PubMed数据库检索系统
Author address [AD] Author [AU] Language [LA] Journal Title [TA] EC/RN Number [RN] MeSH Major Topic [MAJR] MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH] PubMed检索方式 [PT] Text Words Publication Type [TW] Title [TI] Title/Abstract PubMed主要提供以下几种检索方式:[TIAB]
(五)引文匹配
提供通过已知的文献线索,查询特定文献的 摘要、作者、文献题目等信息。包括单篇引文匹配 和成匹引文匹配两个界面。
检索Tang BK在《Biochemical Pharmacology》 杂志第29卷第14期上发表的文章 。 要求: 用单篇引文匹配检索。
2 . 限定检索(Limits)
可以进行各种字段限定及其它的限定检索。以进一步 缩小检索范围。 包括:作者限定;期刊限定;文献发表时间;文献研 究对象、性别年龄划分;文献语种;数据库子段;文献类 型以及拟检索字段限定等。
进 行 限 制 后 只 能 检 索 medline 中 的 内 容 , “ in
PubMed接入
网址: /pubmed
/pubmed
1. 简单检索( Go)
在此可以进行任意词语的检索。如自由词、人名
、主题词、期刊名称等,系统会进行自动转换和匹配 ,并显示检索结果。 简单检索界面允许实现检索词的逻辑组配、截词 (*) 、字段限定和短语等检索,但逻辑组配需用大写( AND;OR;NOT)。
process” and “supplied by publisher”因还没有进 行字段制作,不能检索到。
Limits一旦进行限定,一直存在,除非取消。
举例
查找近两年有关子宫内膜异位症的综述文献。 ( endometriosis) 查找近10年发表在“Obstetrics and gynecology” 杂志上的有关子宫内膜异位症的临床试验文献。
PubMed数据库检索系统
耿波 青岛大学医学院图书馆
一.历史与背景
INDEX MEDCUS
MEDLINE (MADLARS on line) 美国国立医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)建立并维护的一个大型的医学文献数据库。 属于MADLARS 检索系统中使用频率最高的数据库。
MEDLINE CD
MEDLINE WEB ——PubMed
一、PubMed简介
(一) 数据库建立和维护
美国国立医学图书馆下属的生物技 术信息中心( National Center for Biotechnology Information , NCBI)建立 并维护。 文献类型:期刊论文、综述、以及与 其他数据资源链接。 特点:提供原文获取服务
点击 search PudMed 按扭。系统把检索词转 PudMed检索系统自动进行检索。
举例
P16在肝癌中的表达
P16和P53在肝癌中的表达
练习
检索近两年重点研究“前列腺癌诊断” 的文献 。Prostate cancer 要求:主要主题词检索 ;将检索时间限定在 近两年 。
(三)临床咨询。
是一个关于临床治疗、诊断、病因和预后四个方 面的临床文献查询界面。
Term Mapping)功能。在基本检索状态下,如
果输入的检索词是不加限制的,PubMed利用该
功能,实现MeSH、刊名、短语的转换和著者的 自动转换。点击“Details”可查看转换ห้องสมุดไป่ตู้果。 转换词表: MeSH转换表 刊名转换表
短语列表
著者索引表
三、PubMed检索界面
1.PubMed检索主界面——基本检索界面
该检索界面提供预览和索引两种功能。 Preview :显示所输入检索式的检索记录数(检索历
史 );
Index:即利用数据库中索引词表进行检索。该界面 可以对不同的字段进行索引和检索,并提供逻辑组配检 索功能。
举例
1、 Preview 功能演示:endometriosis 2、Index:down’s syndrom(e) down syndrom(e) 3、p16 在肝癌中的表达
举例
1、bad breath 2、bad breath causes 3、“bad breath” 4、lung cancer AND smok*
查找作者
输入作者的姓(last name)和名(first initial), 中间不用标点符号。
例:alving c 结果包括Alving CR Alving CJ 等
举例:检索癫痫(epilepsy)的治疗方面的文献。
(四) 期刊浏览检索。
