生物化学--杨荣武教授
☺ 孤雁本色,一行斜去浮生转 两鬓白,异家龙井难为甘 疏水氨基酸:本-苯丙氨酸;色-色氨酸;斜-缬氨酸;浮脯氨酸;两-亮氨酸;鬓-丙氨酸;异-异亮氨酸;家-甲硫 氨酸;甘-甘氨酸
必需氨基酸VS非必需氨基酸
必需氨基酸是指人体必不可少,而机体内又不能合成、 必须从食物中补充的氨基酸。如果饮食中经常缺少它们, 就会影响健康。必需氨基酸共有10种:Lys、Trp、Phe、 Met、Thr、Ile、Leu、Val、Arg和His。人体虽能够合成 Arg和His,但合成的量通常不能满足正常的需要,因此 这两种氨基酸又被称为半必需氨酸。-Tip MTV Hall
蛋白质结构的多样性
蛋白质的结构层次
1. 一级结构 (1º) : 独特的氨基酸序列,由基因决定。
2. 二级结构 (2º) :多肽链的主链骨架本身(不包括R基团)
在空间上有规律的折叠和盘绕,它是由氨基酸残基非 侧链基团之间的氢键决定的。
3. 三级结构 (3º) :是指多肽链在二级结构的基础上,进一
步盘绕、卷曲和折叠,形成主要通过氨基酸侧链以次 级键以及二硫键维系的完整的三维结构。
疏水氨基酸,即非极性氨基酸,其R基团呈非极性,对 水分子的亲和性不高或者极低,但对脂溶性物质的亲和 性较高。它们包括:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、 Met、Phe和Trp。
词记亲水氨基酸与疏水氨基酸
☺ 西湖景,紫竹为骨水潺潺 横笛相伴,闲听天簌静思禅 流苏落,心比双丝郁中缠 亲水氨基酸:西-硒代半胱氨酸;景-精氨酸;竹-组氨酸; 骨-谷氨酸 谷氨酰胺;伴-半胱氨酸;天-天冬氨酸 天冬酰胺;籁-赖氨酸;苏-苏氨酸;落-酪氨酸;比-吡咯 赖氨酸;丝-丝氨酸
➢氨基酸的构型与其旋光方向没有必然的联系。
特殊的酸碱性质与等电点
由于氨基酸既含有碱性的氨基又含有酸性的羧 基,因此氨基酸具有特殊的解离性质,但氨基 算的碱性和酸性分别弱于单纯的胺和羧酸。一 个氨基酸分子内部的酸碱反应使氨基酸能同时 带有正负两种电荷,以这种形式存在的离子被 称为兼性离子(zwitterions)或两性离子。
蛋白质可能含有一条或多条肽链
1. 一条多肽链-单体蛋白 2. 不止一条多肽链-寡聚蛋白:同源寡聚体-同种肽链异
源寡聚体-两种或多种不同的肽链;血红蛋白是一种 异源四聚体:2条α链,2条β链。
蛋白质可能含有非蛋白质成分
1. 多肽链 +可能是辅助因子(金属离子、辅酶或辅 基),也可能是其他修饰。
2. 例如,羧肽酶的辅助因子是Zn2+;乳酸脱氢酶的辅酶 是辅酶I;血红蛋白的辅基是血红素。
氨基酸的缩合反Βιβλιοθήκη 与肽的形成氨基酸的手性:D型与L型氨基酸
➢22种蛋白质氨基酸分子中,除了甘氨酸,均至少含 有一个不对称碳原子,因此除甘氨酸以外的21种蛋 白质氨基酸都具有手性性质。如果以L型甘油醛为参 照物,具有不对称碳原子的氨基酸就有D型和L型两 种对映异构体。实验证明,蛋白质分子中的不对称 氨基酸都是L型。D型氨基酸仅存在于一些特殊的抗 菌肽和某些细菌的细胞壁成分之中,它们不能参入 到在核糖体上合成的多肽或蛋白质分子之中。
4. 四级结构 (4º)具有两条和两条以上多肽链的寡聚蛋白
质或多聚蛋白质才会有四级结构。其内容包括亚基的 种类、数目、空间排布以及亚基之间的相互作用。
蛋白质的一级结构
是蛋白质的共价(肽键)结构 对于每一种蛋白质而言,都是独特的。 由编码它的基因的核苷酸序列决定。 是遗传信息的一种形式。 书写总是从N端到C端。
例如,胰岛素A链的一级结构是: Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-CysSer-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn
一种蛋白质的一级结构由编码 它的基因的核苷酸序列决定
DNA: GGC ATT GTG GAA CAA TGC TGT mRNA: GGC AUU GUG GAA CAA UGC UGU
余下的氨基酸则属于非必需氨基酸,动物体自身可以进 行有效的合成,它们包括:Ala,Asn、Asp、Gln、Glu、 Pro、Ser、Cys、Tyr和Gly。
一组(组氨酸)笨(苯丙氨酸)蛋(蛋氨酸)精 (精氨酸)来(赖氨酸)宿(苏氨酸)舍(色氨 酸)住(组氨酸)亮(亮氨酸)凉(异亮氨酸) 鞋(缬氨酸)
例如:瓜氨酸、鸟氨酸和羟脯氨酸
氨基酸的分类
根据侧链基团的水溶性,氨基酸可以分为: (1)疏水aa——非极性R基团 (2)亲水aa——极性的R基团 根据对动物的营养价值,氨基酸又可以分为: (1)必需aa (2)非必需aa
亲水氨基酸VS疏水氨基酸
亲水氨基酸,即极性氨基酸,其R基团呈极性,一般能 和水分子形成氢键,故对水分子具有一定的亲和性。它 们包括:Ser、Thr、Tyr、Cys、Sec、Asn、Gln、Asp、 Glu、Pyl、Arg、Lys、His;
等电点(pI)
对于任何一种氨基酸来说,总存在一定的pH值,使其净 电荷为零,这时的pH值被称为等电点。pI是一个氨基酸 的特征常数。在等电点pH时,氨基酸在电场中,不向两 极移动,并且绝大多数处于兼性离子状态,少数可能解 离成阳离子和阴离子,但解离成阴、阳离子的趋势和数 目相等。
氨基酸的主要反应性质
氨基酸与茚三酮的反应
➢所有氨基酸及具有游离α-氨基的肽与茚三 酮反应都产生蓝紫色物质,只有脯氨酸和 羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质。
芳香族氨基酸的紫外吸收性质
半胱氨酸的氧化与二硫键的形成
二、蛋白质的结构
蛋白质的多样性
组成的多样性 大小的多样性 结构的多样性 功能的多样性
蛋白质组成的多样性
2014年暑期生物学奥林匹克 竞赛理论培训辅导
南京大学 杨荣武
一、氨基酸
氨基酸的结构通式
不同的侧链基团,不同的理化性质
蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸
蛋白质氨基酸,即标准氨基酸——在蛋白质 生物合成中,由专门的tRNA携带,直接参入 到蛋白质分子之中 ˗ 共22种:20种常见+2种不常见
非蛋白质氨基酸——不能直接参入到蛋白质 分子之中,或者是蛋白质氨基酸翻译后修饰 产物