界门纲目科属种生物分类学是研究生物分类的方法和原理的生物学分支。

分类就是遵循分类学原理和方法，对生物的各种类群进行命名和等级划分。

瑞典生物学家林奈将生物命名后，而后的生物学家才用域、界( Kingdom）、门( Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科( Family)、属( Genus)、种(Species)加以分类。

最上层的界，由怀塔克所提出的五界，比较多人接受；分别为原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及动物界。

从最上层的“界”开始到“种”，愈往下层则被归属的生物之间特征愈相近。

两界分类系统瑞典生物学家林奈(1707～1778），注意到周围的生物有固着不动和自养型的植物，也有自由瑞典植物学家林奈行动和异养型的动物。

因此，他把整个生物分成相应的两大类：植物界和动物界，即所谓的两界分类系统。

该系统把细菌类、藻类和真菌类归入植物界，把原生动物类归入动物界。

在分类上，这个系统自问世以来，一直沿用到20世纪50年代。

三界分类系统林奈把生物分为两大类群：固着的植物和行动的动物。

两百多年来，随着科学的发展，人们逐渐发现，这个两界系统存在着不少问题，但直到20世纪50年代，仍为一般教本所遵从，基本没有变动。

最初的问题产生于中间类型，如眼虫综合了动植物两界的双重特征，既有叶绿体而营光合作用，又能行动而摄取食物。

植物学者把它们列为藻类，称为裸藻；动物学者把它们列为原生动物，称为眼虫。

中间类型是进化的证据，却成为分类的难题。

为了解决这个难题，在19世纪60年代，人们建议成立一个由低等生物所组成的第三界，取名为原生生物界，包括细菌、藻类、真菌和原生动物。

这个三界系统解决了动植物界限难分的问题，但未被接受，整整100年后，直到20世纪50年代，才开始流行了一段时间，为不少教科书所采用。

四界分类系统在三界分类系统，只因真菌类(如我们日常食用的蘑菇以及遗传上常用的实验材料粗糙脉孢菌和面包酵母）固着生活和有细胞壁而归入植物界。

但真菌细胞壁的化学组成是几丁质（而不是纤维素），储存的是糖原（而不是淀粉），这些都有别于其他植物。

真菌虽为异养型，但主要为腐生或寄生，有别于动物的异养摄生或异养摄食；真菌为细胞外消化，即把其消化酶分泌到食物上，在胞外把食物分解后再吸收到胞内供利用，也有别于动物的细胞内消化。

由于真菌与植物和动物的上述明显差异，所以在1959年魏泰克(R·H·Whittaker）提出了另立1个真菌界的四界（原生生物界、真菌界、植物界和动物界）分类系统。

五界分类系统魏泰克(R.H.Whittaker,1924—1980）将生物分成五个界。

目前，生物分类学上使用较广的是五界分类系统，它是由美国生物学家魏泰克（R.H.Whittaker,1924—1980）在1969年提出的。

魏泰克在已区分了植物与动物、原核生物与真核生物的基础上，又根据真菌与植物在营养方式和结构上的差异，把生物界分成了原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界和动物界五界。

其中的原生生物界包括一切真核的单细胞生物和没典型细胞分化的多细胞生物。

在这些生物中，有些似乎应放在动物界，如草履虫、变形虫，有些似乎应放在植物界，如衣藻、团藻，而有些则兼有植物和动物（或真菌）的双重特征，如眼虫和黏菌。

魏泰克认为，这些生物处于进化的低级阶段，它们之间是没有清楚界限的，因此，可以放在一个界中。

但是，有些分类学家则主张将它们分别放到动物界或植物界中，对于那些同时具有动物和植物两方面特征的生物，可以既收入植物界，也收入动物界，承认它们的“双重身份”。

五界系统按复杂性增加的三个层次排列生命：原核的单细胞（原核生物界）；真核的单细胞（原生生物界）；真核的多细胞（植物界、真菌界和动物界）。

随着生物层次的上升，生物变得愈加多样化，因为生物结构和功能复杂性的增加，变异的机会增多。

多细胞生命的三个界代表了一种生态的和形态的分类。

植物（生产）、真菌（还原）和动物（消费）代表了我们这个世界上三种主要生存方式。

五界系统：原核生物界、原生生物界、植物界、菌物界、动物界。

两总界五界分类系统中国学者陈世骧等认为，上述五界分类系统把原生生物界列为一个中间阶段，削弱了原核与真核两个基本阶段的对比性；在原核生物界和原生生物界内，也没有考虑生态关系。

