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质粒提取及酶切鉴定


了解DNA限制性核酸内切酶酶切 鉴定原理
质粒提取原理
质粒的提取主要是利用共价闭合环状质
粒与线性染色质在拓扑学上的差异:在
碱性环境中,线性的大分子细菌染色体
DNA变性,而共价闭环质粒DNA仍为自然
状态;

溶菌酶可破坏菌体细胞壁,十二烷基硫酸钠 (Sodium dodecyl sulfate, SDS)可使细胞 壁裂解。细菌经溶菌酶和阴离子去污剂(SDS) 处理后,细菌DNA缠绕附着在细胞壁碎片上, 离心时易被沉淀出来,而质粒DNA则留在上清 液中。再经酒精沉淀、洗涤处理,可得到质 粒DNA。
Ⅱ型酶识别序列特点— 回文结构(palindrome)
GGATCC CCTAGG
切口 :平端切口、粘端切口
HindⅡ
GTCGAC CAGCTG
Bam HⅠ
GGATCC CCTAGG
GTC GAC CAG + CTG
G + GATCC G CCTAG
平端切口
粘端切口
钝性末端
粘性末端
掌握质粒DNA提取的原理与方法



(5)向上清液中加入等体积苯酚/氯仿,震荡混
匀,13 000 r/min离心2 min,300 μL上清液转
移至新的离心管中。

(6)向上清液中加入等体积无水乙醇,混匀,室 温放置2 min。离心5 min,倒去上清乙醇溶液, 将离心管倒扣在吸水纸上,吸干液体。

(7)加入1 mL 70 %乙醇,震荡并离心, 13 000
分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ,基因工程技术中常用Ⅱ型 Ⅰ型酶具有限制和DNA修饰作用,且识别及切 割位点不同(下游100-1000bp) Ⅲ型酶具有限制和DNA修饰作用,识别及切割 位点不同(相距较近)
Ⅱ型限制酶特点
(1)识别及切割位点相同 (2)识别序列通常为4~8bp的回文结 构;
(3)切割可产生两类切口,三种末端。
Marker
质粒DNA过夜酶切
操作步骤(Methods)

分组:4人/组,每组提取两种质粒(空 载及重组质粒) 1.质粒的提取 (1)接种一个单菌落(single colony)

于5 mL含相应抗生素的LB培养基中, 37℃振荡培养至饱和状态(A600=0.4) 或过夜。(教师准备)

(2)取1.5 mL离心管一支,加入1.4 mL菌液, 13 000 r/min离心1 min去掉上清液。加入 150 μL 的溶液Ⅰ,充分混悬细菌,在室温 下放置10 min。 (3)加入200 μL新配制的溶液Ⅱ。加盖, 颠倒5次使之混匀。冰上放置5 min。 (4)加150 μL预冷的溶液Ⅲ,加盖后颠倒5 次混匀,冰上放置15 min。13 000 r/min离 心5 min,取400 μL上清液移入另一离心管 中。
具有自我复制功能。
带有抗性基因及表型识别等遗传性标记物 经改造后具有多克隆位点。
质粒 (plasmid)
特点
能在宿主细胞内独立自主复制;带有某 些遗传信息, 会赋予宿主细胞一些遗传性状
限制性核酸内切酶:
概念 ------基因工程的手术刀
是分子生物学研究中的一种工具酶, 能识别DNA的特异序列, 并在识别位点或 其周围切割双链DNA的一类内切酶。
实验一 质粒提取及酶切鉴定
P158
相关基础知识

基因工程(genetic engineering) 是指采用人工方法将不同来源的
DNA进行重组,并将重组后的DNA引
入宿主细胞中进行增殖或表达的过
程。
基因工程相关物质
目的基因 工具酶 载体

质粒

存在于细菌细胞内、染色体外、共价闭合的 小型环状DNA分子(covalent closed circular DNA)。
由于操作原因,提取的质粒可有三种结构: 线形、开环、闭环超螺旋。

Relaxed circle Linearized form
Super-coiled form
质粒DNA酶切鉴定的原理

与DNA分子量标准物(Marker)比较能
大概判断未知DNA的分子量

质粒DNA为环状,在酶切彻底的情况下
,DNA片段数与酶切位点数目相同
如:EcoRⅠ和HindⅢ的识别序列和切口是: EcoRⅠ:G↓AATTC
HindⅢ:A↓AGCTT
作用
与甲基化酶共同构成细菌的限 制 修 饰 系 统 ( restriction-
modification system),限制外源
DNA, 保护自身DNA。
分类
酶结构、作用、识别及切割特异性的不同
r/min离心2 min,倒去上清液,晾干,加入20
μL的 TE缓冲液,使 DNA完全溶解,待用。
2.质粒DNA的酶切鉴定

取一只1.5mL EP管加入以下试剂: 酶切混合液:15 μL 质粒DNA:5 μL
混匀后,置37 ℃过夜保温,反应源自结束后4 ℃放置备用。
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