有双△Ct法，你是要相对定量吗？我也做。

用的是delta-deltaCt法。

有一种算法是：
把内参的Ct求均值，比如得到a，再把目的基因每一个Ct减去a，就得到三个△Ct了，然后分别算三个的2e-△Ct，得到相对数共3个，然后就用这个来算标准差
具体比较倍数才是两次△Ct，相对数不用
pumpkin236(站内联系TA)
Originally posted by 三磷酸腺苷at 2011-03-27 17:03:03:
有一种算法是：
把内参的Ct求均值，比如得到a，再把目的基因每一个Ct减去a，就得到三个△Ct了，然后分别算三个的2e-△Ct，得到相对数共3个，然后就用这个来算标准差
具体比较倍数才是两次△Ct，相对数不用
我还是不太明白。

为什么这点---得到三个△Ct了，然后分别算三个的2e-△Ct。

2-△△Ct不是最后一步才用嘛。

我现在是这样算的，△Ct=目的均值-内参均值。

△△Ct=加药组的△Ct-正常组△Ct。

然后2 -△△Ct。

得到加药组相对于正常组的表达量。

但是，我不太明白每组的SD怎么求。

我是参照这篇文献的算法，但是他算SD我没太看懂。

Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-
Time Quantitative PCR and the 22DDCT Method
文献里他给了例子，就是表一。

你帮忙看下她的SD是怎么算的。

谢谢了
三磷酸腺苷(站内联系TA)
Originally posted by pumpkin236 at 2011-03-27 18:15:56:
我还是不太明白。

为什么这点---得到三个△Ct了，然后分别算三个的2e-△Ct。

2-△△Ct不是最后一步才用嘛。

我现在是这样算的，△Ct=目的均值-内参均值。

△△Ct=加药组的△Ct-正常组△Ct。

然后2 -△△C ...
:sweat::sweat::sweat::sweat::sweat:
其实，所有实验都要重复3次才有个SD，因此你的每次独立实验得出来的相对于对照组的倍数，就有3个值了，就可以再求均数标准差
如果你想知道每次独立实验复孔之间的均数标准差，就不要把复孔的值求均值再减去内参均值了，每一个复孔单独一个值就和内参的均值比较归一化即可
………………我发现一次过这么多文件鸭梨很大…………我表示想偷懒……
cxfans(站内联系TA)
2－△△CT我找了原文献你要我可以给你
pumpkin236(站内联系TA)
Originally posted by cxfans at 2011-03-27 22:28:51:
2－△△CT我找了原文献你要我可以给你
我也有。

但是还是不懂怎么处理SD
pumpkin236(站内联系TA)
Originally posted by 三磷酸腺苷at 2011-03-27 21:08:28:
:sweat::sweat::sweat::sweat::sweat:
其实，所有实验都要重复3次才有个SD，因此你的每次独立实验得出来的相对于对照组的倍数，就有3个值了，就可以再求均数标准差
如果你想知道每次独立实验复孔之间的均 ...
你说的意思我貌似明白了。

但是有一个地方你是不输入错了。

-----（把内参的Ct求均值，比如得到a，再把目的基因每一个Ct减去a，就得到三个△Ct了，然后分别算三个的2 e-△Ct，得到相对数共3个，然后就用这个来算标准差具体比较倍数才是两次△Ct，相对数不用）
其中每组得到三个△Ct，然后应该是求三个的2-ΔCT，然后再求sd。

而你说的2e-ΔCT是为
什么呢。

三磷酸腺苷(站内联系TA)
啊……是酱紫的
e是表示后面的为指数~~也有人写成^。