查询特定期刊及特定期刊论文的检索界面。 点击PubMed左面的Journals database按扭。系 统转到期刊数据库首页界面。 期刊数据库,可通过刊名全称、刊名简称 [Medline缩写格式]、ISSN号、刊名中的单个或 若干个词来查找特定的期刊。 点击界面中部的links to full-text web sites将列 出与PubMed有全文链接的期刊刊名,按字顺排 列。可查找期刊中的文献。
系统同时还显示检索的限定。如主要主题词限定;限制 下位词扩检。
系统同时还显示其树状结构表。
用liver neoplasms选择副主题词radiotherapy、therapy, 点击send to 下拉菜单中的Search box with and,出现 search PudMed 按扭,及检索策略。(见后页)
文献标记中除了有PMID 号和MEDLINE UI号 外,还 这部分文献记录中只有 注有[PubMed- indexed for PubMed识别码〔PMID〕, MEDLINE] 的说明。 (二)PubMed数据库来源 另外还有〔PubMed – in process〕的说明。
1.MEDLINE
练习
1、在基本检索界面分别输入下列词语并点
击“Details”察看结果:
bad breath,bad breath causes,“bad breath”,lung cancer AND smok*
2、检索“p16 在肝癌中的表达”方面的文 献 限定 人类,五年,免费全文,英文中文
3 . 索引词表检索(Preview / Index)。
2. 主题词检索界面——MeSH Database 3. 期刊检索界面——Journals Database 4. 临床咨询——Clinical Queries 5. 引文匹配——Citation Matcher(包括单篇 引文和多篇引文匹配两种形式)
四、PubMed检索
(一)PubMed检索主界面—— 基本检索界面 (P273) PubMed主页面是PubMed的基本检索界 面,可以进行简单检索、限定检索、索引检 索;并提供察看检索历史、检索结果预览和 输出等功能。
由于PubMed与生物医学文献出版商联合,使其作为 检索引用文献以及链接这些出版商站点,获取全文数据的 一种工具。 1. 引文链接 2. 全文链接 有收费全文、免费全文两种形式。 免费全文:出版商直接提供; PMC(PubMed Center)中心提供
PubMed的自动转换
PubMed提供词语的自动转换(Automatic
用自由词和主题词检索.
使用该功能可选择规范化主题词、副主 题词、查看词义注释、浏览树状结构表 等 ,可执行主题词检索,可以提高检索 效率。 点击PubMed界面左边的MeSH Database 按扭,进入 主题词检索界面。在MeSH Database的检索框中,输入检索词,如果 不是MeSH词,系统将提供同义或近义 MeSH给于选择,同时显示MeSH树。
Medline 数据库收录了自1966年以来70多个国家40多 个语种的约4,300多种生物医学期刊的题录及文摘, 其中80%以上为英文文献,75%--85%含有文摘。
MEDLINE包括三种索引: 《医学索引》(Index Medicus)、 《牙科文献索引》(Index to Dental Literature)、 《国际护理索引》(International Nursing Index)。 MEDLIN数据库涉及内容包括:基础医学、临床 医学、护理学、口腔科学、兽医学、卫生保健、 营养卫生、职业卫生、卫生管理等。
这部分文献记录中只有 主要收录1966年至今的文献。 PubMed识别码〔PMID〕,另 外还有〔PubMed - as 2. PreMEDLINE supplied by publisher〕的 说明。 主要保存处于加工阶段的文献
(PubMed-In process) 3.直接提供的其它文献记录
点击MeSH Database按扭,进入主题词检索界面
例 :主题词检索界面的输入框内输入liver cancer,点击 GO按扭,系统提示liver cancer不是MeSH词,规范主题 词应该是liver neoplasms。
点击主题词liver neoplasms,显示副主题词,可 供选择。
二、PubMed检索功能
1.主题词检索。
2.自由词检索。
3.索引词表检索。
4.字段限定检索。
5.组配检索。 注意:布尔组配符号AND、OR、NOT 需 大写,顺序自左到右。 6.截词检索 transplant* 7. 强制检索 短语检索 “liver cancer”
PubMed引文和期刊全文查询功能
举例:在检索框中输入“science”
查找某期刊中的文献
1、基本检索界面下,刊名可输入全称; 或MEDLINE认可的标准缩写形式;以及 ISSN。 如 Molecular biology of the cell