精品课件
药物名称
检测靶标
检测内容
吉非替尼/ 厄洛替尼
EGFR
西妥昔单抗
K-ras，Braf基因突变 基因突变伊马替尼C-Kit
基因突变
指导肿瘤靶向治疗的靶标
检测结果 预测内容
野生型 突变型 野生型 突变型 野生型 突变型
耐药 敏感 敏感 耐药 耐药 敏感
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基因多态性检测与药物代谢毒性 (UGT1A1,CYP,DPD)
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药物名称 奥沙利铂/卡铂/顺铂
检测靶标 ERCC1/BRCA1
检测内容 mRNA表达水平
5-FU/培美曲赛
紫杉醇/多西紫杉醇 /长春瑞滨
替莫唑胺
TS
mRNA表达水平
STUBB3,STMN1 mRNA表达水平
MGMT
mRNA表达水平
化疗药物与检测靶标 阿霉素/表柔比星
TOPOⅡa
mRNA表达水平
1 背景介绍之HNPCC与MMR MSI
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实验室检测流程
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检测名称
MSI（5个位点） MLH1,MSH2,MSH6 基因突变检测（35个外显子）
热点突变检测
HNPCC检测项目
检测技术
PCR+片段分析法 DNA测序 DNA测序
临床意义
HNPCC风险评估 明确是否检测MMR突变
HNPCC鉴别诊断 确定突变位点，评估家族中高危个体
阿霉素/表柔比星
TOPOⅡa
化疗药物与检测靶标
吉西他滨
RRM1
检测内容 mRNA表达水平 mRNA表达水平 mRNA表达水平 mRNA表达水平 mRNA表达水平 mRNA表达水平
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ERCC1表达与铂类药物疗效相关 的临床数据
ERCC1阴性患者，能从铂类辅助化疗中获益.
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BRCA1/2表达与铂类药物疗效相 关的临床数据
风险
确定家族中是否存在已知的突变
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检测名称
MSI检测 MLH1,MSH2,MSH6
基因突变检测
标本热要点突求变检测
标本要求
病理蜡块一份（或白片10片），外加5ml抗 凝外周血，4度运达
病理蜡块一份（或白片10片），常温运达
5ml抗凝外周血，4度运达
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"We can look at tumors for changes at the DNA, RNA and protein levels. It certainly gives us a way of looking at what is happening inside a
BRCA1过度表达 铂类耐药的预测因子
抗微管类药物的敏感因子
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TS高表达影响氟类和培美曲塞药效
• 低TS mRNA水平的肿 瘤患者接受氟类化疗的 效果较好，中位生存期 较长。
• TS低表达的患者对培 美曲赛的疗效好。
Shirota Y et al. J Clin Oncol. 2001;19:4298-304
CYP3A4*4 ,MDR1
靶向药物
紫杉醇/多西紫杉醇/长春瑞滨 伊立替康 吉西他滨 培美曲赛 吉非替尼/厄洛替尼 西妥昔单抗 贝伐单抗
TUBB3,STMN1
CYP8*3 UGT1A1*6, UGT1A1*28 RRM1 CDA TS
EGFR (Exon19/20/21) K-ras , B-raf EGFR VEGFR
• 实现血浆中来自肿瘤的微量DNA的 突变检测。
• 目前所做的临床实验中，血浆EGFR 检测结果与其手术标本之间的整体符 合率符合率达到91.25%。
• 是临床上不能手术、也同时不愿 穿刺患者的替代检测方案；也可 获 得性耐药进行预先检测。
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突变检测技术之一 DNA测序
国际公认的分子检测金标准 有明确的物价收费 实验流程较复杂，需要大型仪器
2. Ramon C et al. Clin Cancer Res. 2008;14:811-6.
3. Lunardi G et al. J Clin Oncol. 2009; 27: 555.
4. Fasching PA et al. Breast Cancer Res Tr. 2008;112:89-
98.
