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siRNA说明书

产品以冻干粉的形式,常温运输。

收到产品后,请于-20 C〜-80 'C保存,冻干粉可以稳定保存一年。

使用前请瞬时离心,用RNase-freeH 2O或者灭菌ddH20,配制成20gM储存液,分装保存,避免反复冻
融(尽量不超过5次)。

表120 gM储存液的配置参考
使用前须知
为避免外界因素(包括酶,极端pH或者温度条件等)导致产品降解,所有操作请严格遵循RNA操作规则。

实验过程中,产品最好于冰上放置,使用完毕后请于-20 C~-80 C小心保存。

细胞实验方法
为了降低细胞密度、试剂用量,转染效率等因素导致的孔间差异,保证实验可靠性和可重复性,一般建议:
a. 转染实验中每个转染样品至少设置3个以上复孔;
b. 接种细胞时,每孔接种的细胞数量尽量保持一致,并且细胞在各孔的表面平均分布。

1. 转染浓度:
siRNA产品最佳工作浓度因不同的细胞类型及研究目的而异。

推荐初始转染浓度为50nM,转染后检测时
间为24〜72h。

最佳转染效率一般通过设置时间曲线和浓度梯度进行优化,优化的范围建议为5~100nM。

2. 转染步骤:
以Iipofectamine2000(简称Iipo2000)转染siRNA于24孔板,转染浓度为50nM为例,其他规格容器转染
请参考表2。

1)转染前一天,接种适当数量的细胞至细胞培养板中,每孔中加入不含抗生素的培养基,使转染时的细胞
密度能够达到30~50%(不同细胞生长速度不一样,因此,接种细胞的数量需要根据细胞培养的经验)。

注意: 转染时,细胞密度是影响转染效率的关键因素之一,细胞生长过度会削弱细胞活力,降低细胞的转染效率。

2)对于每个转染样品,请按以下步骤准备siRNA-Iipo2000混合液:
a. 稀释siRNA :用50 g 不含血清培养基Opti-MEM I (v1)稀释g I20 gM siRNA储存液,轻轻混匀,室温孵育5min ;
b. 稀释Iipo2000 :用50 g不含血清培养基Opti-MEM I (v1)稀释1 g Ilipo2000,轻轻混匀并室温孵育5min ;
c. 将a与b轻轻混匀,室温孵育20min(溶液可能会有浑浊,但不会影响转染)。

注意:稀释好的Iipo2000长时间放置可能导致转染试剂活性的降低,应尽量在25min之内与稀释好的siRNA
混合。

另在混合试剂时,请勿剧烈吹打或振荡,手指轻弹管壁即可,过度用力可能会破坏脂质体的结构,
甚至影响siRNA-lipo2000 混合物的形成。

3)将siRNA-Iipo2000混合液加入含有细胞的400 gl培养基(v2)的培养孔中,轻轻混匀;
4)(可选)培养4〜6h后,将孔中含siRNA-Iipo2000混合液的培养基移去,更换新鲜培养基;
5)(可选)进行其他必要的特殊处理(如加药处理);
6)将培养板置于37'C的C02培养箱中培养24〜96h(培养时间与实验目的相关)。

表2使用Iipo2000(invitrogen)转染siRNA 产品用量参考
v1 : Opti-MEMI(无血清、无抗生素,转染专用);v2 :完全或不完全培养基
96-well
100 卩l(25 卩l+25 卩l+50
卩l)100nM gl gl10~100ng 100 卩l(25 卩l+25 卩l+50
卩l)50nM A1g】10~100ng 100 卩l(25 卩l+25 卩l+50
卩l)30nM g1g】10~100ng 100 卩l(25 卩l+25 卩l+50
卩l)20nM gl gl10~100ng 100 卩l(25 卩l+25 卩l+50
卩l)10nM g1A
1
10~100ng 24-well
500 卩l(50 卩l+50 卩l+400
卩l)
100nM gl 1 gl100~200ng
*500 卩l(50 卩l+50 卩l+400
卩l)
50nM gl 1 gl100~200ng 500 卩l(50 卩l+50 卩l+400
卩l)30nM gl 1 gl100~200ng 500 卩l(50 卩l+50 卩l+400
卩l)20nM gl 1 gl100~200ng 500 卩l(50 卩l+50 卩l+400
卩l)10nM gl 1 gl100~200ng 12-well
1mL (100 卩l+100 卩l+800
卩l)100nM 5 gl 2 gl200~400ng 1mL(100 卩l+100 卩l+800 卩
l)50nM gl 2 gl200~400ng 1mL(100 卩l+100 卩l+800 卩
l)30nM g】 2 gl200~400ng 1mL(100 卩l+100 卩l+800 卩
l)20nM 1 gl 2 gl200~400ng 1mL(100 卩l+100 卩l+800 卩
l)10nM gl 2 gl200~400ng 2mL(250 g l+250 g l+1500 g l)50nM 5 gl 5 gl500~1000ng
2mL(250 g l+250 g l+1500 g l)30nM 3 gl 5 gl500~1000ng
2mL(250 g l+250 g l+1500 g l)20nM 2 gl 5 gl500~1000ng
2mL(250 g l+250 g l+1500 g l)10nM 1 gl 5 gl500~1000ng
2mL(250 卩l+250 卩1+1500
卩l)卩

* :实验参考用量示例;:当实验涉及DNA共转时参考
3.效果检测:
转染完成后24~72小时均可进行siRNA沉默效果检测,最佳检测时间与细胞类型,转染试剂,检测目的等

关。

1)RNA水平的检测:mRNA是检测siRNA沉默效率的最佳指标,siRNA转染后24~72h即可检测到靶基因mRNA表达明显降低,检测方法宜采用qPCR检测方法。

注:引物设计质量很重要;
2)蛋白水平的检测:蛋白是RNAi沉默效率的重要指标,其检测手段主要为Western-blot等。

检测时间受
细胞内蛋白质表达量、半衰期等因素的影响,一般为48~96h,甚至更长时间之后多点采样;
3)功能筛选:应用EdU细胞增殖、EdUTP细胞凋亡等检测方法进行siRNA对细胞功能的直接筛选。

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