ssr标记原理
SSR标记,即简单重复序列标记,是一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术。
它利用了DNA序列中的简单重复序列,这些重复序列通常由1-6个碱基组成,形成长串重复。
由于这些重复序列在不同个体间的数量存在差异,因此能揭示比其他标记技术更高的多态性。
SSR标记的基本原理是,根据微卫星序列两端互补序列设计引物,通过PCR反应扩增微卫星片段。
由于核心序列串联重复数目不同,能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物。
将这些产物进行凝胶电泳,根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。
SSR 标记具有一些优点,如一般检测到的是一个单一的多等位基因位点、微卫星呈共显性遗传,可鉴别杂合子和纯合子、所需DNA量少等。
在采用SSR技术分析微卫星DNA多态性时,必须知道重复序列两端的DNA序列的信息。