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基因表达检测（mRNA表达） (ERCC1\BRCA1\TUBB3\TS)
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相关肿瘤
药物名称
检测靶标
检测内容
检测结果 预测内容
结直肠癌
贝伐单抗
高 VEGFR mRNA表达水平
低
乳腺癌
高
曲妥珠单抗
HER-2
FISH/ mRNA表达水平
低
低
肝基癌 因表索达拉非检尼 测指pD标GFR（m靶RN向A表达药水平物） 高
检测内容
mRNA水平，2项
基因多态性，4项（女，6项）
基因多态性，1项 基因多态性，1项 mRNA水平，1项 基因多态性，2项 mRNA水平，2项 基因多态性，1项 基因多态性，2项 mRNA水平，1项 基因多态性，1项 mRNA水平，1项 基因突变，3项 基因突变，3项 mRNA水平，1项 mRNA水平，1项
疗效好 疗效差 疗效好 疗效差 疗效好 疗效差
HER2基因表达检测
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靶向药物 项目名称
样本
结果
疗效
关系
曲妥珠 单抗
HER2
乳腺癌（手术 /穿刺）
+ -
阳性疗效好
↑ ↓
采用RT-PCR方法替代FISH或免疫组化方法，临床准确率 达97%以上。
主要特点： • 客观，不用人为观察。 • 时间短，整个检测60分钟左右完成。 • 高通量，一次可以检测6人份。
对药物没有期望的反应
SNP 谱 A
SNP 谱 A 的人对药物 有期望的反应
SNP 谱 B
SNP 谱E
SNP 谱 C
SNP 谱D 22
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药物代谢与SNP检测
化疗药物在体内经过吸收、代谢、分布和清除，通过其活性物质对治疗靶点的直接 攻击而发挥作用，整个过程需要多种蛋白质/酶的共同参与和协同作用。
CYP19A1 rs4646（G>T）SNP是乳腺癌患者接受芳香化酶抑制剂治 疗疗效的有效预测指标。
如图一项对乳腺癌患者的临床研究显示：
CYP19A1基因rs4646突变的患者使用芳香化
酶抑制剂药物疗效明显优于野生型患者
CYP1（9Ap1<0.多000态1）性1。影响芳香化酶抑制剂疗效
参考文献
1. Ian ES et al. N Engl J Med. 2003;384:2431-42.
肿瘤分子诊断服务介绍
标准化用药
标准化用药
精品课件
个体化用药
个体化用药
标准疗法1 标准疗法2 标准疗法3
2
精品课件
肿瘤药物与相关靶标
精品课件
如何实现个体化用药？
分子分型
药物疗效
4
精品课件
目前的服务
肿瘤 感染性疾病 新生儿筛查
目前的平台
目前的客户
TaqMan-ARMs 测序 实时定量PCR qPCR-HRM
1 背景介绍之HNPCC与MMR MSI
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–研究显示， 约有86%-95%的HNPCC具有MSI特征， 而散发型大肠癌中只有16%。 MSI所产生的遗传不稳定性将加速恶性肿瘤的发生。 –1997年美国NCI (national cancer institution)将MSI确定为检测和筛选HNPCC的重要方法之一，并推荐将BAT26、BAT25、D2S123、 D5S346和D17S250 5个位点作为检测HNPCC的位点。
色表示该样本发生突变，蓝色表示未突变，蓝色横直线为阴性对照。左图显示2个样本 发生了EGFR突变；右图显示4个样本发生了KRAS突变。
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精品课件
qPCR-HRM用于血浆微量突变检测
血浆EGFR突变检测： 18号外显子：无突变 19号外显子：突变 20号外显子：无突变 21号外显子：无突变
附图
主要特点：
= SNP variations in DNA
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精品课件 8/7/2020
个体的SNP 谱
SNP 谱A SNP 谱B SNP 谱C
SNP 谱F SNP 谱E
SNP 谱D
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精品课件 8/7/2020
SNP 谱有助于确定药物的疗效和副作用
乳腺癌病人
个体的SNP 谱可以分成不同的类型
对药物有期望的反应
耐药位点检测T790M
EGFR E19 / E21敏感突变
适合使用TKI药物治疗
精品课件
K-RAS突变检测
精品课件
BRAF-VB6RA0F0E检测
NCCN
肿瘤学临床实践指南（中国版） 2010第一版
2010年NCCN《结直肠癌临床实践指南》指出： K-ras基因为野生型而同时具有BRAF V600E突变的患者，靶向EGFR抗体治疗无效。
精品课件 8/7/2020
最常见的基因多态性 SNP
单核苷酸多态性（SNP）是最常见的基因变异
绝大多数人群
至少1%的人群
G to C
共有序列
变异的序列
SNP 位点
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精品课件 8/7/2020
为什么 SNPs 重要?
个体 1
个体 2
基因 A
基因 B
SNP标志基因 A
SNP 可能使基因 B 产生变 异的蛋白质分子
吉西他滨
RRM1
mRNA表达水平
检测结果 预测内容
高