为此，去掉原生生物界而成为两总界五界分类系统：原核总界（分为细菌界和蓝藻界）和真核总界（分为植物界、真菌界和动物界）；原来属于原生生物界的生物，依情况分属到植物界、真菌界和动物界。

六界分类系统随着分子生物学技术的进步，人们发现在五界分类系统中，原核界的细菌在形态上尽管很相似，但根据分子水平上的差异可明显分成两大类：古细菌和真细菌。

例如，在古细菌中，存在TATA键合蛋白盒子（ATTA box-bindingprotein），这也是真核生物中RNA多聚酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ的基本转录因子，但在真细菌中却没有这种转录因子。

又如，在核糖体RNA(rRNA）的同源性上，在细胞壁和细胞膜的成分上，以及在转移RNA(tRNA）稀有碱基的差别上，古细菌和真细菌都有明显不同；这个不同甚至要超过它们各自与真核生物的不同。

所以，沃斯(C·R·Woese）认为，应把原核生物界分类两界：古细菌界和真细菌界。

古细菌界的细菌主要生活在一些极端环境中，如沼泽地底层（甲烷细菌）、热泉（如布氏火盘菌，最适生长温度达105 ℃）等。

真细菌界的细菌为常见类型，有共生的，如遗传研究的重要细菌大肠杆菌；有寄生和致病的，如沙门氏菌和葡萄球菌。

真细菌界还包括蓝绿藻。

关于六界间的生物在进化上的关系，沃斯根据它们在分子水平上的差异认为，所有生物有3种最基本的类型：古细菌、真细菌和最简单的真核生物。

由于它们彼此间在分子水平上的差异大小近于相等，所以它们可能或多或少直接起源于地球上的原始生命，即原始生命在自然选择过程中，或迟或早地出现了这3种类型的独立进化途径。

开始，可能古细菌在地球上占优势，因为它们的代谢很好地适应了原始地球条件（富有二氧化碳，缺氧、高温）。

往后，当氧成为大气的主要成分和地球温度逐渐变冷时，适合于需氧和较低温度的真细菌又可能占优势。

关于真核细胞的起源一直是个谜。

根据分析，真核生物叶绿体的DNA和蓝绿藻的DNA极为相似，而有些真核细胞的基因又与古细菌的极为相似，所以最简单的真核生物可能有复杂的起源，即原始生命、古细菌和真细菌都可能参与了这一过程，再后，最简单的真核生物，在长期的自然选择过程中又进化成四界：原生生物界、植物界、真菌界和动物界。

