系统分析软件使用简易教程
舒江平
注：仅为入门简易教程，有兴趣的话可以自己多玩玩！
1、序列拼接、校对
Seq-Man
材料
序列（公司返回的测序结果）
软件：Seq-Man（DNAstar）
1、打开Seq-man
2、导入序列
1、找到需要
拼接校对序列
2、导入
1、已导入
2、完成
拼接
双击打开
拼接、校对界面，放大
2、根据峰图检查校对
3、保存校对
成功的序列
1、展开峰图
保存序列
选择保存位置
输入文件名保存
2、序列比对，编辑
BioEdit
材料
校对好的序列
软件
1、打开软件
2、新建文件
导入序列
选择序列文件
比对
比对哪些序列，选哪些序列，如果一个没选，默认全选
比对哪些序列，选择哪些序列
运行
点击ok
运行界面相似度（PS：一般相似度
出现个位数的都是序列反
向的结果）
1、显示比对结果
对齐
序列反向序列（相似度个位数）
2、调整序列方向1、在最初
新建的比对
中选择反向
序列
2、再次比对1、重新全选
都出现正常相似度
检查序列
结合Seq-man
检查校对突变
位点
1、保存
2、选择
保存位置
3、文件名
4、
保存
文件格式.Fasta
3、建基因树
MEGA
材料比对好的序列
软件
1、打开软件MEGA
2、选择建树
方法（eg：NJ）
选择建树文件打开
文件类型
点ok
按文件类型选（本次NO）
1、参数选择
2、计算
开始计算
树出来啦！！！
导出树
工具栏，自己
摸索，很简单
的
That’s all, thank you!!!。