2.细胞反应动力学
第2章 细胞反应动力学
2.1 细胞反应概论 2.2 细胞反应计量学 2.3 细胞反应动力学的非结构模型
2.4 底物消耗与产物生成动力学 2.5 细胞反应动力学的结构模型
2.6 描述细胞群体反应动力学的分离模型
总结
2.1 细胞反应概论
解决的两个基本问题:各种物料和能量的数量
比例关系(反应计量学)及反应过程速率(反应过 程动力学)的问题。
和实验数据的处理方法
速率-浓度关系:浓度随时间的变化速率与浓
度的关系
浓度与时间的关系
(1)、积分法求动力学参数
幂函数型动力学:
酶催化反应的M-M方程:
对细胞反应,描述整个反应体系至少要有两个微分 方程,一是细胞的生长,另一个是基质的消耗。需 要联立求解该微分方程组才能得到变量cX或cS的解, 其解将是很复杂的。
cs 2 K s cs Kcs
(2)产物抑制动力学
通常在细胞生长动力学表达式上乘以一个抑制 因子,该抑制因子与产物的浓度有关。
max
max
max
cS 1 K S cS 1 K IP cP cS exp K IP cP K S cS
(2)比速率
细胞生长比速率:
1 dcX 1 h c X dt
底物和氧的消耗比速率:
1 dcS 1 dcO2 1 qS 和qO2 h c X dt c X dt
产物和反应热的生成比速率:
qP 1 dcP 1 1 dHV kj h 和qHV c X dt c X dt g h
十六烷烃:
1mol底物中含有碳量为16×12=192g 转化为细胞的碳量为192×2/3=128g 根据反应计量方程式,则有:128=4.4×12c c=2.42 转化成CO2的碳量=192-128=64g=12e e=5.33 对N平衡:14b=0.86×14c=0.86×14×2.42 b=2.085 对H平衡:34×1+3b=7.3c+2d d=12.43 对O平衡:2a×16=1.2c×16+2e×16+16d a=12.427
max
cS K S cS
初始底物浓度过高而造成细胞生长过快的 动力学方程:
max
cS K S K S 0 cS 0 cS
其他的经验模型:
J Monod:
1 K Ks
m=0
n=2
max
max
C Teissier: K H
1 m=0 n=1 Ks
4、稳定期动力学
dcX kd c X 0 dt
dcX 1 c X max dt c X ,max c X
5 细胞反应动力学参数的估算 动力学实验的目的:确定反应速率、确定动
力学参数、确定动力学参数与反应条件
方程合适、参数正确:实验设备,实验方法
c 1 exp( s ) KS
n max s n s
cs cs K s
Moser:K n n
Ks
m=1-1/n n=1+1/n
c /( K s c )
max cs /( K s cX cs )
K D E Contois: 1 K c ) ( S X
10YATP / S
Ykj
mX
Q
(5)得率系数与计量系数
YX / S MX c MS
MX c MO a MP d MS
YX / O
YP / SYX Fra bibliotek S MX v M X S
1 1 r1
r2
[例2-1] 假设通过实验测定,反应底物十六烷烃和 葡萄糖中有2/3的碳转化为细胞中的碳, (1)计算下述反应的计量系数 十六烷烃:
葡萄糖: 1mol底物中含有碳量为72g 转化为细胞的碳量为72×2/3=48g 根据反应计量方程式,则有:48=4.4×12c c=0.909 转化成CO2的碳量=72-48=24g=12e e=2 对N平衡:14b=0.86×14c b=0.782 对H平衡:12+3b=7.3c+2d d=3.854 对O平衡:6×16+2×16a=1.2c×16+2e×16+16d a=1.473
1 c b d p 4a
s
s
s
b p
C: 1=c + d + f N: b=cδ + dz
例:葡萄糖为基质进行面包酵母(S.cerevisiae)培养, 培养的反应式可用下式表达,求计量关系中的系数 a,b,c,d.