病毒是结构上极为简单的非细胞生物。

病毒是生物，是因它具有生命的某些特征，如借助于宿主细胞可以进行繁殖，以产生更多的病毒。

但其简单的结构，到底是原始地球上的最初生命形式，还是原核界生物退化的产物，现尚无定论，从而也还不能确定其分类地位。

生命的历史非细胞形态的生命生命的历史经历了几个重要阶段，最初的生命应是非细胞形态的生命，当然，在细胞出现之前，必须有个“非细胞”或“前细胞”的阶段。

病毒就是一类非细胞生物，只是关于它们的来历，是原始类型，还是次生类型，仍未定论。

从非细胞到细胞式生物从非细胞到细胞是生物发展的第二个重要阶段。

早期的细胞是原核细胞，早期的生物称为原核生物（细菌、蓝藻）。

原核细胞构造简单；没有核膜，没有复杂的细胞器。

从原核到真核式生物从原核到真核是生物发展的第三个重要阶段。

真核细胞具有核膜，整个细胞分化为细胞核和细胞质两个部分：细胞核内具有复杂的染色体装置，成为遗传中心；细胞质内具有复杂的细胞器结构，成为代谢中心。

由核质分化的真核细胞，其机体水平远远高出于原核细胞。

从单细胞真核生物到多细胞生物从单细胞真核生物到多细胞生物是生命史上的第四个重要阶段。

随着多细胞体形的出现，发展了复杂的组织结构和器官系统，最后产生了高级的被子植物和哺乳动物。

植物、菌类和动物组成为生态系统的三个环节。

绿色植物是自养生物，是自然界的生产者。

它们通过叶绿素进行光合作用，把无机物质合成有机养料，供应自己，又供应异养生物。

菌类是异养生物，是自然界的分解者。

它们从植物得到食料，又把有机食料分解为无机物质，反过来为植物供应生产原料。

动物亦是异养生物，它们是消费者，是地球上最后出现的一类生物。

即使没有动物，植物和菌类仍可以存在，因为它们已经具备了自然界物质循环的两个基本环节，能够完成循环过程中合成与分解的统—。

但是，如果没有动物，生物界不可能这样丰富多彩，更不可能产生人类。

植物、菌类和动物代表生物进化的三条路线或三大方向。

1 藻类植物（Algae）1.1 蓝藻门（Cyanophyta）--蓝藻纲（Cyanophyceae）---色球藻目（Chroococcales）/管胞藻目（Chamaesiphonales）/颤藻目（Osillatoriales）1.2 裸藻门(Euglenophyta)--裸藻纲(Euglenophyceae) --裸藻目（Euglenales）/柄裸藻目（Colaciales）1.3 金藻门(Chrysophyta)--金藻纲(Chrysophyceae) --金胞藻目（Chrysomonadales）/根金藻目（Rhizochrysidales）/金囊藻目（Chrysocapsales）/ 金球藻目（Chrysosphaerales）/金枝藻目（Phaeothamniales）1.4 甲藻门(Pyrrophyta)--纵裂甲藻纲（Desmophyceae）--原甲藻目（Prorocentrales）横裂甲藻纲（Dinophyceae）--多甲藻目（Peridi-niales）/变形甲藻目（Dinamoebidiales）/胶甲藻目（Gloeodiniales）/球甲藻目（Dinococcales）/丝甲藻目（Dinotrichales）1.5 黄藻门（Xanthophyta）(Chromophyta)--黄藻纲(Xanthophyceae) --异鞭藻目（Heterochloridales）/根黄藻目（Rhizochloridales）/异囊藻目（Heteroglocales）/柄球藻目（Mischococcales）/异丝藻目（Heterotrichales）/气球藻目（Botrydiales）1.6 硅藻门(Bacillariophyta)--中心硅藻纲--圆筛藻目/根管藻目/盒形藻目羽纹硅藻纲/无壳藻目/单壳藻目/短壳藻目/双壳藻目/管壳藻目1.7 绿藻门（Chlorophyta）--绿藻纲（Chlorophyceae）--团藻目（Volvocales）/四胞藻目（Tetrasporales）/色球藻目（Chlorococcales）/丝藻目（Ulotrichales）/胶毛藻目（Chaetophorales）/石莼目（Ulvales）/溪菜目（Prasiolales）/鞘藻目（Oedogoniales）/刚毛藻目（Cladophrales）/管藻目（Siphonales）/管枝藻目（Siphonocladales）/绒枝藻目（Dasycladales）/双星藻目（Zygnematales1.8 轮藻门(Charophyta)--轮藻纲（Charophyceae）--轮藻目1.9 褐藻门(phaeophyta)等世代纲不等世代纲无孢子纲 