buffer 2ul
T4连接酶1ul
过夜16℃,水浴连接。
十三、连接后转化,同“六”
十四、挑条单菌落
跑菌落PCR,若有条带,将剩下的9ul +LB液体+K 加入L管过夜培养。
十五、取L管500ul与500ul 甘油加入EP管中,并与-70℃保存
将L管剩下的菌液取1ul跑菌落PCR(10ul体系)
跑电泳检测结果。
十六提质粒
十七酶切检测
DD水7ul
K-B 1ul
质粒1ul
BamI 0.5ul
HinIII 0.5ul
37℃2.5h后可以检测。