2.2.2 细胞反应过程的得率系数 (1)对底物的细胞得率YX/S
CS0<<KS时:
CX= CX0=常数时: CS0>>KS时:
(2)、微分法求动力学参数
幂函数型动力学:
rs k r cs
n
ln rs ln kr n ln cs
细胞反应:
max
cS K S cS
2、无抑制的细 胞生长动力学
(1)Monod方程:(指数期和减数期)
max
cS K S cS
注意:
(1)Monod是基于以下假设
细胞的生长为均衡生长:细胞的浓度
培养基中只有一种生长限制性底物
细胞的生长为简单的单一反应,细胞 得率为常数
(2)仅适用于细胞生长较慢和细胞密度较 低的环境下
YX / S 生成细胞的质量 m X 消耗底物的质量 mS
微分细胞得率YX/S = rX/rS c c Xo 总细胞得率YX / S Xt cSo cSt
YX / O YP / S 生成细胞的质量 m X 消耗氧的质量 mO 生成代谢产物的质量 mP 消耗底物的质量 mS
m=0 n=2
d(
Konak提出的普遍形式:
max )
dcs
K(
m n ) (1 ) max max
(2) 多底物Monod方程(双底物)
cS 1 cS 2 累加动力学 max, max, 1 2 K1 cS1 K 2 cS 2
cS1 cS 2 相互影响动力学 max ( )( ) K1 cS 1 K 2 cS 2
总细胞得率YX / S
rX
c Xt c Xo cSo cSt
cS dcX c X max cX dt K S cS
rX max cS 0 1 YX / S
c X c X 0
1
K S cS 0
YX / S
c X c X 0
cX 1 cX cX
max
讨论:
max
cS K S cS
rX max cS cX KS
(1)cS << KS时:
cS KS
(2)cS >> KS时:
max
rX max c X
(3)cS 处于上述两者之间:
max
cS K S cS
cS dcX rX c X max cX dt K S cS
cS 1 c P K S cS cP ,max
2.3.4 细胞不同生长阶段的动力学特性
1、延迟期动力学
max
cS K S cS
t 1 e tL
2、无抑制的细 胞生长动力学(指数期和减数 期)
(1)Monod方程:
(2)对碳的细胞得率YC
YC 生成细胞量 细胞含碳量 m X X X YX / S 消耗底物量 底物含碳量 mS S S
(3)宏观得率和理论得率
YX / S m X mX mST mSG mSR
Y
*
X /S
mX mSG
CO2产生速率 RQ O2消耗速率
还原度(γ):在一化合物中,任何元素的还 原度等于该元素的化合价。细胞的还原度近 似为一常数。
有单一胞外产物:
CH m O n aO 2 bNH 3 cCH α Oβ N δ dCH x O y N z eH 2O fCO 2
细胞: γb=4 + α - 2β - 3δ 底物: γs=4 + m - 2n 产物: γp=4 + x - 2y - 3z 有效电子平衡方程: γs - 4a=cγb + dγp
YX / O M X c 91.34 0.909 1.76 MO a 32 1.473
2.3 细胞反应动力学的非结构模型
2.3.1 细胞生长动力学的描述方法 细胞体系的特点:多相、多组分和非线性 1、模型的简化
(1)细胞反应动力学是对细胞群体的动力学行为的 描述,而不是对单一细胞进行描述。 (2)确定论模型(不考虑细胞之间的差别,而是取 其性质上酌平均值)和概率论模型(考虑每个细胞 之间的差别)
(4)对能量的细胞得率YC
YATP YX / S M S m X g / mol n ATP YATP / S
YX / S
YX / S
10YATP / S
Ms
Yave
X M s 10YATP / S S YX / S 细胞质量 g / mol 底物的有效电子数 Yave / S
2.1.2 物质的跨膜输送
简单扩散:扩散速率与膜两侧的浓度差成正比 促进扩散:扩散速率与膜两侧的浓度差不成正比;要求细 胞提供载体蛋白来促进跨膜输送
主动输送:逆着浓度差的方向进行,除了要借助于载体蛋 白外,还要消耗细胞的代谢能。