1.10 红藻门(Rhodophyta)红藻纲l 紫菜亚纲l 真红藻亚纲2 地衣植物门（Lichenes）--子囊衣纲（Ascolichens）/担子衣纲（Basidiolichens）/半知衣纲（Deuterolichens）3 苔藓植物门（Bryophyta）3.1 苔纲（Hepaticae）--藻苔目/地钱目/美苔目/囊果苔目/叶苔目3.2 藓纲（Musci）/泥炭藓亚纲（Sphagnidae）/黑藓亚纲（Asdreaeidae）/真藓亚纲（Bryidae）3.3 角苔纲（Anthocerotae）4 蕨类植物门(Pteridophyta)4.1 石松亚门(Lycophytina)--石松纲Lycopsida4.2 水韭亚门(Isoephytina) --水韭纲Isoetinae -- 水韭目Isoetales/水韭科Isoetaceae 水韭属Isoetes spp.4.3 楔叶蕨亚门（Sphenophytina）--楔叶蕨纲(Sphenopsida) --木贼目(Equisetales) 木贼科(Equisetaceae) --木贼属(Equisetum)4.4 裸蕨亚门(Psilophytina)--裸蕨纲Psilopsida --松叶蕨目Psilotales --松叶蕨科Psilotaceae4.5 真蕨亚门(Filicophytina)--厚囊蕨纲(Eusporangiopsida) /原始薄囊蕨纲(Protolyptosporangiopsida) /薄囊蕨纲(Leptosporangiopsida)5 种子植物门（Spemaiophyla）5.1 裸子植物亚门Gymnospermae5.1.1 银杏纲(Ginkgopsida)-- 银杏目Ginkgoales--银杏科Ginkgoaceae⒌1.2 松柏纲(Coniferopsida)科达目（已绝种）伏脂杉目（已绝种）松柏目(Coniferales)⒌1.3 苏铁纲(Gycadopsida)种子蕨目(Pteridospermae）（已绝种）开通目(Caytoniales）（已绝种）本内苏铁目(Bennettitales）（已绝种）苏铁目（Cycabales）⒌1.4 买麻藤纲(Gnetopsida) --买麻藤目(Gnetales) /麻黄目(Ephedrales) /百岁兰目(Welwitschiales)⒌1.5 红豆杉纲（Taxopsida) --红豆杉目Taxales5.2 被子植物亚门（木兰门）Angiospermae或Magnoliophyta或flowering plants5.2.1 单子叶植物纲（百合纲）Liliopsida⒌2.1.1 百合亚纲Liliidae --百合目Liliales百合科Liliaceae --蒜属：蒜，洋葱，韭菜风信子科Hyacinthaceae 风信子属Hyacinthus ：风信子Hyacinth田葱科Philydraceae /龙舌兰科Agavaceae/鸢尾科Iridaceae /百部科Stemonaceae /菝葜科Smilacaceae /薯蓣科Dioscoreaceae /蒟蒻薯科Taccaceae兰目Orchidales /兰科Orchidaceae /水玉簪科Burmanniaceae⒌2.1.2 泽泻亚纲Alismatidae --泽泻目Alismatales /水鳖目Hydrocharitales /茨藻目Najadales /霉草目Triuridales⒌2.1.3 槟榔亚纲Arecidae --槟榔目Arecales /环花草目Cyclanthales /露兜树目Pandanales /天南星目Arales-- 天南星科Araceae /浮萍科Lemnaceae⒌2.1.4 鸭跖草亚纲Commelinidae --鸭跖草目Commelinales /谷精草目Eriocaulales 帚灯草目Restionales /灯心草目Juncales/莎草目Cyperales ---禾本科Poaceae --竹Bamboo /莎草科Cyperaceae --香蒲目Typhales⒌2.1.5 姜亚纲Zingiberidae --姜目Zingiberales --美人蕉科Cannaceae /闭鞘姜科Costaceae /赫蕉科Heliconiaceae/蝎尾蕉科/兰花蕉科Lowiaceae /竹芋科Marantaceae /芭蕉科Musaceae /鹤望兰科Strelitziaceae/旅人蕉科/姜科Zingiberaceae凤梨目Bromeliales⒌2.2 双子叶植物纲（木兰纲）Magnoliopsida⒌2.2.1 木兰亚纲Magnoliidae --木兰目Magnoliales /樟目Laurales /胡椒目Piperales/ 睡莲目Nymphaeales/马兜铃目Aristolochiales/八角茴香目Illiciales /毛茛目Ranunculales /毛茛科Ranunculaceae ---毛茛属Ranuculus/芍药属-- 芍药-牡丹罂粟目Papaverales --十字花科--萝卜属⒌2.2.2 金缕梅亚纲Hamamelidae --金缕梅目Hamamelidales l 悬铃木科Platanaceae 悬铃木属--英桐- 美桐- 法桐杜仲目Eucommiales 荨麻目Urticales l 榆科Ulmaceae 朴属--白榆-榔榆榆属--黑弹树l 桑科Moraceae 桑属--桑树构树属--构树柘树属--柘树胡桃目Juglandales l 胡桃科Juglandaceae 核桃属--核桃枫杨属--枫杨山毛榉目Fagales l 桦科Betulaceae ⒌2.2.3 石竹亚纲Caryophyllidae 石竹目Caryophyllales l 仙人掌科Cactaceae l 马齿苋科Portulacaceae 蓼目Polygonales ⒌2.2.4 五桠果亚纲Dilleniidae 五桠果目Dillaniales l 芍药科Paeoniaceae 山茶目Theales l 猕猴桃科Actinidiaceae 猕猴桃属--猕猴桃锦葵目Malvales l 锦葵科Malvaceae 木槿属Hibiscus l 梧桐科Sterculiaceae l 椴树科Tiliaceae 猪笼草目Napenthales 堇菜目Violales l 葫芦科Cucurbitaceae l 西番莲科Passifloraceae l 柽柳科Tamaricaceae 杨柳目Salicales l 杨柳科Salicaceae 杨属- 毛白杨- 加杨- 青杨- 大官杨柳属--旱柳- 垂柳- 杞柳杜鹃花目Ericales 柿目Ebenales l 柿科Ebenaceae 柿树属--柿树- 软枣⒌2.2.5 蔷薇亚纲Rosidae 蔷薇目Rosales l 蔷薇科Rosaceae 梨属--白梨苹果属--苹果，海棠山楂属--山楂樱属--杏- 桃蔷薇属--月季-玫瑰-蔷薇豆目Fabales l 含羞草科Mimosaceae 合欢属--合欢l 苏木科Caesalpinaceae 皂英属皂英l 蝶形花科Fabaceae 槐属--国槐紫穗槐属--紫穗槐刺槐属--刺槐紫藤属--紫藤桃金娘目Myrtales l 石榴科Punicaceae 石榴属--石榴l 使君子科Combretaceae 红树目Rhizophorales 山茱萸目Cornales l 珙桐科Nyssaceae 珙桐属--珙桐檀香目Santalales 卫矛目Celastrales l 冬青科Aquifoliaceae 大戟目Euphorbiales l 黄杨科Buxaceae 黄杨属--雀舌黄杨- 锦熟黄杨鼠李目Rhamnales l 鼠李科Rhamnaceae 鼠李属--长叶冻绿- 园叶鼠李- 薄叶鼠李- 冻绿匀儿茶属--多花勾儿茶- 牯岭勾儿茶枳属--枳- 毛枳枣属--枣树铜钱树属--铜钱树猫乳属--猫乳雀梅藤属--钩状雀梅藤雀梅藤属--雀梅藤l 葡萄科Vitaceae 葡萄属--葡萄- 东南葡萄- 薄叶葡萄- 刺葡萄蛇葡萄属--闪光蛇葡萄- 蛇葡萄- 小叶蛇葡萄爬山虎属--爬山虎- 粉叶爬山虎- 三叶爬山虎乌蔹莓属--乌蔹莓- 大叶乌蔹莓亚麻目Linales l 古柯科Erythroxylaceae 无患子目Sapindales l 苦木科Simaroubaceae 臭椿属--臭椿楝科Meliaceae 楝属--苦楝香椿属--香椿l 橄榄科Burseraceae Aceraceae l 芸香科Rutaceae 柑橘属牻牛儿苗目Geraniales l 凤仙花科Balsaminaceae 伞形目Apiales 山龙眼目Proteales l 胡颓子科Elaeagnaceae 胡颓子属--铜色叶胡颓子木半夏- 胡颓子- 牛奶子虎儿草目l 茶藨子科醋栗属⒌2.2.6 菊亚纲Asteridae 龙胆目Gentianales 茄目Solanales 车前目Plantaginales 玄参目Scrophulariales l 木犀科Oleaceae 白蜡属--白蜡茉莉属--茉莉、迎春花连翘属--连翘l 玄参科Scrophulariaceae 泡桐属--楸叶桐- 兰考桐l 紫葳科Bignoniaceae 梓树属--楸树- 梓树桔梗目Campanulales 茜草目Rubiales 菊目Asterales生物分类学的历史人类早期分类人类在很早以前就能识别物类，给以名称。